UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W04G3.1W04G3.10chrX 11,060,857contains similarity to Interpro domain IPR011038 (Calycin-like)
2C14F11.6C14F11.6n/achrX 6,238,566contains similarity to Pfam domain PF00908 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase contains similarity to Interpro domains IPR000888 (dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related), IPR011051 (Cupin, RmlC-type), IPR014710 (RmlC-like jelly roll fold)
3C06C3.4C06C3.4n/achrII 9,374,492contains similarity to Interpro domain IPR000276 (Rhodopsin-like GPCR superfamily)
4ZC328.1ZC328.1n/achrI 6,405,136
5ptr-4C45B2.7n/achrX 6,063,339ptr-4 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-4 is strongly required for normal molting from L4 to adult stages male tail development (a role conserved in C. briggsae); PTR-4 is also required for normal endocytosis of yolk by oocytes, adult alae formation, growth to full size, locomotion, and viability.
6T13C5.3T13C5.3n/achrX 6,179,650contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
7T14B4.5T14B4.5n/achrII 6,717,303
8T09B4.4T09B4.4n/achrI 6,168,285contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
9acl-10F55A11.5n/achrV 11,775,146C. elegans ACL-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01553 Acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
10R07G3.6R07G3.6n/achrII 7,604,709contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
11ZC190.4ZC190.4n/achrV 8,668,842contains similarity to Pfam domains PF07647 (SAM domain (Sterile alpha motif)) , PF00536 (SAM domain (Sterile alpha motif)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR013761 (Sterile alpha motif-type), IPR001660 (Sterile alpha motif SAM), IPR011510 (Sterile alpha motif homology 2)
12F30H5.3F30H5.3n/achrIII 508,704contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR008197 (Whey acidic protein, 4-disulphide core), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
13atf-2K08F8.2n/achrII 8,752,891C. elegans ATF-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07716 (Basic region leucine zipper) (2), PF00170 (bZIP transcription factor) contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor), IPR011616 (bZIP transcription factor, bZIP-1)
14F13B9.2F13B9.2n/achrX 8,286,170
15hog-1W06B11.4n/achrX 5,852,661hog-1 encodes a hedgehog-like protein, with a solitary Hint/Hog domain; the function of HOG-1's isolated Hint/Hog domain is unknown; in proteins where they coexist with other, N-terminal, domains, the Hint/Hog domain is predicted to cut its host protein into two halves and then covalently link cholesterol to the C-terminus of the N-terminal domain; HOG-1 is weakly required for normal molting; HOG-1 is also required for normal adult alae formation, growth to full size, cuticle adhesion, and locomotion; all of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
16dhs-29F27D9.6n/achrX 7,663,351C. elegans DHS-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF08659 (KR domain) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR013968 (Polyketide synthase, KR), IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
17F12F6.1F12F6.1n/achrIV 11,586,743contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Putative glycosidase of the cell wall, may have a role in cell wall architecture; SGD:YGR189C
18F26F12.4F26F12.4n/achrV 5,867,027
19F30A10.2F30A10.2n/achrI 9,479,884contains similarity to Staphylococcus aureus ATP-depentend DNA helicase.; TR:Q8NVT1
20F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
21sym-5C44H4.2n/achrX 14,579,420sym-5 encodes a predicted transmembrane protein that contains 13 contiguous leucine-rich repeats (LRRs) and that is similar to SYM-1, a secreted protein involved in muscle attachment; sym-5 activity appears to be required for embryogenesis and functionally overlaps with that of sym-1 and mec-8 in affecting muscle attachment; in addition, loss of sym-5 activity via RNA-mediated interference (RNAi) in a hypersensitized strain indicates that SYM-5 may also be required for locomotion, body morphology, and normal rates of postembryonic growth.
22F26G1.6F26G1.6n/achrII 4,778,310F26G1.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while F26G1.6 has no clear orthologs in other organisms, it falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
23ZK792.7ZK792.7n/achrIV 11,695,365contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domain IPR004843 (Metallophosphoesterase)
24che-14F56H1.1n/achrI 5,750,511che-14 encodes a protein with a sterol-sensing domain; CHE-14 protein is involved in the exocytotic secretion of lipid-modified proteins at the apical surface of certain epithelial cells.
25R07B1.3R07B1.3n/achrX 9,859,984contains similarity to Pfam domain PF01130 CD36 family contains similarity to Interpro domain IPR002159 (CD36 antigen)
26F54A5.1F54A5.1n/achrI 990,926contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR010982 (Lambda repressor-like, DNA-binding), IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
27C06A6.5C06A6.5n/achrIV 7,833,492contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
28clec-170F38A1.1n/achrIV 1,270,618C. elegans CLEC-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29unc-97F14D12.2n/achrX 5,593,799The unc-97 gene encodes a LIM domain-containing protein of the PINCH family that is highly similar to human LIMS1 (OMIM:602567) and LIMS2; UNC-97 functions as an adaptor protein important for assembly of muscle adherens junctions and the mechanosensory functions of the touch neurons; UNC-97 interacts with PAT-4/integrin-linked kinase and with UNC-98; UNC-97 colocalizes with PAT-3/beta integrin at dense bodies, focal adhesion-like muscle attachment structures.
30ZK1225.1ZK1225.1n/achrI 13,206,699contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
31R05D3.9R05D3.9n/achrIII 8,365,541contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold)
32R07B1.7R07B1.7n/achrX 9,869,453contains similarity to Candida albicans Chitinase 2 precursor (EC 3.2.1.14).; SW:CHI2_CANAL
33C32A3.2C32A3.2n/achrIII 3,629,439contains similarity to Homo sapiens Kinesin-like protein KIF14; ENSEMBL:ENSP00000236917
34C38C6.3C38C6.3n/achrII 14,633,822contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Hypothetical transmembrane protein.; TR:O74525
35T21D12.11T21D12.11n/achrIV 270,753contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Flocculin, putative.; TR:A2FIF9
36skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
37T19D7.3T19D7.3n/achrX 657,345contains similarity to Pfam domains PF02822 (Antistasin family) (3), PF00093 (von Willebrand factor type C domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR011061 (Proteinase inhibitor I14/I15, hirudin/antistatin), IPR008037 (Proteinase inhibitor I19, pacifastin), IPR006552 (VWC out), IPR004094 (Proteinase inhibitor I15, antistasin), IPR001007 (von Willebrand factor, type C)
38R05A10.6R05A10.6n/achrIV 14,167,109contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
39ZK829.3ZK829.3n/achrIV 11,944,493contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
40phg-1F27E5.4n/achrII 10,138,351C. elegans PHG-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02351 GDNF/GAS1 domain contains similarity to Interpro domain IPR016017 (GDNF/GAS1)
41F01G10.6F01G10.6n/achrIV 10,226,957contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
42F41C3.7F41C3.7n/achrII 4,730,652
43C07E3.10C07E3.10n/achrII 10,346,620contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Ring finger protein involved in the DNA damage response with possible recombination role; genetically identified by synthetic lethality with SGS1 (DNA helicase) and TOP3 (DNA topoisomerase); sporulation role; interacts with Slx8p and Lin1p; SGD:YDL013W
44F53H4.5F53H4.5n/achrX 15,883,542contains similarity to Pfam domain PF01342 SAND domain contains similarity to Interpro domains IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
45K07C11.4K07C11.4n/achrV 8,204,685contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
46C17F4.2C17F4.2n/achrII 3,249,035
47iftb-1K04G2.1n/achrI 8,027,270iftb-1 encodes the C. elegans ortholog of translation initiation factor 2 beta (eIF2beta); by homology, IFTB-1 is predicted to function in translation initiation and start codon recognition; loss of iftb-1 via RNAi indicates that iftb-1 activity is required for a number of processes including growth, development, and body morphogenesis; loss of iftb-1 activity in adult animals extends lifespan.
48crn-5C14A4.5n/achrII 10,593,065C. elegans CRN-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01138 3' exoribonuclease family, domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001247 (Exoribonuclease, phosphorolytic domain 1)
49pqn-26DY3.5n/achrI 8,774,608The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
50T19B10.5T19B10.5n/achrV 11,235,863T19B10.5 encodes a protein with partial similarity to human PERIAXIN (PRX; OMIM:605725), which when mutated leads to Dejerine-Sottas neuropathy.