UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y37D8A.16Y37D8A.166e-48chrIII 12,916,800contains similarity to Cyanidioschyzon merolae Cytochrome C-type biogenesis protein CCMF.; TR:Q9ZZP7
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3C08A9.3C08A9.3n/achrX 17,089,713contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
4T05A7.3T05A7.3n/achrII 4,676,002contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
5R53.5R53.5n/achrII 9,969,980contains similarity to Interpro domain IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
6Y45F10C.1Y45F10C.1n/achrIV 13,657,948contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
7srh-125C18B10.8n/achrV 7,476,227C. elegans SRH-125 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8ttr-55F56F4.2n/achrI 6,146,261C. elegans TTR-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
9sra-3AH6.7n/achrII 9,539,969C. elegans SRA-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
10agr-1F41G3.12n/achrII 6,767,868agr-1 encodes a large (1396-residue) putative agrin, orthologous to human AGRIN (OMIM:103320), EGFLAM, and Q9NQ15; AGR-1 is expressed in buccal epithelium and deposited in pharyngeal basal epithelium; AGR-1 is also expressed in IL1 neurons, distal tip cells, and intestine; an AGR-1 fragment can cluster vertebrate dystroglycan in cell culture; agr-1(eg1770) mutations show no obvious phenotype, including levimasole resistance, and do not enhance other mutations perturbing acetylcholine signalling, the dystrophin-glycoprotein-complex, muscle cell differentiation, or the extracellular matrix.
11C04B4.5C04B4.5n/achrX 12,287,929contains similarity to Plasmodium falciparum Ring-infected erythrocyte surface antigen precursor.; TR:Q8I0U6
12F28B1.4F28B1.4n/achrV 17,056,226contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Ferredoxin (FDX-2).; TR:O30071
13srh-212T22F3.6n/achrV 3,596,155C. elegans SRH-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14nhr-169C54C8.1n/achrI 12,443,002C. elegans NHR-169 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15T02G5.3T02G5.3n/achrII 7,094,691
16gpa-15M04C7.1n/achrI 8,533,150gpa-15 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADL, ASH, ASK, PHA, PHB, the distal tip cell, the anchor cell, and many male-specific neurons.
17lgc-16T01H10.5n/achrX 12,119,573C. elegans LGC-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
18Y44A6D.6Y44A6D.6n/achrV 20,807,147contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
19fbxb-93Y63D3A.9n/achrI 14,083,610This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
20Y68A4B.3Y68A4B.3n/achrV 17,241,853contains similarity to Ehrlichia canis 28 kDa outer membrane protein (Fragment).; TR:Q9R3J3
21fbxa-102K03D7.7n/achrV 17,492,710This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
22sri-71D2062.3n/achrII 2,628,473C. elegans SRI-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23R03D7.8R03D7.8n/achrII 10,955,158contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
24F22D3.4F22D3.4n/achrII 6,925,039
25srg-37K04C1.1n/achrX 14,234,536C. elegans SRG-37 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
26C49A1.5C49A1.5n/achrI 14,239,274contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
27F54C8.6F54C8.6n/achrIII 9,445,388contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAL7
28C27C7.5C27C7.5n/achrI 11,425,014contains similarity to Pfam domains PF00337 (Galactoside-binding lectin) , PF08277 (PAN-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
29F55G11.1F55G11.1n/achrIV 12,945,773contains similarity to Magnetospirillum magnetotacticum MagA protein.; TR:Q8GRF6
30C40D2.4C40D2.4n/achrII 2,000,282contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
31F27C8.5F27C8.5n/achrIV 9,591,134contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
32T08G3.7T08G3.7n/achrV 16,464,369contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
33dgn-2F56C3.6n/achrX 1,366,491C. elegans DGN-2 protein ;
34cpb-1C40H1.1n/achrIII 9,323,513cpb-1 encodes a cytoplasmic polyadenylation element binding (CPEB) protein homolog involved in two steps of spermatogenesis; two CPEB proteins have distinct functions in spermatogenesis, with FOG-1 specifying sperm cell fate, and CPB-1 conversely executing that decision, being required for progression through meiosis; cpb-1(RNAi) spermatocytes fail to undergo meiotic cell divisions; CPB-1 protein is present in the germ line just prior to overt spermatogenesis, but once sperm differentiation begins, CPB-1 disappears; CPB-1 physically interacts with EBF, which, like CPEB, regulates genes by binding the 3' UTRs of mRNAs; while CPB-1 is required for spermatogenesis, it is dispensable for oogenesis; this is in contrast to CPEBs in vertebrates (Xenopus), arthropods (Drosophila), and molluscs (Spisula), which all participate in oogenesis.
35T25B6.3T25B6.3n/achrX 9,027,882
36F15D3.8F15D3.8n/achrI 11,580,950contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii Chromosome partition protein smc homolog.; SW:Q59037
37srz-42H12I19.1n/achrIV 14,130,194C. elegans SRZ-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
38srt-72C36C5.9n/achrV 3,148,851C. elegans SRT-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
39tag-304F53E2.1n/achrV 1,469,424C. elegans TAG-304 protein; contains similarity to Pfam domain PF08513 LisH contains similarity to Interpro domains IPR006594 (LisH dimerisation motif), IPR013144 (CT11-RanBPM), IPR013720 (LisH dimerisation motif, subgroup), IPR006595 (CTLH, C-terminal to LisH motif)
40F40F9.3F40F9.3n/achrV 9,715,769contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
41F28B3.4F28B3.4n/achrI 4,937,314contains similarity to Pfam domain PF06464 DMAP1-binding Domain contains similarity to Interpro domains IPR010506 (DMAP1-binding), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
42R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
43srd-8B0547.4n/achrIV 5,644,418C. elegans SRD-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44col-105F58F6.2n/achrIV 1,358,519C. elegans COL-105 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR003979 (Tropoelastin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
45C17D12.5C17D12.5n/achrI 11,586,755contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like)
46ift-74C18H9.8n/achrII 6,681,205C. elegans IFT-74 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000694 (Proline-rich region)
47R01H2.2R01H2.2n/achrIII 7,057,468contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
48C09B9.7C09B9.7n/achrIV 5,058,402contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
49R09D1.13R09D1.13n/achrII 9,444,567contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
50K08H2.2K08H2.2n/achrX 13,234,539contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0144; ENSEMBL:ENSP00000271877