UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W06A7.4W06A7.44e-164chrV 14,826,907contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
2K03H6.5K03H6.5n/achrIV 1,531,807contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
3T27D1.3T27D1.3n/achrIII 3,684,552contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
4C50B8.5C50B8.5n/achrV 13,582,800contains similarity to Candida albicans Hypothetical membrane protein.; TR:O94057
5srxa-1W07A8.1n/achrV 20,728,034C. elegans SRXA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
6C56A3.3C56A3.3n/achrV 13,533,300C56A3.3 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C56A3.3 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
7wht-6T26A5.1n/achrIII 6,473,428C. elegans WHT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF01061 (ABC-2 type transporter) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR013525 (ABC-2 type transporter)
8R08C7.5R08C7.5n/achrIV 4,431,281contains similarity to Pfam domain PF03941 Inner centromere protein, ARK binding region contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR005635 (Inner centromere protein, ARK binding region)
9BE10.4BE10.4n/achrIII 12,815,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
10kcc-1R13A1.2n/achrIV 7,215,841C. elegans KCC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR000076 (K-Cl co-transporter), IPR004841 (Amino acid permease-associated region), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
11ZK524.4ZK524.4n/achrI 7,463,889contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
12H35B03.1H35B03.1n/achrIV 5,727,641
13F07G6.2F07G6.2n/achrX 1,728,163
14F57C12.2F57C12.2n/achrX 548,426contains similarity to Pfam domain PF04670 Gtr1/RagA G protein conserved region contains similarity to Interpro domains IPR009053 (Prefoldin), IPR006762 (Gtr1/RagA G protein)
15C38C3.7C38C3.7n/achrV 1,502,860contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) (2), PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
16K10C9.4K10C9.4n/achrV 1,051,572contains similarity to Interpro domain IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
17acr-7T09A5.3n/achrII 7,847,659acr-7 encodes an alpha-7-like homomer-forming subunit of the nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) superfamily which encode ligand-gated ion channels that regulate fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; ACR-7 is expressed pharyngeal muscle and in tail neurons distal to the anus, and is a member of the ACR-16-like group of nAChR subunits.
18F21D9.2F21D9.2n/achrV 19,259,859contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:O77336
19C56E6.6C56E6.6n/achrII 6,542,233contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
20pqn-2AC3.4n/achrV 10,383,199The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
21gcy-21F22E5.3n/achrII 2,662,347gcy-21 is predicted to encode a guanylate cyclase.
22gcy-18ZK896.8n/achrIV 12,863,005gcy-18 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-23, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-18 functions redundantly with gcy-8 and gcy-23, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, microarray experiments indicate that gcy-18 expression is induced in daf-16(RNAi); daf-2(RNAi) double mutants and repressed in daf-2(RNAi) mutants, suggesting that GCY-18 activity may contribute to a shortened lifespan; consistent with this, loss of gcy-18 activity via RNAi does result in lifespan extension; GCY-18 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
23nas-14F09E8.6n/achrIV 13,172,108nas-14 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-14::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx.
24gck-2ZC404.9n/achrV 6,790,540C. elegans GCK-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00780 (CNH domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001180 (Citron-like), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
25srxa-15Y44A6B.2n/achrV 20,638,710C. elegans SRXA-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
26T28D6.7T28D6.7n/achrIII 11,345,403contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
27C01B12.5C01B12.5n/achrII 10,817contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domains IPR000615 (Bestrophin), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein)
28Y56A3A.2Y56A3A.2n/achrIII 11,856,255contains similarity to Pfam domain PF02163 Peptidase family M50 contains similarity to Interpro domains IPR008915 (Peptidase M50), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001193 (Peptidase M50, mammalian sterol-regulatory element binding protein)
29C33E10.5C33E10.5n/achrX 17,276,148contains similarity to Interpro domain IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
30acy-3C44F1.5n/achrIII 3,778,374acy-3 encodes a predicted member of the adenylyl cyclase family with highest similarity to human adenylate cyclase type 5; expressed in the support cells of ciliated neurons, in the head and tail ganglia, in two pairs of neurons in the retrovesicular ganglia, and in the spermatheca.
31F32D1.3F32D1.3n/achrV 4,355,654contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (3), PF08409 (Domain of unknown function (DUF1736)) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (6)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013618 (Region of unknown function DUF1736), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
32C32H11.4C32H11.4n/achrIV 12,922,267contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
33F25B3.2F25B3.2n/achrV 9,578,510contains similarity to Lactococcus lactis Oligopeptide transport system permease protein oppC.; SW:OPPC_LACLA
34sre-26Y57A10C.4n/achrII 12,419,774C. elegans SRE-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
35C04E7.1C04E7.1n/achrX 359,435
36rab-14K09A9.2n/achrX 15,605,871rab-14 encodes a member of the Rab GTPase family.
37Y1A5A.2Y1A5A.2n/achrIII 3,984,495contains similarity to Corynebacterium efficiens Putative nitrate transport protein.; TR:Q8FPW8
38T20D3.11T20D3.11n/achrIV 9,349,648contains similarity to Anopheles gambiae str PEST AGAP009276-PA (Fragment).; TR:Q7PVH5
39F38E11.4F38E11.4n/achrIV 9,455,287contains similarity to Pfam domains PF00100 (Zona pellucida-like domain) , PF00024 (PAN domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
40F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
41srw-140C03A7.3n/achrV 5,166,467C. elegans SRW-140 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
42F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
43Y7A5A.6Y7A5A.6n/achrX 15,798,435contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Putative transcriptional regulatory protein, phd finger.; TR:Q9HDV4
44C44C10.10C44C10.10n/achrX 11,690,474contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Homolog of the human adrenoleukodystrophy transporter; forms a heterodimer with Pxa1p of two half ATP-binding cassette transporters in the peroxisome membrane; SGD:YKL188C
45srd-15C04E6.10n/achrV 5,905,617C. elegans SRD-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46C05C10.1C05C10.1n/achrII 9,918,735contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
47ins-24ZC334.3n/achrI 14,031,394ins-24 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-24 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans, but as loss of INS-24 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of INS-24 in C. elegans development is not yet clear.
48F26A1.6F26A1.6n/achrIII 4,816,522contains similarity to Lumbricus rubellus Amine oxidase-like protein (Fragment).; TR:Q94610
49F16H6.6F16H6.6n/achrV 18,205,786contains similarity to Anthyllis vulneraria subsp lapponica Maturase-like protein.; TR:Q8HUG8
50Y113G7B.24Y113G7B.24n/achrV 20,231,897contains similarity to Pfam domain PF05916 Synthetic lethal mutants of dpb11-1 five contains similarity to Interpro domain IPR008591 (GINS complex, Sld5 component)