UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sri-18Y22F5A.23e-172chrV 10,259,578C. elegans SRI-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2T10D4.1T10D4.1n/achrII 3,151,352contains similarity to Pfam domains PF01579 (Domain of unknown function DUF19) , PF02343 (Domain of unknown function DUF130) contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
5C12D5.10C12D5.10n/achrV 7,692,770contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
6ire-1C41C4.4n/achrII 8,118,482ire-1 encodes a transmembrane serine/threonine protein kinase and site-specific endoribonuclease orthologous to Saccharomyces cerevisiae inositol-requiring 1 protein kinase (Ire1) and human endoplasmic reticulum-to-nucleus signaling 1 (ERN1, OMIM:604033); IRE-1 is required for the unfolded protein response (UPR) that counteracts cellular stress induced by accumulation of unfolded proteins in the endoplasmic reticulum (ER); in response to ER stress, IRE-1 cleaves xbp-1 mRNA to produce transcriptionally active XBP-1 that positively regulates UPR gene expression in order to maintain ER homeostasis.
7F16B4.3F16B4.3n/achrV 1,597,417contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
8Y17D7C.2Y17D7C.2n/achrV 18,717,931contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
9nhr-143F59E11.11n/achrV 8,974,032C. elegans NHR-143 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10ZK938.3ZK938.3n/achrII 9,832,928contains similarity to Pfam domain PF00612 IQ calmodulin-binding motif contains similarity to Interpro domain IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
11C41C4.3C41C4.3n/achrII 8,110,504contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
12ZK1320.9ZK1320.9n/achrII 9,685,397contains similarity to Pfam domain PF02550 Acetyl-CoA hydrolase/transferase N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR003702 (Acetyl-CoA hydrolase/transferase), IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
13M04C9.4M04C9.4n/achrI 9,356,115contains similarity to Bos taurus Osteopontin precursor (Bone sialoprotein 1).; SW:OSTP_BOVIN
14F54A5.2F54A5.2n/achrI 966,565contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
15F59F5.3F59F5.3n/achrX 10,539,693contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
16C08H9.1C08H9.1n/achrII 9,876,448contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
17C26D10.4C26D10.4n/achrII 8,331,544contains similarity to Pfam domains PF08544 (GHMP kinases C terminal) , PF00288 (GHMP kinases N terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001174 (Galactokinase/homoserine kinase), IPR006204 (GHMP kinase), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold), IPR013750 (GHMP kinase, C-terminal)
18F15E11.4F15E11.4n/achrV 2,340,462contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
19sru-3C33A12.11n/achrIV 9,497,224C. elegans SRU-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
20C46H3.3C46H3.3n/achrX 1,228,487contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
21str-178R11D1.5n/achrV 12,715,427C. elegans STR-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22srx-35T01C4.5n/achrV 7,121,587C. elegans SRX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23C32B5.13C32B5.13n/achrII 961,636contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
24str-16Y73C8A.1n/achrV 3,239,764C. elegans STR-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002091 (Aromatic amino acid permease)
25F42G8.7F42G8.7n/achrIV 8,127,262contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain)
26sri-48ZC239.90.000000002chrII 3,200,257C. elegans SRI-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27srh-268C54F6.1n/achrV 7,540,084C. elegans SRH-268 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28T20F7.5T20F7.5n/achrX 16,850,352contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
29F17H10.4F17H10.4n/achrX 13,126,169contains similarity to Macaca fascicularis Cytochrome oxidase subunit VIII.; TR:Q8SPI5
30nhr-176F14H3.11n/achrV 16,072,040C. elegans NHR-176 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31C38D9.2C38D9.2n/achrV 17,568,988contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
32F39D8.3F39D8.3n/achrX 15,423,577contains similarity to Homo sapiens Sperm-specific thioredoxin; ENSEMBL:ENSP00000304908
33C36B7.1C36B7.1n/achrX 7,113,827contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
34srt-9C50H11.5n/achrV 3,078,685C. elegans SRT-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
35F40A3.2F40A3.2n/achrV 7,880,134contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
36C44H9.4C44H9.4n/achrV 12,837,723contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
37F10D11.4F10D11.4n/achrI 8,441,960contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
38F22F1.3F22F1.3n/achrX 8,162,399contains similarity to Pfam domain PF02172 KIX domain contains similarity to Interpro domain IPR003101 (Coactivator CBP, KIX)
39C39E9.7C39E9.7n/achrIV 13,074,688contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
40C01H6.3C01H6.3n/achrI 7,208,985contains similarity to Pfam domain PF00096 (Zinc finger, C2H2 type)
41tpi-1Y17G7B.7n/achrII 12,038,108tpi-1 encodes a putative triosephosphate isomerase orthologous to human TPI1 (OMIM:190450, mutated in TPI deficiency) and Drosophila WASTED AWAY; despite the severity of TPI mutant phenotypes in humans and Drosophila, TPI-1 has no obvious function in mass RNAi assays.
42T09E11.3T09E11.3n/achrI 12,369,888contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
43ZK892.6ZK892.6n/achrII 9,979,541contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Hypothetical protein.; TR:Q87PB2
44srw-79T11F1.5n/achrII 2,947,802C. elegans SRW-79 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
45F56F11.2F56F11.2n/achrIII 2,883,625
46srh-15C50B6.6n/achrV 13,321,651C. elegans SRH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
48F54D8.6F54D8.6n/achrIII 5,104,430contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
49T11F9.7T11F9.7n/achrV 11,476,386contains similarity to Interpro domain IPR008880 (Trigger factor, C-terminal, bacterial)
50F45E6.1F45E6.1n/achrX 12,476,473contains similarity to Interpro domain IPR005829 (Sugar transporter, conserved site)