UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W04E12.3W04E12.39.999999999999999e-27chrV 19,737,520contains similarity to Bacillus subtilis Nuclease sbcCD subunit C.; SW:SBCC_BACSU
2nhr-158C17E7.6n/achrV 3,872,180C. elegans NHR-158 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3B0507.5B0507.5n/achrV 8,754,261
4nhr-266F56H1.2n/achrI 5,738,931C. elegans NHR-266 protein; contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
5ceh-28K03A11.3n/achrX 13,075,231A homeobox protein of the NK-2 family; it is expressed in a single pharyngeal neuron, M4.
6F34H10.1F34H10.1n/achrX 9,626,427contains similarity to Homo sapiens ubiquitin and ribosomal protein S27a precursor; ENSEMBL:ENSP00000272317
7fbxb-99Y8A9A.5n/achrII 3,792,968This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
8magi-1K01A6.2n/achrIV 11,721,610C. elegans MAGI-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) (4), PF00397 (WW domain) (2), PF00625 (Guanylate kinase) contains similarity to Interpro domains IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR002349 (WW), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
9F53F4.1F53F4.1n/achrV 13,585,118contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
10F55C9.6F55C9.6n/achrV 19,295,191contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
11F07C4.11F07C4.11n/achrV 7,642,685contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
12T02G6.1T02G6.1n/achrI 11,796,907contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4U4
13ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
14fbxb-6F07E5.1n/achrII 2,066,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
15C12D5.4C12D5.4n/achrV 7,672,548
16spp-12T22G5.7n/achrV 13,890,091C. elegans SPP-12 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
17C44C10.6C44C10.6n/achrX 11,698,664contains similarity to Streptococcus pneumoniae GtrA family protein.; TR:Q97R28
18ilys-1C45G7.1n/achrIV 2,470,894C. elegans ILYS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
19nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
20T20D4.16T20D4.16n/achrV 3,394,536
21C45G3.4C45G3.4n/achrI 9,219,134contains similarity to Dictyostelium discoideum Prespore-specific protein (Fragment).; TR:O97140
22ZK643.7ZK643.7n/achrIII 8,925,977
23srg-55W09D12.2n/achrV 14,927,504C. elegans SRG-55 protein ;
24F01E11.3F01E11.3n/achrX 6,975,202
25C43H6.6C43H6.6n/achrX 2,397,074contains similarity to Pfam domains PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26C28H8.2C28H8.2n/achrIII 5,923,760
27C34D10.1C34D10.1n/achrX 8,030,420contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
28M162.6M162.6n/achrV 19,782,521contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
29F54D12.8F54D12.8n/achrII 1,396,527contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR003609 (Apple-like)
30srz-95Y102A5C.33n/achrV 16,992,941C. elegans SRZ-95 protein ;
31K01A11.1K01A11.1n/achrIII 3,429,872contains similarity to Dictyostelium discoideum PAXILLIN-like protein.; TR:Q8MML5
32F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
33fbxa-195R09B5.1n/achrV 1,435,696This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
34srz-6T21B4.1n/achrII 12,492,894C. elegans SRZ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
35math-10C16C4.15n/achrII 1,872,348C. elegans MATH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
36str-145F58G4.7n/achrV 8,097,583C. elegans STR-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37str-123T22H6.4n/achrX 12,790,964C. elegans STR-123 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39F37E3.2F37E3.2n/achrI 6,427,369contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
40sri-14M01G12.1n/achrI 12,135,356C. elegans SRI-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F54F3.3F54F3.3n/achrV 12,920,812contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
42srw-91K04F1.4n/achrV 1,680,088C. elegans SRW-91 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
43nhr-278ZK6.1n/achrV 409,173C. elegans NHR-278 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44asna-2F47G3.2n/achrX 2,383,478C. elegans ASNA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02374 Anion-transporting ATPase contains similarity to Interpro domain IPR003348 (Anion-transporting ATPase)
45gcy-29C04H5.3n/achrII 14,544,746C. elegans GCY-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF01094 (Receptor family ligand binding region) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor)
46pes-1T28H11.4n/achrIV 5,004,039C. elegans PES-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00250 Fork head domain contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR001766 (Fork head transcription factor)
47F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
48ZK822.2ZK822.2n/achrIV 11,922,736contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
49T16A1.5T16A1.5n/achrII 2,083,711
50F19B10.3F19B10.3n/achrII 3,664,939