UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y38H8A.4Y38H8A.44e-180chrIV 13,471,382contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2C37A2.3C37A2.3n/achrI 6,785,976contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
3C03B8.3C03B8.3n/achrIII 7,712,627
4C54D10.4C54D10.4n/achrV 12,420,859contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
5spe-9C17D12.6n/achrI 11,584,385spe-9 encodes an EGF repeat-containing protein with a short intracellular domain; SPE-9 is required autonomously in sperm for fertilization, and by homology, likely mediates an adhesive or signaling event necessary for proper oocyte fertilization; spe-9 mRNA is detected solely in animals that are engaged in spermatogenesis; in spermatids, SPE-9 is found at or near the cell surface; following sperm activation, SPE-9 is found primarily on the pseudopod.
6F26D2.10F26D2.10n/achrV 16,427,124contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
7Y106G6D.4Y106G6D.40.000000004chrI 10,115,663contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
8F58F12.3F58F12.3n/achrII 6,390,234
9F55D12.6F55D12.6n/achrI 7,902,571contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001865 (Ribosomal protein S2), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
10F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
11ssq-3ZC477.1n/achrIV 7,112,230C. elegans SSQ-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001553 (RecA bacterial DNA recombination), IPR013286 (Annexin, type VII)
12F26C11.1F26C11.1n/achrII 9,894,986contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
13F41G3.5F41G3.5n/achrII 6,748,034contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14C36H8.1C36H8.1n/achrIV 12,743,886contains similarity to Pfam domains PF03134 (TB2/DP1, HVA22 family) , PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000535 (Major sperm protein), IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
15ZK484.7ZK484.7n/achrI 6,095,825contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
16F54C8.1F54C8.1n/achrIII 9,440,304contains similarity to Pfam domains PF00725 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02737 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR008927 (6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal-like), IPR006108 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, C-terminal), IPR013328 (Dehydrogenase, multihelical), IPR006176 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD binding), IPR006180 (3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR006036 (Potassium uptake protein TrkA)
17D2062.6D2062.6n/achrII 2,619,582contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
18M117.4M117.4n/achrIV 11,832,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
19ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
20C06A1.3C06A1.3n/achrII 10,573,080contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
21srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22C25D7.12C25D7.12n/achrV 15,032,736contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
23sri-66F28B1.6n/achrV 17,060,972C. elegans SRI-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
25W06D4.3W06D4.3n/achrI 9,059,663contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
26K09F6.3K09F6.3n/achrII 2,258,704contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
27H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
28C03B8.1C03B8.1n/achrIII 7,716,961
29Y106G6G.1Y106G6G.1n/achrI 10,329,688contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4Z6
30F59A7.9F59A7.9n/achrV 2,005,893contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domains IPR005856 (Cysteine synthase K/M), IPR001216 (Cysteine synthase/cystathionine beta-synthase P-phosphate-binding site), IPR005859 (Cysteine synthase A), IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit), IPR016040 (NAD(P)-binding)
31C53B4.2C53B4.2n/achrIV 8,966,964contains similarity to Plasmodium vivax Sperm-specific protein Don juan, putative.; TR:A5K197
32C32E12.1C32E12.1n/achrI 5,234,144contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
33C28A5.6C28A5.6n/achrIII 4,426,610contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
34C55C3.3C55C3.3n/achrIV 5,686,761contains similarity to Trypanosoma cruzi Trans-sialidase, putative.; TR:Q4E0H9
35F38A5.8F38A5.8n/achrIV 6,600,170
36F18A1.1F18A1.1n/achrII 7,687,417
37B0218.7B0218.7n/achrIV 8,165,316
38C04G2.2C04G2.2n/achrIV 10,091,506contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
39T15B12.2T15B12.2n/achrIII 5,300,917contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
40C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
41spe-15F47G6.4n/achrI 1,456,004spe-15 encodes an unconventional myosin, and is homologous to both Drosophila and mouse myosin VI; spe-15 was identified in screens for mutants that have defective spermatogenesis; spe-15 is required during the terminal stages of spermatogenesis for the asymmetric partitioning of organelles like the mitochondria and for the proper partitioning of specialized structures called the fibrous-body membranous organelles into the spermatid; mutant spe-15 spermatids contain actin filaments in contrast to wild-type which lack them; spe-15 is also required for the proper morphology and activation of the spermatid; the human gene MYOSIN VI (MYO6; OMIM:600970), when mutated leads to disease that affects hearing.
42B0511.11B0511.11n/achrI 10,649,379
43R09H10.2R09H10.2n/achrIV 10,606,027contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
44C07G1.6C07G1.6n/achrIV 8,209,489
45Y38H6C.15Y38H6C.15n/achrV 20,530,900contains similarity to Interpro domain IPR006017 (Caldesmon)
46snf-2F55H12.1n/achrI 8,873,592C. elegans SNF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
47B0207.7B0207.70.00002chrI 5,946,551contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
48C36F7.5C36F7.5n/achrI 9,575,404contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR003979 (Tropoelastin), IPR013286 (Annexin, type VII)
49col-53M01A12.1n/achrI 5,645,857C. elegans COL-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
50C06A5.2C06A5.2n/achrI 6,006,816contains similarity to Homo sapiens Microtubule-associated protein 1B; ENSEMBL:ENSP00000296755