UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y116A8B.4Y116A8B.41e-38chrIV 17,224,339contains similarity to Clostridium acetobutylicum Predicted membrane protein.; TR:Q97KC4
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3W04A8.3W04A8.3n/achrI 13,845,353contains similarity to Plasmodium falciparum Reticulocyte-binding protein, putative.; TR:Q8I4R2
4F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
5ceh-36C37E2.4n/achrX 14,184,445ceh-36 encodes a paired-like homeodomain transcription factor that is one of three orthodenticle (OTD)-like homeodomain proteins in C. elegans (the others being ttx-1 and ceh-37); CEH-36 is required broadly for specification of the AWC olfactory neuron and also for establishing the left-right asymmetry of the ASEL and ASER gustatory neurons; in addition, CEH-36 is sufficient to specify the AFD thermosensory neuron fate in some cell types; CEH-36 is expressed in the AWC and ASE chemosensory neurons.
6R01B10.3R01B10.3n/achrV 6,044,828
7srg-37K04C1.1n/achrX 14,234,536C. elegans SRG-37 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
8nhr-213T06C12.13n/achrV 15,895,604C. elegans NHR-213 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9Y57G11C.21Y57G11C.21n/achrIV 14,846,701contains similarity to Interpro domain IPR000358 (Ribonucleotide reductase)
10T03D8.7T03D8.7n/achrV 20,811,735contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein ENSP00000381489; ENSEMBL:ENSP00000335483
11C04B4.1C04B4.1n/achrX 12,281,591
12srbc-6C36C5.3n/achrV 3,170,772C. elegans SRBC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
13fbxb-51K05F6.3n/achrII 1,552,094C. elegans FBXB-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
14Y43C5A.4Y43C5A.4n/achrIV 10,278,717contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
15fbxb-40M01D1.9n/achrII 1,049,413This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
16srg-67ZC317.4n/achrV 5,462,245C. elegans SRG-67 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
17R12E2.14R12E2.14n/achrI 4,150,308contains similarity to Interpro domain IPR004051 (Potassium channel, voltage dependent, Kv1.4)
18F25E2.3F25E2.3n/achrX 812,150contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
19R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
20srw-138C44C3.3n/achrV 2,962,370C. elegans SRW-138 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
21egl-38C04G2.7n/achrIV 10,108,695The egl-38 gene encodes a Pax5 homolog.
22C33D9.8C33D9.8n/achrIV 8,784,995contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin)
23vab-7M142.4n/achrIII 10,923,070The vab-7 gene encodes an even-skipped-like homeodomain protein that is required for DB motoneuron identity and posterior DB axonal polarity.
24fbxb-98C16C4.6n/achrII 1,863,210This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
25F46F3.3F46F3.3n/achrV 11,668,418contains similarity to Dictyostelium discoideum Hypothetical protein.; TR:Q86J27
26sri-1F36G9.8n/achrV 15,966,916C. elegans SRI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
27F23D12.4F23D12.4n/achrX 14,445,484This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28lev-8C35C5.5n/achrX 11,562,231lev-8 encodes a novel nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) alpha subunit that is a member of the ACR-8 group of nAChR subunits; LEV-8 activity is required for normal rates of pharyngeal pumping and for fully wild-type responses (increased egg laying and body wall muscle contraction) to the nAChR agonist and antihelmintic levamisole; expression of a LEV-8::GFP reporter construct begins at the L1 larval stage and is detected in neurons, body wall and uterine muscle cells, and socket cells of the IL and OL mechanosensory neurons; expression in body wall muscles is strongest in the anterior, consistent with increased levamisole resistance of head, or anterior, muscles seen in lev-8 mutant animals.
29srj-57T03D3.14n/achrV 2,854,982C. elegans SRJ-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30T02G5.2T02G5.2n/achrII 7,095,853contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001023 (Heat shock protein Hsp70)
31T26G10.4T26G10.4n/achrIII 9,420,953contains similarity to Forficula auricularia Reverse transcriptase (Fragment).; TR:O44323
32F57B9.1F57B9.1n/achrIII 6,962,648contains similarity to Pfam domain PF01243 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase contains similarity to Interpro domains IPR012349 (FMN-binding split barrel), IPR011576 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding core), IPR009002 (FMN-binding split barrel, related), IPR000659 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase)
33arl-6C38D4.8n/achrIII 4,814,024arl-6 encodes an ADP-Ribosylation factor-Like member of the Ras superfamily of small GTP-binding proteins and is a predicted homolog of the human ARL6 gene, identified as the gene that underlies Bardet-Biedl syndrome type 3; GFP-tagged ARL-6 undergoes intraflagellar transport (IFT) in the ciliary axoneme, implicating ARL-6 in ciliary transport; arl-6 is expressed in amphid and phasmid ciliated sensory neurons.
34C03A7.12C03A7.12n/achrV 5,179,902contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
35F34H10.1F34H10.1n/achrX 9,626,427contains similarity to Homo sapiens ubiquitin and ribosomal protein S27a precursor; ENSEMBL:ENSP00000272317
36K02H11.4K02H11.4n/achrV 1,529,803contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
37bbs-5R01H10.6n/achrIII 10,260,159C. elegans BBS-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07289 Protein of unknown function (DUF1448) contains similarity to Interpro domains IPR006606 (Protein of unknown function DUF1448), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase), IPR014003 (Protein of unknown function DM16)
38T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
39Y57A10C.8Y57A10C.8n/achrII 12,428,881contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002355 (Multicopper oxidase, copper-binding site)
40K08H2.2K08H2.2n/achrX 13,234,539contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0144; ENSEMBL:ENSP00000271877
41F47H4.2F47H4.2n/achrV 17,356,736This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
42F37E3.2F37E3.2n/achrI 6,427,369contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
43Y41C4A.13Y41C4A.13n/achrIII 11,735,378contains similarity to Homo sapiens Rabconnectin; ENSEMBL:ENSP00000251076
44F53G2.1F53G2.1n/achrII 2,492,698contains similarity to Interpro domain IPR001611 (Leucine-rich repeat)
45Y37D8A.4Y37D8A.4n/achrIII 12,837,949contains similarity to Pfam domain PF00017 SH2 domain contains similarity to Interpro domain IPR000980 (SH2 motif)
46T02G6.1T02G6.1n/achrI 11,796,907contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4U4
47str-123T22H6.4n/achrX 12,790,964C. elegans STR-123 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48Y44A6D.3Y44A6D.3n/achrV 20,786,983contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
49F59B2.9F59B2.9n/achrIII 9,011,467This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
50C40A11.4C40A11.4n/achrII 2,138,139contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)