UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y41C4A.11Y41C4A.110chrIII 11,721,632Y41C4A.11 encodes a divergent paralog of F38E11.5, the beta' (beta-prime) subunit of the coatomer (COPI) complex; unlike F38E11.5, Y41C4A.11 has no obvious function in mass RNAi assays.
2F19C7.5F19C7.5n/achrIV 4,596,309
3F35E8.1F35E8.1n/achrV 15,904,615contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
4Y47H9A.1Y47H9A.1n/achrI 11,624,828contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
5Y48A6B.8Y48A6B.8n/achrIII 11,028,225contains similarity to Interpro domains IPR003547 (Serine/threonine protein kinase, yersinia), IPR013022 (Xylose isomerase-like, TIM barrel)
6F16H6.3F16H6.3n/achrV 18,196,549contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
7K06B4.3K06B4.3n/achrV 15,672,799contains similarity to Saccharomyces cerevisiae mRNA binding protein; SGD:YPR042C
8cyp-33C6F41B5.7n/achrV 2,248,474C. elegans CYP-33C6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
9R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
10F28C10.4F28C10.4n/achrX 539,044
11sri-36F33H12.5n/achrII 2,584,688C. elegans SRI-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12F55E10.7F55E10.7n/achrX 8,349,739contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13Y7A5A.5Y7A5A.5n/achrX 15,786,599contains similarity to Pseudomonas aeruginosa NosL protein.; TR:Q9HYK8
14Y43F8A.3Y43F8A.3n/achrV 19,379,196contains similarity to Pfam domain PF07859 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR017157 (Arylacetamide deacetylase), IPR013094 (Alpha/beta hydrolase fold-3)
15R11.2R11.2n/achrX 16,184,757contains similarity to Homo sapiens Chromosome-associated kinesin KIF4A; ENSEMBL:ENSP00000262784
16D2045.5D2045.5n/achrIII 10,468,691contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
17ZC190.8ZC190.8n/achrV 8,687,699contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
18F37E3.3F37E3.3n/achrI 6,430,598contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
19F54D12.7F54D12.7n/achrII 1,383,599contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
20F58G1.9F58G1.9n/achrII 12,924,971contains similarity to Homo sapiens Adapter-related protein complex 4 mu 1 subunit; SW:O00189
21clec-236Y70C5C.5n/achrV 16,720,176C. elegans CLEC-236 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
22ZK180.2ZK180.2n/achrIV 4,504,345contains similarity to Pfam domain PF01094 Receptor family ligand binding region contains similarity to Interpro domains IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor), IPR000923 (Blue (type 1) copper domain)
23C29F9.5C29F9.5n/achrIII 118,236contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR003101 (Coactivator CBP, KIX), IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
24tag-312C33D12.6n/achrX 3,057,313C. elegans TAG-312 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF00036 (EF hand) (2), PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR011992 (EF-Hand type), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras), IPR006689 (ARF/SAR superfamily), IPR001854 (Ribosomal protein L29)
25F35H12.1F35H12.1n/achrX 936,580contains similarity to Interpro domain IPR015649 (Schwannomin interacting protein 1)
26C01B12.4C01B12.4n/achrII 7,948contains similarity to Interpro domain IPR005178 (Protein of unknown function DUF300)
27C14A4.13C14A4.13n/achrII 10,619,389contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28lact-1F46H5.8n/achrX 7,259,241lact-1 encodes a beta-lactamase domain-containing protein.
29ugt-43F01D4.1n/achrIV 10,466,113C. elegans UGT-43 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
30K02B12.6K02B12.6n/achrI 8,519,194contains similarity to Schistosoma mansoni Putative eggshell protein (Fragment).; SW:P08016
31daf-7B0412.2n/achrIII 812,789daf-7 encodes a member of the transforming growth factor beta superfamily that affects dauer larvae formation in a TGF-beta-mediated pathway and also affects egg laying; expressed in the ASI neurons.
32nas-32T02B11.7n/achrV 897,042C. elegans NAS-32 protein; contains similarity to Pfam domains PF01549 (ShK domain-like) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
33C43G2.4C43G2.4n/achrIV 6,562,982contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
34T20H4.2T20H4.2n/achrIII 7,242,074contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
35F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
36R13A1.5R13A1.5n/achrIV 7,191,489
37nlp-25Y43F8C.1n/achrV 19,607,891C. elegans NLP-25 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000817 (Prion protein)
38Y41C4A.1Y41C4A.1n/achrIII 11,648,712contains similarity to Oryza sativa Putative aspartate kinase.; TR:Q851Z6
39F14E5.3F14E5.3n/achrII 8,436,197contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
40W01B6.4W01B6.4n/achrIV 10,075,527contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
41Y47H9B.2Y47H9B.2n/achrI 11,745,783contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
42ZK795.2ZK795.2n/achrIV 12,557,986contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
43twk-6F17C8.5n/achrIII 4,743,772twk-6 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-6 may, however, function redundantly with other TWK channels; TWK-6 is expressed in the hypodermis.
44Y7A9A.1Y7A9A.1n/achrIV 16,199,192contains similarity to Pfam domain PF01019 Gamma-glutamyltranspeptidase contains similarity to Interpro domain IPR000101 (Gamma-glutamyltranspeptidase)
45C55C3.3C55C3.3n/achrIV 5,686,761contains similarity to Trypanosoma cruzi Trans-sialidase, putative.; TR:Q4E0H9
46ZK418.6ZK418.6n/achrIII 7,076,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47Y54E2A.5Y54E2A.5n/achrII 14,756,797
48W03A5.2W03A5.2n/achrIII 5,407,000W03A5.2 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:19580) (GGCX; OMIM:137167), which when mutated leads to disease.
49BE10.3BE10.3n/achrIII 12,810,237contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
50Y106G6E.1Y106G6E.1n/achrI 10,199,352contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)