UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y40D12A.2Y40D12A.20chrIII 6,613,768contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3T25B6.2T25B6.2n/achrX 9,036,480T25B6.2 encodes two isoforms of a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T25B6.2 is orthologous to Ac-mep-1, a gut luminal neprilysin which is specifically expressed in the adult life stage of Ancylostoma caninum hookworms, and whose protein product is localized to the microvilli of the gastrointestinal tract, suggesting a role in digestion.
4T16G1.6T16G1.6n/achrV 12,936,341contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
5ugt-8H23N18.3n/achrV 4,904,931C. elegans UGT-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
6ugt-46B0310.5n/achrX 528,055C. elegans UGT-46 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
7C14C6.5C14C6.5n/achrV 537,024contains similarity to Pfam domains PF04942 (CC domain) , PF01549 (ShK domain-like) (2)contains similarity to Interpro domains IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
8F35D11.4F35D11.4n/achrII 4,603,738contains similarity to Pfam domain PF01928 CYTH domain contains similarity to Interpro domains IPR008172 (Adenylate cyclase), IPR008173 (Adenylyl cyclase CyaB)
9R07H5.8R07H5.8n/achrIV 11,210,138contains similarity to Pfam domain PF00294 pfkB family carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domains IPR011611 (Carbohydrate/purine kinase), IPR002139 (Ribokinase), IPR001805 (Adenosine kinase), IPR002173 (Carbohydrate/puine kinase, PfkB, conserved site)
10amt-4C05E11.5n/achrX 4,567,404amt-4 encodes a member of the ammonium transporter protein family.
11eif-3.DR08D7.3n/achrIII 8,970,522eif-3.D encodes the C. elegans ortholog of the translation initiation factor 3 subunit d (eIF3d/Moe1); by homology, EIF-3.D is predicted to function as part of the eIF3 translation initiation complex but also as part of a Ras-mediated pathway that regulates mitotic spindle formation; in C. elegans, large-scale RNAi screens indicate that eif-3.D is required for embryonic and germline development, locomotion, and normal rates of post-embryonic growth; in the early embryo, eif-3.D is specifically required for the fidelity of meiotic divisions and normal pseudocleavage; eif-3.D function is likely conserved, as expression of eif-3.D in Schizosaccharomyces pombe can rescue the mitotic spindle and growth defects associated with moe1 mutant cells; to date, eif-3.D expression has been reported in anterior neurons and the pharynx, beginning at late stages of embryogenesis.
12gfi-1F57F4.3n/achrV 6,396,213gfi-1 encodes a protein that contains 21 ET modules; interacts with unc-68 in yeast two-hybrid assays.
13K07C5.4K07C5.4n/achrV 10,351,696contains similarity to Pfam domains PF01798 (Putative snoRNA binding domain) , PF08060 (NOSIC (NUC001) domain) , PF08156 (NOP5NT (NUC127) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012974 (NOP5, N-terminal), IPR005819 (Histone H5), IPR002687 (Pre-mRNA processing ribonucleoprotein, binding region), IPR012976 (NOSIC)
14apy-1F08C6.6n/achrX 7,568,879C. elegans APY-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
15T25C12.3T25C12.3n/achrX 11,495,472contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR011162 (MHC classes I and II-like antigen recognition), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001304 (C-type lectin), IPR006582 (Region of unknown fuction MD, Caenorhabditis elegans), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
16mup-2T22E5.5n/achrX 6,409,410mup-2 encodes the muscle contractile protein troponin T ( TnT ) homologous to vertebrate and invertebrate TnT and contains an invertebrate- specific COOH -terminal tail; mup-2 affects embryonic body wall muscle cell contraction, sarcomere organization, cell positioning, regulated muscle contraction in larval and adult body wall muscle, epidermal morphogenesis, and is required for proper function of the hermaphrodite nonstriated oviduct myoepithelial sheath, proper growth, and fertility.
17Y76A2B.3Y76A2B.3n/achrIII 13,541,717contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
18F54F11.2F54F11.2n/achrII 13,512,057F54F11.2 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F54F11.2 has no clear orthologs in other organisms.
19ugt-13H23N18.1n/achrV 4,910,117C. elegans UGT-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
20F59A2.3F59A2.3n/achrIII 3,397,005contains similarity to Pfam domain PF02330 Mitochondrial glycoprotein contains similarity to Interpro domain IPR003428 (Mitochondrial glycoprotein)
21tba-4F44F4.11n/achrII 10,919,367tba-4 encodes a member of the alpha tubulin family that also includes tba-1, tba-2, and tba-3, and affects embryonic viability.
22K10C2.1K10C2.17e-68chrX 6,425,780contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
23ZK1025.2ZK1025.2n/achrI 11,450,904contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
24spl-1Y66H1B.4n/achrIV 381,542C. elegans SPL-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00282 (Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain) , PF00266 (Aminotransferase class-V) contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
25C05G5.4C05G5.4n/achrX 14,755,163contains similarity to Pfam domains PF00549 (CoA-ligase) , PF02629 (CoA binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR005811 (ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase), IPR005810 (Succinyl-CoA ligase, alpha subunit), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR017440 (ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase, active site), IPR003781 (CoA-binding), IPR016102 (Succinyl-CoA synthetase-like)
26F01F1.9F01F1.9n/achrIII 5,862,653contains similarity to Pfam domain PF02127 Aminopeptidase I zinc metalloprotease (M18) contains similarity to Interpro domain IPR001948 (Peptidase M18, aminopeptidase I)
27C15C8.3C15C8.3n/achrV 12,743,084contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
28nhx-2B0495.4n/achrII 7,692,262nhx-2 encodes a sodium/proton exchanger expressed in the apical membranes of intestinal cells; NHX-2 is required for normally high growth rates, and for propagation or maintenance of the germline, NHX-2 is thought to prevent intracellular acidification by catalysing the electroneutral exchange of extracellular sodium for an intracellular proton.
29gas-1K09A9.5n/achrX 15,588,527The gas-1 gene encodes a 49 kDa subunit of mitochondrial complex I that is required for oxidative phosphorylation, resistance to volatile anesthetics, fecundity, and normal lifespan; gas-1 is expressed in the nematode neuromuscular system; its subcellular distribution appears to be mitochondrial; drug effects on mutants versus wild-type indicate that gas-1 functions at least partially through presynaptic effects; gas-1 mutants have strongly reduced Complex I-dependent metabolism in mitochondria, while Complex II-dependent metabolism is conversely increased in mutants; gas-1 mitochondria look structurally normal.
30Y47H9C.1Y47H9C.1n/achrI 11,832,085contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
31F01D5.1F01D5.1n/achrII 13,997,179contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
32F55G11.2F55G11.2n/achrIV 12,968,338contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
33F28A10.6F28A10.6n/achrII 847,752contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
34C15C7.5C15C7.5n/achrX 3,151,795contains similarity to Oryctolagus cuniculus Trichohyalin.; SW:P37709
35egl-45C27D11.1n/achrIII 7,826,432egl-45 encodes a homolog of eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 10, that affects development of the HSNs that affect egg laying.
36VC5.1VC5.1n/achrV 7,102,942
37rpl-4B0041.4n/achrI 4,646,348rpl-4 encodes a large ribosomal subunit L4 protein.
38F58B4.5F58B4.5n/achrV 10,933,422contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
39ife-2R04A9.4n/achrX 382,059ife-2 encodes a translation initiation factor 4F, cap-binding subunit (eIF-4E); by homology, IFE-2 is predicted to function in cap-dependent mRNA translation initiation; loss of ife-2 activity in adult animals extends lifespan.
40K02G10.3K02G10.3n/achrX 4,675,475contains similarity to Rattus norvegicus Transmembrane protein 135.; SW:Q5U4F4
41K11D12.5K11D12.5n/achrV 5,030,085contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domains IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
42F32A5.3F32A5.39e-61chrII 7,234,327contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
43C26B9.5C26B9.5n/achrX 5,330,863contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
44Y49A3A.1Y49A3A.1n/achrV 14,349,107Y49A3A.1 encodes a homolog of choline/ethanolaminephosphotransferase choline phosphotransferase 1; Y49A3A.1 shares an operon with vha-13, and thus might be a previously undescribed V-ATPase component or ancillary protein.
45gst-5R03D7.6n/achrII 10,950,899gst-5 encodes a putative glutathione-S-transferase that inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
46F09B12.3F09B12.3n/achrX 15,096,564contains similarity to Pfam domain PF04916 Phospholipase B contains similarity to Interpro domain IPR007000 (Laminin A)
47dhs-28M03A8.1n/achrX 6,819,210dhs-28 encodes an ortholog of human 17-BETA-HYDROXYSTEROID DEHYDROGENASE 4 (HSD17B4; OMIM:601860, mutated in D-bifunctional protein deficiency), which contains a C-terminal SCP-2 sterol transfer domain; the deletion allele dhs-28(ok450) is superficially wild-type.
48col-126F54D1.2n/achrIV 11,263,837C. elegans COL-126 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000681 (Adrenergic receptor, beta 3), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
49C18H9.6C18H9.6n/achrII 6,701,053
50F54E2.1F54E2.1n/achrV 2,811,213contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)