UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srg-21Y25C1A.93e-177chrII 3,089,880C. elegans SRG-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
2C17D12.5C17D12.5n/achrI 11,586,755contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like)
3fbxa-224ZK1290.9n/achrII 7,547,404fbxa-224 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
4Y116A8C.19Y116A8C.19n/achrIV 17,039,245Y116A8C.19 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to C. elegans POS-1, the product of Y116A8C.19 is predicted to function as an RNA-binding protein.
5abt-6F56F4.6n/achrI 6,139,832F56F4.6 encodes a protein that contains an ATP-binding cassette (ABC) that is most closely related to that of the ABCA subfamily of ABC transport proteins; as the product of F56F4.6 lacks a predicted transmembrane domain, and as loss of F56F4.6 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of this gene in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
6ttr-55F56F4.2n/achrI 6,146,261C. elegans TTR-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
7srx-6F07G11.8n/achrV 7,312,511C. elegans SRX-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
8srr-2T26H2.8n/achrV 19,215,331C. elegans SRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domains IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
9F49D11.4F49D11.4n/achrI 10,914,398contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
10F32B5.3F32B5.3n/achrI 2,693,421contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domains IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv)
11srg-13T23F11.52.0000000000000002e-71chrIII 4,673,171C. elegans SRG-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
12K09E4.2K09E4.2n/achrII 14,130,163contains similarity to Pfam domain PF05208 ALG3 protein contains similarity to Interpro domains IPR007873 (ALG3), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site)
13E03H4.11E03H4.11n/achrI 12,433,962contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
14srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15ZK1010.8ZK1010.8n/achrIII 12,998,222contains similarity to Homo sapiens BRG1-binding protein ELD/OSA1 isoform 1; TR:Q8IZY8
16ZK1086.3ZK1086.3n/achrX 13,791,278contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
17str-217Y102A5C.28n/achrV 16,999,587C. elegans STR-217 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18Y70C5B.1Y70C5B.1n/achrV 16,662,837
19str-64T28A11.1n/achrV 3,283,924C. elegans STR-64 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20F14F4.1F14F4.1n/achrX 14,926,903contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like), IPR001817 (Vasopressin receptor)
21C25G6.3C25G6.3n/achrX 1,235,994contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR011130 (SecA preprotein cross-linking region), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
22K05F1.5K05F1.5n/achrII 5,791,755contains similarity to Pfam domain PF01551 Peptidase family M23 contains similarity to Interpro domains IPR016047 (Peptidase M23), IPR008663 (Leukocyte cell-derived chemotaxin 2), IPR011055 (Duplicated hybrid motif)
23cyp-33B1C25E10.2n/achrV 9,042,479C. elegans CYP-33B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
24F16B12.4F16B12.4n/achrX 14,097,334contains similarity to Dictyostelium discoideum Myosin II heavy chain, non muscle.; SW:MYS2_DICDI
25F31F7.3F31F7.3n/achrV 6,269,506
26ZC204.6ZC204.6n/achrII 1,644,534
27T07G12.5T07G12.5n/achrIV 10,543,255contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
28Y38F1A.2Y38F1A.2n/achrII 12,956,401contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
29T07A5.3T07A5.3n/achrIII 10,301,759contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30ttr-6T28B4.3n/achrX 6,596,773C. elegans TTR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
31wht-3C16C10.12n/achrIII 4,149,469C16C10.12 encodes an ATP-binding cassette (ABC) transporter; C16C10.12 activity is required for efficient RNA interference (RNAi) of a germline-expressed target, pop-1.
32R03D7.8R03D7.8n/achrII 10,955,158contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
33unc-79E03A3.6n/achrIII 4,074,729unc-79 encodes a novel, conserved protein; unc-79 functions in a pathway with nca-1 and nca-2, which encode ion channel subunits, to regulate locomotion and the response to specific volatile anesthetics; unc-79 exerts its effects on these processes, at least in part, by regulating the levels of NCA-1 and NCA-2 proteins; an unc-79::gfp reporter is expressed in the nervous system in ventral nerve cord neurons in L2 and L3 larvae and in one or two head neurons in adults.
34F44D12.10F44D12.10n/achrIV 10,036,818contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
35fbxb-58H11E01.1n/achrX 1,628,252C. elegans FBXB-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
36hlh-14C18A3.8n/achrII 5,738,759hlh-14 encodes a basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor that is one of five C. elegans Achaete-Scute family homologs; HLH-14 activity is required generally for normal egg-laying, movement, body morphology, and larval development; more specifically, HLH-14 is required for proper neuronal development, particularly for regulation of the asymmetric cell division that gives rise to the PVQ/HSN/PHB neuroblasts and for normal differentiation of these neuroblast descendants, including their cell division patterns, migrations, and neurotransmitter expression; in specifying neuronal cell fates, genetic evidence suggests that hlh-14 acts together with hlh-2, which encodes the C. elegans E/Daughterless ortholog; HLH-14 is expresed exclusively in the embryo and detected in the left and right PVQ/HSN/PHB neuroblasts and their descendants, as well as in other cells identified, tentatively, as anterior neuroblasts and posterior neuroblasts such as Caapa.
37W02B8.2W02B8.2n/achrII 13,911,962contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00780 (CNH domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001180 (Citron-like), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
38F16C3.2F16C3.2n/achrI 10,152,680contains similarity to Clostridium acetobutylicum DNA repair protein recN, ATPase.; TR:Q97HD9
39R10F2.4R10F2.4n/achrIII 2,921,110contains similarity to Interpro domain IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
40C23H4.6C23H4.6n/achrX 12,238,124contains similarity to Pfam domain PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR003395 (RecF/RecN/SMC protein, N-terminal)
41C04B4.5C04B4.5n/achrX 12,287,929contains similarity to Plasmodium falciparum Ring-infected erythrocyte surface antigen precursor.; TR:Q8I0U6
42C49A1.5C49A1.5n/achrI 14,239,274contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
43E03G2.1E03G2.1n/achrX 15,927,754contains similarity to Plasmodium falciparum Glutamate--cysteine ligase (EC 6.3.2.2).; TR:Q9TY17
44Y57G11C.8Y57G11C.8n/achrIV 14,782,524contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000302919
45T22B11.3T22B11.3n/achrIV 4,684,022contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
46F23B12.1F23B12.1n/achrV 14,429,754contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
47F48B9.1F48B9.1n/achrX 2,183,370contains similarity to Interpro domain IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
48F36F12.1F36F12.1n/achrV 2,101,648contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
49tbx-11F40H6.4n/achrIII 6,046,285tbx-11 encodes a T-box transcription factor that is orthologous to members of the Tbx2 subfamily of T-box transcription factors; by homology, TBX-11 is predicted to function in transcriptional regulation during cellular differentiation, potentially as both an activator and a repressor; however, as loss of tbx-11 function via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of tbx-11 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
50F28B4.1F28B4.1n/achrX 3,205,615