UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y37D8A.3Y37D8A.32.0000000000000003e-175chrIII 12,833,196contains similarity to Methanosarcina mazei Conserved protein.; TR:Q8Q0P1
2srab-7C36C5.11n/achrV 3,154,327C. elegans SRAB-7 protein ;
3grl-14T03D8.4n/achrV 20,822,062grl-14 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-14 is expressed in intestine, head mesodermal cell, hypodermis, seam cells, and uterine muscle, larval arcade cells and reproductive system, and the developing vulva; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
4F55C5.1F55C5.1n/achrV 12,263,644contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
5F56H6.12F56H6.12n/achrI 12,313,605contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
6T23F4.1T23F4.1n/achrII 1,167,834contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
7K08E3.2K08E3.2n/achrIII 13,747,959contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
8Y54E2A.8Y54E2A.8n/achrII 14,780,444contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
9str-166T08B6.6n/achrIV 4,885,569C. elegans STR-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10srh-248H05B21.2n/achrV 2,954,922C. elegans SRH-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
11clec-242Y68A4B.2n/achrV 17,244,604C. elegans CLEC-242 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12W09D6.5W09D6.5n/achrIII 11,089,923contains similarity to Saccharomyces cerevisiae cell wall integrity and stress response component 1; SGD:YOR008C
13gpa-5F53B1.7n/achrX 2,119,972gpa-5 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in AWA, with faint expression in ASI.
14str-77W06D12.4n/achrV 17,720,087C. elegans STR-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15srd-40F17A2.12n/achrX 12,324,508C. elegans SRD-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16C03A7.2C03A7.2n/achrV 5,182,798
17sri-57F22E5.16n/achrII 2,671,336C. elegans SRI-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18ZK1053.6ZK1053.6n/achrI 13,239,621ZK1053.6 encodes an ortholog of human SLC41A1 (OMIM:610801) and bacterial MgtE; like its orthologs, ZK1053.6 is predicted to transport Mg(2+) into cells; ZK1053.6 is paralogous to K07H8.2 and ZK185.2, and has no obvious function in mass RNAi assays.
19W05H5.1W05H5.1n/achrII 12,443,814contains similarity to Ovis aries Lysophosphatidic acid receptor Edg-2 (LPA receptor 1) (LPA-1).; SW:EDG2_SHEEP
20F27D9.4F27D9.4n/achrX 7,653,722
21ZK1240.5ZK1240.5n/achrII 2,317,121contains similarity to Interpro domain IPR000315 (Zinc finger, B-box)
22B0432.4B0432.4n/achrII 287,664contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
23srd-59E04F6.1n/achrII 7,206,230C. elegans SRD-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24ZK563.2ZK563.2n/achrX 3,371,077contains similarity to Pfam domain PF02690 Na+/Pi-cotransporter contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR003841 (Na+/Pi-cotransporter)
25str-28F25E5.12n/achrV 7,472,264C. elegans STR-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26gcy-6B0024.6n/achrV 10,311,299gcy-6 encodes a predicted guanylate cyclase; expressed in the ASEL neurons.
27T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
28nhr-75C49D10.6n/achrII 3,867,513C. elegans NHR-75 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
29zag-1F28F9.1n/achrIV 3,858,673zag-1 encodes a homeodomain protein of the ZFH class which consists of a homeodomain flanked by two clusters of C2H2-type zinc fingers and is related to transcriptional repressors encoded by Drosophila zfh-1 and the vertebrate ZEB genes; ZAG-1 is required for locomotion, for neuronal differentiation, and for proper axonal branching and fasciculation; from late embryogenesis through adult stages of development, ZAG-1 is expressed dynamically in head and tail neurons and in the intestinal and anal depressor muscles.
30amt-3M195.3n/achrII 8,366,108amt-3 encodes one of four C. elegans homologs of AMT1 (AT11_ARATH), a high-affinity ammonium transporter from Arabidopsis thaliana; AMT-3 is closely similar to its paralog AMT-2, with somewhat more distant paralogy to AMT-1 and AMT-4.
31str-260T24A6.6n/achrV 3,528,795C. elegans STR-260 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
33srt-54K10B4.2n/achrII 117,953C. elegans SRT-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
34C50C3.7C50C3.7n/achrIII 8,160,210contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
35T26C11.3T26C11.3n/achrX 1,838,587
36mel-26ZK858.4n/achrI 9,134,137mel-26 encodes a MATH and BTB/POZ domain-containing protein that functions as a novel substrate-specific adaptor of the CUL-3-containing E3 ubiquitin ligase; MEL-26 is required maternally for formation of mitotic spindles in the early embryo, and as a component of a ubiquitin ligase complex, for degradation of the microtubule-severing protein MEI-1 at the meiosis to mitosis transition; MEL-26 is also required maternally for embryonic morphogenesis; since MEL-26 contains a meprin-associated Traf homology (MATH) domain, it might be involved in apoptosis.
37Y38H6A.3Y38H6A.3n/achrV 20,342,053contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
38fbxa-171C38D9.1n/achrV 17,564,573This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
39srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
40W03H9.1W03H9.1n/achrII 14,148,639contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
41T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
42F46A8.6F46A8.6n/achrI 11,244,411contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
43F53B6.6F53B6.6n/achrI 8,956,012contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
44tag-89H02I12.3n/achrIV 11,395,562C. elegans TAG-89 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
45set-24Y43F11A.5n/achrII 12,122,894set-24 encodes a protein with an N-terminal SET domain, followed by two SPK domains; SET-24's domain organization resembles that of SET-5, but SET-24 has no known non-nematode orthologs or C. elegans paralogs; neither set-24(n4909) nor set-24(RNAi) have any obvious phenotypes.
46F49E12.8F49E12.8n/achrII 8,393,450contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0335; TR:O15044
47bath-33C08E3.3n/achrII 1,605,408C. elegans BATH-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00917 (MATH domain) , PF00651 (BTB/POZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
48srh-236Y68A4A.9n/achrV 17,211,345C. elegans SRH-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49srbc-59R09E12.1n/achrV 779,433C. elegans SRBC-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50Y62H9A.10Y62H9A.10n/achrX 11,901,221contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)