UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-163Y39A1B.10chrIII 10,795,241C. elegans CLEC-163 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
2C52A11.3C52A11.3n/achrII 10,737,705contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
3F41D9.1F41D9.1n/achrX 8,380,568contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00566 (TBC domain) , PF02759 (RUN domain) contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR001452 (Src homology-3), IPR004012 (RUN), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3)
4T27F6.8T27F6.8n/achrI 12,498,624This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
5Y76A2B.6Y76A2B.6n/achrIII 13,552,896Y76A2B.6 encodes a ortholog of human CD36 antigen (OMIM:173510, mutated in platelet glycoprotein IV deficiency); Y76A2B.6 is needed for cell corpse engulfment in the germline and in the three-fold embryo, and for migration of the anterior arm of the gonad.
6W06B3.1W06B3.1n/achrX 12,015,209contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR004821 (Cytidyltransferase-related), IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)
7F14F8.9F14F8.9n/achrV 16,668,104contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
8F10C2.7F10C2.7n/achrV 12,055,113contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
9lgc-32T19D7.1n/achrX 674,438C. elegans LGC-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
10nas-10K09C8.3n/achrX 10,962,779nas-10 encodes an astacin-like metalloprotease.
11srxa-7C31A11.6n/achrV 16,308,625C. elegans SRXA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
12fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
13clec-214C50E3.1n/achrV 7,611,567C. elegans CLEC-214 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like)
14clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
15math-17C16C4.9n/achrII 1,880,205C. elegans MATH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
16ugt-54T25B9.7n/achrIV 10,763,022C. elegans UGT-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domains IPR002416 (Bacterial general secretion pathway protein H), IPR001546 (Pheromone A receptor), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
17sra-23T06G6.1n/achrI 12,704,070C. elegans SRA-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18C25D7.9C25D7.9n/achrV 15,065,202
19T04C9.2T04C9.2n/achrIII 5,992,002
20sre-41Y57A10B.5n/achrII 12,388,981C. elegans SRE-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
21R52.5R52.5n/achrII 2,109,416contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
22B0554.7B0554.7n/achrV 439,300contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
23tbx-9T07C4.6n/achrIII 10,340,812C. elegans TBX-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
24Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
25K07G5.3K07G5.3n/achrI 7,163,733contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
26srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27twk-40T28A8.1n/achrIII 13,487,791C. elegans TWK-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
28sri-14M01G12.1n/achrI 12,135,356C. elegans SRI-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29srd-48F17A2.9n/achrX 12,336,853C. elegans SRD-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30srh-214T20B3.4n/achrV 16,828,966C. elegans SRH-214 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31K07H8.5K07H8.5n/achrIV 8,272,091
32ncx-5Y32F6B.2n/achrV 10,488,232ncx-5 encodes a putative 4Na[+]/1Ca[2+],1K[+] exchanger, orthologous to human SLC24A1-5 and paralogous to NCX-4; NCX-5 is predicted to export free cytoplasmic Ca[2+] with low affinity but high capacity, being complemented by low-capacity/high-affinity Ca[2+] ATPase pumps such as MCA-1/-3; NCX-5 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-5 has no obvious function in mass RNAi assays.
33C55B6.4C55B6.4n/achrX 7,187,869
34F21H12.2F21H12.2n/achrII 6,088,063
35srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36clec-46F07C4.9n/achrV 7,637,516C. elegans CLEC-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37srbc-21C45H4.7n/achrV 2,156,083C. elegans SRBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001118 (Na+/H+ exchanger, isoform 3 (NHE3))
38Y39F10A.1Y39F10A.1n/achrII 776,047
39math-10C16C4.15n/achrII 1,872,348C. elegans MATH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
40F47B8.1F47B8.1n/achrV 14,314,024
41srbc-30C02A12.3n/achrV 3,479,236C. elegans SRBC-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42F10A3.12F10A3.12n/achrV 16,164,918contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43sra-28F18C5.6n/achrII 6,572,192C. elegans SRA-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
44srbc-54F54B8.11n/achrV 15,833,053C. elegans SRBC-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45C48C5.1C48C5.1n/achrX 8,982,602contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46K02F3.7K02F3.7n/achrIII 836,776
47nhr-208R07B7.15n/achrV 12,095,111C. elegans NHR-208 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
49C07D8.3C07D8.3n/achrX 7,361,807
50C40A11.7C40A11.7n/achrII 2,149,559contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)