UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Y113G7B.14Y113G7B.140chrV 20,223,220contains similarity to Pfam domains PF04851 (Type III restriction enzyme, res subunit) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006935 (Restriction endonuclease, type I, R subunit/Type III, Res subunit), IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal)
2ace-3Y48B6A.8n/achrII 14,207,809ace-3 encodes one of four C. elegans acetylcholinesterases (AChE); ACE-3 represents ~5% of the total AChE activity in C. elegans and in vitro, hydrolyzes acetylthio-, butyrylthio-, and propionylthiocholine substrates with equal efficiency; although loss-of-function mutations in ace-3 result in no obvious defects, animals doubly mutant with ace-1 or ace-2 have slight defects in backward locomotion and animals triply mutant for ace-1, -2, and -3 arrest as unhatched, yet fully developed, embryos; ace-3 is the downstream gene in an operon with a fourth AChE-encoding gene, ace-4, and transcriptional reporter fusions with ace-4 upstream sequences direct expression in pharyngeal muscles pm3, 4, 5, and 7, the two CAN (canal associated neuron) cells, midbody dorsal body wall muscles in larvae, and several neurons in the head and anal ganglion
3tag-191C53A5.4n/achrV 14,535,355C. elegans TAG-191 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
4Y38H6C.15Y38H6C.15n/achrV 20,530,900contains similarity to Interpro domain IPR006017 (Caldesmon)
5K07E12.2K07E12.2n/achrIII 6,737,547
6rpl-42C09H10.1n/achrII 11,093,225C. elegans RPL-42 protein ;
7H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
8C33E10.6C33E10.6n/achrX 17,268,242contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227I5
9fbxb-36F07E5.6n/achrII 2,061,815C. elegans FBXB-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
10F55H12.2F55H12.2n/achrI 8,868,112contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Tyrosine specific protein phosphatase)
11lgc-25R03E1.3n/achrX 14,160,175C. elegans LGC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
12C08G5.2C08G5.2n/achrII 740,228
13F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
14tag-141C30H6.2n/achrIV 17,365,684tag-141/C30H6.2 encodes a putative zinc transporter orthologous to human SLC39A4 (OMIM:607059, mutated in acrodermatitis enteropathica).
15B0207.7B0207.7n/achrI 5,946,551contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
16W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
17try-7ZC581.6n/achrI 6,642,054C. elegans TRY-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
18W01B11.1W01B11.1n/achrI 3,300,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
19K06A1.2K06A1.2n/achrII 6,445,339
20Y7A5A.8Y7A5A.8n/achrX 15,823,201contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IL30
21Y47H9B.2Y47H9B.2n/achrI 11,745,783contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
22F23C8.8F23C8.8n/achrI 2,431,177contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
23Y48A6B.8Y48A6B.8n/achrIII 11,028,225contains similarity to Interpro domains IPR003547 (Serine/threonine protein kinase, yersinia), IPR013022 (Xylose isomerase-like, TIM barrel)
24T20H4.2T20H4.2n/achrIII 7,242,074contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
25C44F1.2C44F1.2n/achrIII 3,769,375contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
26kcc-3K02A2.3n/achrII 7,428,601C. elegans KCC-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR000076 (K-Cl co-transporter), IPR004841 (Amino acid permease-associated region)
27aha-1C25A1.11n/achrI 10,195,452aha-1 encodes an ortholog of human aryl-hydrocarbon receptor nuclear translocator; interacts with AHR-1 and HIF-1 in vitro, requires HIF-1 for proper localization, and is expressed ubiquitously.
28R01E6.5R01E6.5n/achrX 13,537,467contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
29C36F7.5C36F7.5n/achrI 9,575,404contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR003979 (Tropoelastin), IPR013286 (Annexin, type VII)
30C48E7.8C48E7.8n/achrI 6,267,364contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
31C03B1.6C03B1.6n/achrX 6,350,637
32ugt-43F01D4.1n/achrIV 10,466,113C. elegans UGT-43 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
33T22B2.7T22B2.7n/achrX 3,909,459
34R09H10.2R09H10.2n/achrIV 10,606,027contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
35C04G2.2C04G2.2n/achrIV 10,091,506contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
36F41F3.1F41F3.1n/achrV 4,655,174
37T06E4.5T06E4.5n/achrV 9,631,723contains similarity to Interpro domains IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein), IPR001266 (Ribosomal protein S19e)
38F58G1.9F58G1.9n/achrII 12,924,971contains similarity to Homo sapiens Adapter-related protein complex 4 mu 1 subunit; SW:O00189
39T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
40spe-9C17D12.6n/achrI 11,584,385spe-9 encodes an EGF repeat-containing protein with a short intracellular domain; SPE-9 is required autonomously in sperm for fertilization, and by homology, likely mediates an adhesive or signaling event necessary for proper oocyte fertilization; spe-9 mRNA is detected solely in animals that are engaged in spermatogenesis; in spermatids, SPE-9 is found at or near the cell surface; following sperm activation, SPE-9 is found primarily on the pseudopod.
41F52F10.3F52F10.3n/achrV 1,540,095contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
42F39E9.4F39E9.4n/achrII 3,284,898F39E9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F39E9.4 has no clear orthologs in other organisms.
43srx-78C01G10.3n/achrV 15,096,226C. elegans SRX-78 protein
44K11C4.2K11C4.2n/achrV 6,895,906contains similarity to Pfam domain PF03006 Haemolysin-III related contains similarity to Interpro domain IPR004254 (Hly-III related proteins)
45T19D2.1T19D2.1n/achrX 3,935,349contains similarity to Pfam domains PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) (4), PF01421 (Reprolysin (M12B) family zinc metalloprotease) contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR013273 (Peptidase M12B, ADAM-TS), IPR001590 (Peptidase M12B, ADAM/reprolysin)
46T15B12.2T15B12.2n/achrIII 5,300,917contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
47K07D4.6K07D4.6n/achrII 4,017,758contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG31439-PA;; FLYBASE:CG31439
48F47B3.4F47B3.4n/achrI 3,961,620contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR003267 (Small proline-rich), IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
49F37E3.3F37E3.3n/achrI 6,430,598contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
50T05A8.1T05A8.1n/achrII 2,709,077