UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W05F2.7W05F2.70chrI 3,357,913contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
2sra-2AH6.6n/achrII 9,529,242C. elegans SRA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
3skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
4dnj-9F11G11.7n/achrII 4,854,916This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
5nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6E01G4.5E01G4.5n/achrII 13,473,085contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
7F22G12.1F22G12.1n/achrI 13,140,448contains similarity to Interpro domain IPR000423 (Flagellar protein FlgJ type-1)
8srx-17F55B12.8n/achrV 13,841,443C. elegans SRX-17 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
9C02E7.10C02E7.10n/achrV 4,931,908
10fbxa-7T20H9.1n/achrIII 2,250,698C. elegans FBXA-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
11sra-18F28C12.2n/achrI 12,692,935C. elegans SRA-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
12Y75B12B.8Y75B12B.8n/achrV 15,201,905contains similarity to Homo sapiens Xylosyltransferase I; ENSEMBL:ENSP00000261381
13C04B4.4C04B4.4n/achrX 12,291,546contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein involved in exit from mitosis; SGD:YJL076W
14T05H4.3T05H4.3n/achrV 6,444,929contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal)
15C35D10.12C35D10.12n/achrIII 4,873,622contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
16R06C1.2R06C1.2n/achrI 11,920,861contains similarity to Pfam domain PF00348 Polyprenyl synthetase contains similarity to Interpro domains IPR000092 (Polyprenyl synthetase), IPR008949 (Terpenoid synthase)
17srh-282T21D12.5n/achrIV 272,850C. elegans SRH-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18F56C3.5F56C3.5n/achrX 1,363,402
19F29G6.2F29G6.2n/achrX 11,510,328contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ43363 fis, clone NT2RP7017474; ENSEMBL:ENSP00000374260
20E02C12.9E02C12.9n/achrV 9,374,371contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
21srz-14K05D4.3n/achrV 16,184,163C. elegans SRZ-14 protein ;
22srg-28T09D3.2n/achrV 5,335,592C. elegans SRG-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
23str-64T28A11.1n/achrV 3,283,924C. elegans STR-64 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24srw-108R11G11.5n/achrV 528,386C. elegans SRW-108 protein ;
25ceh-33C10G8.7n/achrV 5,323,911ceh-33 encodes a Six/sine oculis class homeodomain transcription factor; preliminary RNAi experiments suggest that CEH-33 activity may be required for gonad development; a ceh-33::gfp reporter shows very weak pharyngeal expression in late embryos and early larvae.
26F10C2.3F10C2.3n/achrV 12,022,395contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
27srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28srh-28ZC404.5n/achrV 6,774,975C. elegans SRH-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29C34D4.14C34D4.14n/achrIV 7,139,438contains similarity to Pfam domains PF06701 (Mib_herc2) , PF07738 (Sad1 / UNC-like C-terminal) , PF02985 (HEAT repeat) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2), PF00632 (HECT-domain (ubiquitin-transferase)) contains similarity to Interpro domains IPR012919 (Sad1/UNC-like, C-terminal), IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR000569 (HECT), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR002110 (Ankyrin), IPR010606 (Mib-herc2), IPR016024 (Armadillo-type fold)
30C47F8.3C47F8.3n/achrI 12,315,930contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
31T07C12.8T07C12.8n/achrV 9,954,532contains similarity to Interpro domain IPR000998 (MAM)
32cyp-33C3F41B5.4n/achrV 2,243,821C. elegans CYP-33C3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
33B0496.4B0496.4n/achrIV 7,428,290contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
34F14F7.5F14F7.5n/achrIII 13,033,511contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
35Y51B9A.4Y51B9A.4n/achrII 9,408,334contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
36T22H9.1T22H9.1n/achrV 361,718contains similarity to Pfam domain PF06102 Domain of unknown function (DUF947) contains similarity to Interpro domain IPR009292 (Protein of unknown function DUF947)
37ZC376.1ZC376.1n/achrV 14,179,216contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
38gcy-33F57F5.2n/achrV 11,998,799gcy-33 encodes a soluble guanylyl cyclase; a gcy-33::GFP reporter is expressed in the ciliated BAG head sensory neurons.
39T26G10.1T26G10.1n/achrIII 9,405,416contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014014 (RNA helicase, DEAD-box type, Q motif), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
40srb-11F23F12.10n/achrIII 6,492,077C. elegans SRB-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
41twk-4ZK1067.5n/achrII 9,192,128C. elegans TWK-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
42kin-34R02C2.2n/achrV 245,158C. elegans KIN-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43C28G1.2C28G1.2n/achrX 8,837,092contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
44col-164T21D9.1n/achrX 2,094,123C. elegans COL-164 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008160 (Collagen triple helix repeat), IPR013286 (Annexin, type VII)
45K03H4.1K03H4.1n/achrV 13,151,458contains similarity to Helicobacter pylori Transposase OrfB.; TR:Q93C83
46C26C6.6C26C6.6n/achrI 7,506,305contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
47T24B8.4T24B8.4n/achrII 9,067,183contains similarity to Pfam domain PF02205 WH2 motif contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003124 (Actin-binding WH2)
48srd-27T26E4.12n/achrV 15,803,891C. elegans SRD-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49F31D5.4F31D5.4n/achrII 4,179,466contains similarity to Pfam domain PF01825 Latrophilin/CL-1-like GPS domain contains similarity to Interpro domain IPR000203 (GPS)
50srh-276F21A3.1n/achrV 15,530,042C. elegans SRH-276 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)