UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W06D4.3W06D4.34e-156chrI 9,059,663contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
2snf-2F55H12.1n/achrI 8,873,592C. elegans SNF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
3C34D4.3C34D4.3n/achrIV 7,153,905contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
4C37A2.3C37A2.3n/achrI 6,785,976contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
5D2062.6D2062.6n/achrII 2,619,582contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
6F44G4.5F44G4.5n/achrII 8,999,996contains similarity to Anabaena sp Endopeptidase Clp ATP-binding chain B.; TR:Q8YM56
7F58F12.3F58F12.3n/achrII 6,390,234
8C53B4.2C53B4.2n/achrIV 8,966,964contains similarity to Plasmodium vivax Sperm-specific protein Don juan, putative.; TR:A5K197
9ZC412.5ZC412.5n/achrV 14,874,791
10C17C3.11C17C3.11n/achrII 5,538,392contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
11ZK84.5ZK84.5n/achrII 6,016,343
12C54D10.4C54D10.4n/achrV 12,420,859contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
13F41G3.5F41G3.5n/achrII 6,748,034contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
14F11G11.5F11G11.5n/achrII 4,858,520contains similarity to Interpro domains IPR003267 (Small proline-rich), IPR000694 (Proline-rich region)
15spe-9C17D12.6n/achrI 11,584,385spe-9 encodes an EGF repeat-containing protein with a short intracellular domain; SPE-9 is required autonomously in sperm for fertilization, and by homology, likely mediates an adhesive or signaling event necessary for proper oocyte fertilization; spe-9 mRNA is detected solely in animals that are engaged in spermatogenesis; in spermatids, SPE-9 is found at or near the cell surface; following sperm activation, SPE-9 is found primarily on the pseudopod.
16F26D2.10F26D2.10n/achrV 16,427,124contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
17ent-3K02E11.1n/achrV 14,234,164C. elegans ENT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domain IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
18C55C3.3C55C3.3n/achrIV 5,686,761contains similarity to Trypanosoma cruzi Trans-sialidase, putative.; TR:Q4E0H9
19F47B3.2F47B3.2n/achrI 3,970,840contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
20C05D2.3C05D2.3n/achrIII 5,616,047C05D2.3 generally resembles aromatic-L-amino-acid/L-histidine decarboxylases; however, its predicted protein sequence lacks six residues critical for AADC function; C05D2.3 is dispensable in mass RNAi assays.
21ssq-3ZC477.1n/achrIV 7,112,230C. elegans SSQ-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001553 (RecA bacterial DNA recombination), IPR013286 (Annexin, type VII)
22srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
23T22C1.9T22C1.9n/achrI 7,959,350contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nuclear Assembly Factor; SGD:YNL124W
24K02F6.3K02F6.3n/achrII 2,547,902contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
25ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
26rnh-1.1ZK1290.6n/achrII 7,526,915C. elegans RNH-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00075 RNase H contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold), IPR002156 (Ribonuclease H)
27Y38H8A.4Y38H8A.4n/achrIV 13,471,382contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28C07G1.6C07G1.6n/achrIV 8,209,489
29F44D12.3F44D12.3n/achrIV 10,022,456contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
30C09B9.4C09B9.4n/achrIV 5,032,484contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
31C03B8.3C03B8.3n/achrIII 7,712,627
32C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
33K08C9.1K08C9.1n/achrI 11,485,648
34ZK262.4ZK262.4n/achrV 18,424,010contains similarity to Arabidopsis thaliana Similarity to salt-inducible protein.; TR:Q9LVA2
35F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
36F53G12.8F53G12.8n/achrI 114,244contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
37C09F9.1C09F9.1n/achrII 14,698,971contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
38tba-6F32H2.9n/achrI 8,996,289C. elegans TBA-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
39F38A5.8F38A5.8n/achrIV 6,600,170
40C03B8.1C03B8.1n/achrIII 7,716,961
41H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
42T02H6.7T02H6.7n/achrII 683,000contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
43F18A1.1F18A1.1n/achrII 7,687,417
44sri-66F28B1.6n/achrV 17,060,972C. elegans SRI-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45F59C6.3F59C6.3n/achrI 10,524,961contains similarity to Rhizobium meliloti Hypothetical membrane protein SMb20625.; TR:Q92TI1
46C28C12.1C28C12.1n/achrIV 8,502,192contains similarity to Interpro domain IPR002217 (Lipoprotein LPP20)
47C48B6.4C48B6.4n/achrI 6,890,348contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
48C47A4.3C47A4.3n/achrIV 13,741,621contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
49F55D12.6F55D12.6n/achrI 7,902,571contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001865 (Ribosomal protein S2), IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
50C38C6.5C38C6.5n/achrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)