UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ncx-5Y32F6B.20chrV 10,488,232ncx-5 encodes a putative 4Na[+]/1Ca[2+],1K[+] exchanger, orthologous to human SLC24A1-5 and paralogous to NCX-4; NCX-5 is predicted to export free cytoplasmic Ca[2+] with low affinity but high capacity, being complemented by low-capacity/high-affinity Ca[2+] ATPase pumps such as MCA-1/-3; NCX-5 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-5 has no obvious function in mass RNAi assays.
2K07H8.5K07H8.5n/achrIV 8,272,091
3pax-2K06B9.5n/achrIV 4,202,013C. elegans PAX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
4sra-28F18C5.6n/achrII 6,572,192C. elegans SRA-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
5twk-33W06D12.5n/achrV 17,712,140C. elegans TWK-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
6F32D8.1F32D8.1n/achrV 10,882,070contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
7nhr-173C56E10.1n/achrX 6,657,606C. elegans NHR-173 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
8srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9sre-41Y57A10B.5n/achrII 12,388,981C. elegans SRE-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
10fbxa-214Y38A10A.4n/achrV 6,068,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
11nhr-197K06B4.7n/achrV 15,688,881C. elegans NHR-197 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
12F41D9.1F41D9.1n/achrX 8,380,568contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00566 (TBC domain) , PF02759 (RUN domain) contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR001452 (Src homology-3), IPR004012 (RUN), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3)
13srsx-32F20A1.3n/achrV 7,018,087C. elegans SRSX-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
14C37H5.2C37H5.2n/achrV 4,848,674contains similarity to Pfam domain PF00561 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR000639 (Epoxide hydrolase-like), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase), IPR002410 (Peptidase S33, prolyl aminopeptidase)
15F28E10.2F28E10.2n/achrIV 4,563,722contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
16nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
17srd-48F17A2.9n/achrX 12,336,853C. elegans SRD-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18str-151T03E6.1n/achrV 16,577,135C. elegans STR-151 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19T01G6.1T01G6.1n/achrV 498,392contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
20C36C9.5C36C9.5n/achrX 1,701,859
21F47B8.1F47B8.1n/achrV 14,314,024
22nspb-2F38A5.12n/achrIV 6,591,852C. elegans NSPB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
23F23A7.3F23A7.3n/achrX 16,221,101contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Endocytosis protein end4 (SLA2 protein homolog).; SW:Q9P6L5
24C34F6.7C34F6.7n/achrX 11,212,716contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG14646-PA;; FLYBASE:CG14646
25B0496.5B0496.5n/achrIV 7,421,847contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26str-97F10A3.8n/achrV 16,154,443C. elegans STR-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27ugt-54T25B9.7n/achrIV 10,763,022C. elegans UGT-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domains IPR002416 (Bacterial general secretion pathway protein H), IPR001546 (Pheromone A receptor), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
28C05C12.6C05C12.6n/achrIV 11,232,367contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
29ZC482.7ZC482.7n/achrIII 12,752,251contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
30sra-20F28C12.4n/achrI 12,697,375C. elegans SRA-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
31C31B8.9C31B8.9n/achrV 2,912,083contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
32T05C1.1T05C1.1n/achrII 4,479,688
33Y62H9A.9Y62H9A.9n/achrX 11,896,785contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I659
34K04A8.2K04A8.2n/achrV 6,563,097contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
35pik-1K09B11.1n/achrIV 13,419,126The pik-1 gene encodes a pelle/IRAK kinase homolog that may be involved in apoptosis.
36T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
37K01A6.5K01A6.5n/achrIV 11,743,140contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q14202 Zinc finger protein 261; ENSEMBL:ENSP00000322845
38AH9.4AH9.4n/achrX 2,272,675contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39Y66A7A.2Y66A7A.2n/achrIII 11,486,326Y66A7A.2 encodes an ortholog of Pop5, a protein subunit shared by the endoribonucleases RNase MRP and RNAse P; RNAse MRP cleaves mitochondrial RNA in mitochondrial DNA synthesis, nucleolar pre-rRNA in ribosome synthesis, and at least one mRNA (CLB2) involved in cell-cycle regulation; RNAse P cleaves tRNA precursors to produce their mature 5' end; Y66A7A.2 is evolutionarily ubiquitous among eukaryotes.
40Y26G10.1Y26G10.1n/achrV 17,694,131contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR001774 (Delta/Serrate/lag-2 (DSL) protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR015919 (Cadherin-like), IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR006626 (Parallel beta-helix repeat), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR002126 (Cadherin), IPR013111 (EGF, extracellular)
41F11D11.6F11D11.6n/achrV 18,752,774contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
42sri-20AC3.1n/achrV 10,369,184C. elegans SRI-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43srw-43F14F8.5n/achrV 16,686,204C. elegans SRW-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
44F32B4.5F32B4.5n/achrI 11,519,244contains similarity to Homo sapiens BTB/POZ domain-containing protein KCTD16; ENSEMBL:ENSP00000329906
45C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
46T05B9.2T05B9.2n/achrII 11,257,607contains similarity to Rattus norvegicus Fibrillin-2.; TR:Q9WUH9
47srab-16R13D11.6n/achrV 783,761C. elegans SRAB-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
48srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49sre-5B0212.2n/achrIV 3,566,503C. elegans SRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
50srh-145F26D2.4n/achrV 16,411,251C. elegans SRH-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)