UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W05H9.2W05H9.20chrX 6,269,009
2cdh-3ZK112.7n/achrIII 7,747,815cdh-3 encodes a member of the cadherin superfamily that affects morphogenesis of tail epithelia and excretory function; expressed predominantly in developing epithelial cells, and also expressed in the AC, excretory cell, various neurons, and vulval cells during different stages of development.
3srg-3C18F10.6n/achrIII 6,269,673C. elegans SRG-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
4rba-1K07A1.11n/achrI 9,617,307C. elegans RBA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
5R144.5R144.5n/achrIII 5,000,320contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Smith-Magenis syndrome chromosomal region candidate gene 8 protein; ENSEMBL:ENSP00000379048
6F33E11.3F33E11.3n/achrV 302,371contains similarity to Interpro domain IPR015988 (STAT transcription factor, coiled coil)
7K06A5.1K06A5.1n/achrI 6,475,395contains similarity to Xenopus laevis MGC52985 protein.; TR:Q7ZWX1
8C33A12.12C33A12.12n/achrIV 9,483,553contains similarity to Interpro domains IPR000225 (Armadillo), IPR016024 (Armadillo-type fold)
9srx-58C29F3.6n/achrV 15,353,194C. elegans SRX-58 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
10gcy-34M04G12.3n/achrV 13,384,440gcy-34 encodes a predicted soluble guanylyl cyclase that is expressed in four candidate sensory neurons connected to the pseudocoelom, URXL, URXR, AQR, and PQR; as loss of gcy-34 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-34 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; GCY-34 expression in neurons connected to the pseudocoelom suggests, however, that GCY-34 may play a role in fluid homeostasis.
11Y52B11A.7Y52B11A.7n/achrI 11,022,105contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
12F58B6.1F58B6.1n/achrIII 1,114,111contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
13C32B5.9C32B5.9n/achrII 955,198
14knl-2K06A5.4n/achrI 6,462,350C. elegans KNL-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF09133 SANTA (SANT Associated) contains similarity to Interpro domain IPR015216 (SANT associated)
15kin-29F58H12.1n/achrX 2,848,198kin-29 encodes a serine/threonine kinase with significant homology in the kinase domain to the AMP-activated protein kinase (AMPK) and SNF1 kinases; the AMP-kinase cascade is activated by cellular stresses that deplete ATP; AMP-kinase is believed to protect the mammalian cell by 'switching off' ATP-consuming pathways like fatty acid synthesis, by phosphorylating key regulatory enzymes, and switching on alternative pathways for ATP generation; kin-29 is involved in regulating the expression of chemosensory receptors and entry into the daur pathway; kin-29 also affects body size via interaction with the Sma/Mab pathway and lifespan, with mutants exhibiting a smaller body size and increased life span; a functional KIN-29-GFP fusion protein is expressed in sensory neurons and many other cell types, and localizes to the cytoplasm; under conditions of cellular stress like heat shock and starvation, KIN-29-GFP translocates to the nucleus.
16F53F4.12F53F4.12n/achrV 13,626,710contains similarity to Plasmodium falciparum Histidine-rich protein.; SW:HRP3_PLAFS
17ZK1128.1ZK1128.1n/achrIII 10,113,863contains similarity to Pfam domain PF02636 Uncharacterized ACR, COG1565 contains similarity to Interpro domain IPR003788 (Protein of unknown function DUF185)
18C31B8.12C31B8.12n/achrV 2,926,103contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
19T10B5.2T10B5.2n/achrV 1,849,449
20ubc-16Y54E5B.4n/achrI 14,822,998C. elegans UBC-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00179 Ubiquitin-conjugating enzyme contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like)
21C33H5.7C33H5.7n/achrIV 7,775,184contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
22R03G8.4R03G8.4n/achrX 13,102,677contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
23his-5F45F2.3n/achrV 8,535,370his-5 encodes an H4 histone.
24set-4C32D5.5n/achrII 6,330,534set-4 encodes a putative histone H4 lysine-20 methyltransferase; SET-4 is orthologous to Drosophila SUV4-20, and to human SUV420H1 (OMIM:610881) and SUV420H2; neither set-4(n4600) nor set-4(RNAi) have any obvious phenotypes.
25F31A9.2F31A9.2n/achrX 1,795,240
26fbxb-51K05F6.3n/achrII 1,552,094C. elegans FBXB-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
27hst-1F08B4.6n/achrIV 8,689,875C. elegans HST-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00685 Sulfotransferase domain contains similarity to Interpro domain IPR000863 (Sulphotransferase)
28T27A8.1T27A8.1n/achrX 16,052,166T27A8.1 encodes a putative metallocarboxypeptidase orthologous to human AEBP1 (OMIM:602981) and carboxypeptidase D, E, M, N, X2, and Z precursors; T27A8.1 and its human orthologs, along with other proteins, comprise an M14B peptidase subfamily; T27A8.1 has no obvious function in mass RNAi assays.
29T07F10.3T07F10.3n/achrV 12,869,009contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
30T09B9.5T09B9.5n/achrX 9,778,986contains similarity to Streptococcus pneumoniae Hypothetical protein.; TR:P96479
31F52G3.3F52G3.3n/achrX 16,946,368contains similarity to Medicago truncatula Putative uncharacterized protein.; TR:A2Q378
32C31E10.6C31E10.6n/achrX 13,997,720contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YKR095W
33H22K11.3H22K11.3n/achrX 6,783,682contains similarity to Candida albicans Hyphally-regulated protein precursor.; SW:P46591
34F25H9.1F25H9.1n/achrV 13,454,521contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
35nac-2R107.1n/achrIII 9,040,048nac-2 encodes a high affinity sodium-coupled citrate transporter that is orthologous to the mammalian citrate transporter NaCT and is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy; when expressed in a heterologous system, NAC-2 exhibits high affinity sodium/citrate and sodium/succinate cotransporter activity, although the transport rate for citrate is much higher than that for succinate; nac-2::gfp reporter fusions are expressed in the intestine, from early larval stages through adulthood; the effects of nac-2(RNAi) are variable, with reports of a 19% increase in lifespan accompanied by decreased body size and fat content in affected animals and reports of no apparent decrease in average lifespan.
36cgr-1T27A10.7n/achrX 3,598,867C. elegans CGR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR009038 (GOLD), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
37snx-3W06D4.5n/achrI 9,064,058C. elegans SNX-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00787 PX domain contains similarity to Interpro domain IPR001683 (Phox-like)
38C08A9.9C08A9.9n/achrX 17,107,104contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
39sra-33B0304.6n/achrII 4,535,979C. elegans SRA-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
40T12G3.4T12G3.4n/achrIV 12,049,069contains similarity to Pfam domain PF03088 Strictosidine synthase contains similarity to Interpro domains IPR004141 (Strictosidine synthase), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like)
41C33F10.2C33F10.2n/achrII 4,830,501contains similarity to Pfam domains PF00069 (Protein kinase domain) , PF00566 (TBC domain) contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
42col-70H17B01.2n/achrII 1,471,156C. elegans COL-70 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
43C29F9.12C29F9.12n/achrIII 121,876
44prx-14R07H5.1n/achrIV 11,183,588C. elegans PRX-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF04695 Peroxisomal membrane anchor protein (Pex14p) conserved region contains similarity to Interpro domain IPR006785 (Peroxisome membrane anchor protein Pex14p, N-terminal)
45C33H5.8C33H5.8n/achrIV 7,778,475contains similarity to Pfam domain PF00515 Tetratricopeptide repeat contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
46T22C1.3T22C1.3n/achrI 7,939,331contains similarity to Pfam domain PF06728 GPI transamidase subunit PIG-U contains similarity to Interpro domain IPR009600 (GPI transamidase subunit PIG-U)
47ZK1240.3ZK1240.3n/achrII 2,321,141contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
48C53D6.4C53D6.4n/achrIV 9,020,038contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain)
49pri-2W02D9.1n/achrI 12,530,247pri-2 encodes a homolog of the DNA polymerase alpha-primase subunit C that is required in embryos for the normal timing of embryonic cell divisions (much as DIV-1 is) and for normal mitosis in the germline.
50R09D1.6R09D1.6n/achrII 9,453,412contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)