UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y116A8A.4Y116A8A.40chrIV 16,823,640contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
2mfb-1DY3.6n/achrI 8,782,569This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
3F59D6.6F59D6.6n/achrV 3,036,408contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
4C03H5.7C03H5.7n/achrII 381,414contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA)
5B0034.2B0034.2n/achrII 5,944,245
6W03G9.5W03G9.5n/achrI 4,969,127contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
7unc-4F26C11.2n/achrII 9,898,980The unc-4 gene encodes a paired-class homeodomain protein with homologs in Drosophila and vertebrates; UNC-4 is required for establishing the identity of the A class motor neurons DA and VA, and is thus required for movement, axon guidance, and synapse formation; UNC-4 is negatively regulated by VAB-7, and UNC-4 activity requires UNC-37; unc-4 is expressed in the A-type motor neurons, DA and VA, the six VC motor neurons that innervate the vulval muscles, and the three SAB motor neurons; unc-4 is also expressed in the pharyngeal I5 motor neuron and the AVF neurons in the retrovesicular ganglion.
8T02H6.5T02H6.5n/achrII 687,130contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
9srx-62K09D9.10n/achrV 3,995,344C. elegans SRX-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
10F56F11.1F56F11.1n/achrIII 2,892,177
11str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12K04F1.11K04F1.11n/achrV 1,660,979contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
13tsp-18F59G1.2n/achrII 5,905,416C. elegans TSP-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
14W07G1.1W07G1.1n/achrII 13,938,717contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
15C07B5.3C07B5.3n/achrX 9,522,844
16C31E10.4C31E10.4n/achrX 13,989,751
17Y26D4A.9Y26D4A.9n/achrI 13,088,824contains similarity to Pfam domain PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral contains similarity to Interpro domains IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR004868 (DNA-directed DNA polymerase, family B, mitochondria/virus)
18F58D12.3F58D12.3n/achrV 14,062,015contains similarity to Interpro domain IPR009091 (Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II)
19gcy-2R134.2n/achrII 9,509,771gcy-2 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; as loss of gcy-2 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; by sequence similarity, however, GCY-2 can be predicted to function in chemosensory signal transduction.
20C31B8.2C31B8.2n/achrV 2,917,112contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
21srbc-48F54B8.6n/achrV 15,820,807C. elegans SRBC-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22hlh-14C18A3.8n/achrII 5,738,759hlh-14 encodes a basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor that is one of five C. elegans Achaete-Scute family homologs; HLH-14 activity is required generally for normal egg-laying, movement, body morphology, and larval development; more specifically, HLH-14 is required for proper neuronal development, particularly for regulation of the asymmetric cell division that gives rise to the PVQ/HSN/PHB neuroblasts and for normal differentiation of these neuroblast descendants, including their cell division patterns, migrations, and neurotransmitter expression; in specifying neuronal cell fates, genetic evidence suggests that hlh-14 acts together with hlh-2, which encodes the C. elegans E/Daughterless ortholog; HLH-14 is expresed exclusively in the embryo and detected in the left and right PVQ/HSN/PHB neuroblasts and their descendants, as well as in other cells identified, tentatively, as anterior neuroblasts and posterior neuroblasts such as Caapa.
23T04G9.1T04G9.1n/achrX 792,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region)
24C33G8.2C33G8.2n/achrV 7,011,095contains similarity to Interpro domains IPR002038 (Osteopontin), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit)
25C56G2.5C56G2.5n/achrIII 6,323,209contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB)
26C36B7.3C36B7.3n/achrX 7,101,897
27str-97F10A3.8n/achrV 16,154,443C. elegans STR-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28C01A2.6C01A2.6n/achrI 13,382,132contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54BK4
29F13H8.9F13H8.9n/achrII 6,280,371contains similarity to Pfam domain PF00266 Aminotransferase class-V contains similarity to Interpro domains IPR016454 (Cysteine desulphurase, NifS), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
30F54H5.3F54H5.3n/achrII 6,622,759contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
31pptr-1W08G11.4n/achrV 16,362,503C. elegans PPTR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01603 Protein phosphatase 2A regulatory B subunit (B56 family) contains similarity to Interpro domains IPR002554 (Protein phosphatase 2A, regulatory B subunit, B56), IPR016024 (Armadillo-type fold)
32C50E3.7C50E3.7n/achrV 7,595,623contains similarity to Interpro domain IPR001499 (Fungal pheromone STE3 GPCR)
33R07C3.10R07C3.10n/achrII 910,744
34spe-4ZK524.1n/achrI 7,455,774spe-4 encodes a transmembrane protein that is a divergent member of the presenilin family of proteins that have been implicated in early-onset Alzheimer's disease (OMIM:104300); spe-4 activity is required for proper formation and function of the fibrous body-membranous organelles that are asymmetrically localized to spermatids during spermatogeneis; spe-4 is also required for proper partitioning of tubulin as spermatids bud from the residual body; spe-4 localizes to the fibrous body-membranous organelles of developing spermatocytes and also to the spermatozoon cell body.
35srx-76K12G11.5n/achrV 11,892,608C. elegans SRX-76 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36col-52D1007.2n/achrI 4,572,052C. elegans COL-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
37srd-70F48F5.4n/achrV 20,450,660C. elegans SRD-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38F28A12.1F28A12.1n/achrV 8,639,396contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
39srw-23F49A5.8n/achrV 16,874,669C. elegans SRW-23 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
40C04E7.1C04E7.1n/achrX 359,435
41B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918
42Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
43K09C6.1K09C6.1n/achrV 860,591contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
44E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
45H25P06.4H25P06.4n/achrI 11,307,702contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR001300 (Peptidase C2, calpain), IPR008906 (HAT dimerisation)
46srh-275C03G6.7n/achrV 7,353,665C. elegans SRH-275 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47F27C1.11F27C1.11n/achrI 5,439,915contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF03607 (Doublecortin) , PF01477 (PLAT/LH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR001024 (Lipoxygenase, LH2), IPR008976 (Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2), IPR003533 (Doublecortin), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
48F49H6.13F49H6.13n/achrV 17,008,999contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR001285 (Synaptophysin/synaptoporin)
49F22B3.7F22B3.7n/achrIV 11,418,098contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
50C18D1.2C18D1.2n/achrII 10,057,912contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)