UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W04A4.4W04A4.42e-128chrI 13,676,809contains similarity to Pfam domain PF00648 Calpain family cysteine protease contains similarity to Interpro domain IPR001300 (Peptidase C2, calpain)
2pha-2M6.3n/achrX 635,373pha-2 encodes a homeodomain protein that is orthologous to vertebrate Hex proteins required for the development of B lymphocytes and organs derived from foregut endoderm; in C. elegans, pha-2 is essential for proper development and morphogenesis of the pm5 pharyngeal muscles cells during late stages of embryogenesis; in regulating pm5 fate specification, PHA-2 appears to act downstream of the organ identity factor PHA-4, and upstream of ceh-22, whose expression it may negatively regulate in pm5; a rescuing PHA-2::GFP reporter is expressed in pharyngeal cells, intestinal-rectal cells, and postembryonic head neurons.
3C36C5.15C36C5.15n/achrV 3,168,358contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
4C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
5srd-5T19E7.5n/achrIV 5,673,565C. elegans SRD-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR004268 (Virulence factor MVIN-like)
6sri-45K07E8.9n/achrII 660,949C. elegans SRI-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7K10C9.1K10C9.1n/achrV 1,077,400
8lgc-1T05B4.1n/achrV 4,136,911C. elegans LGC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
9F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
10srg-39T19C4.2n/achrV 11,151,861C. elegans SRG-39 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
11Y57A10B.2Y57A10B.2n/achrII 12,376,431contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
12srh-7K09D9.7n/achrV 4,009,007C. elegans SRH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13F35F10.13F35F10.13n/achrV 3,318,633contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
14ZK938.6ZK938.6n/achrII 9,844,266contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
15cyp-33C2C45H4.17n/achrV 2,185,028C. elegans CYP-33C2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
16Y26D4A.5Y26D4A.5n/achrI 13,076,809contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein SAV2385 (Hypothetical protein MW2305).; TR:Q99RP4
17F23B2.7F23B2.7n/achrIV 9,151,248contains similarity to Homo sapiens similar to Cylicin I (Multiple-band polypeptide I); ENSEMBL:ENSP00000331556
18Y56A3A.5Y56A3A.5n/achrIII 11,889,625contains similarity to Pfam domain PF01425 Amidase contains similarity to Interpro domains IPR000120 (Amidase signature enzyme), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
19T10B9.9T10B9.9n/achrII 9,775,421contains similarity to Avian adenovirus gal1 Orf2 protein.; TR:Q64786
20T15B7.10T15B7.10n/achrV 6,811,130contains similarity to Ostreococcus tauri Predicted CDS, putative cytoplasmic protein family member, with ascoiled coil-4 domain, of ancient origin (ISS).; TR:Q010X5
21T07A5.1T07A5.1n/achrIII 10,304,668contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
22snt-2F42G9.7n/achrIII 789,889C. elegans SNT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
23T11F1.8T11F1.8n/achrII 2,952,479contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
24Y49E10.25Y49E10.25n/achrIII 12,490,261contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
25F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
26nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
27str-151T03E6.1n/achrV 16,577,135C. elegans STR-151 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28F56C4.1F56C4.1n/achrIV 10,638,106contains similarity to Brachydanio rerio D121 protein (Fragment).; TR:Q90ZG9
29glr-3K10D3.1n/achrI 7,119,675glr-3 encodes a protein that contains a ligand-gated ion channel domain and a receptor family ligand binding domain with similarity to kainate-selective ionotropic glutamate receptor 2 (human GRIK2); expressed in the RIA neuron.
30C24A8.1C24A8.1n/achrX 4,323,582C24A8.1 encodes an homolog of mammalian D2 or D3 dopamine receptors, and a paralog of DOP-2/-3; C24A8.1 is expressed in the nervous system; because of its paralogy, C24A8.1 might act redundantly with DOP-2 to promote the basal slowing response to bacterial feeding, or it might account for the residual response to excess dopamine seen in triple dop-1/-2/-3 mutants; but C24A8.1 otherwise has no obvious function in RNAi assays of brood size, egg laying, pharyngeal pumping, locomotion, or male mating.
31srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32F22E5.12F22E5.12n/achrII 2,646,586contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
33srab-6C36C5.10n/achrV 3,151,224C. elegans SRAB-6 protein ;
34srh-102F40D4.11n/achrV 17,164,173C. elegans SRH-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35srw-84Y43F8A.4n/achrV 19,382,978C. elegans SRW-84 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36mrp-6F20B6.3n/achrX 4,182,153C. elegans MRP-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00664 (ABC transporter transmembrane region) (2), PF00005 (ABC transporter) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR011527 (ABC transporter, transmembrane region, type 1), IPR001140 (ABC transporter, transmembrane region), IPR009147 (Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
37elc-2W03H1.2n/achrX 1,777,746elc-2 encodes a protein containing a Skp1 dimerisation domain that has homology to human transcription elongation factor B (SIII), polypeptide I (15kD, elonginsC).
38srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39K01A11.2K01A11.2n/achrIII 3,426,861contains similarity to Xenopus laevis LOC495955 protein.; TR:Q5PQ79
40F11A5.4F11A5.4n/achrV 16,195,957contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR001019 (Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras)
41F40A3.7F40A3.7n/achrV 7,897,725contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42ncr-2F09G8.4n/achrIII 8,261,990ncr-2 encodes a homolog of human NPC1, which when mutated leads to Niemann-Pick disease, type C (OMIM:257220).
43sru-40R07B5.3n/achrV 9,833,347C. elegans SRU-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
44C32B5.7C32B5.7n/achrII 962,400contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
45srx-122F35F10.8n/achrV 3,296,984C. elegans SRX-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
46str-264C06B8.4n/achrV 15,491,810C. elegans STR-264 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47tag-117C01B7.4n/achrV 8,794,107C. elegans TAG-117 protein; contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) , PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) contains similarity to Interpro domains IPR011511 (Variant SH3), IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001452 (Src homology-3)
48F21E9.6F21E9.6n/achrX 1,356,015
49B0554.3B0554.3n/achrV 434,275
50C04F5.2C04F5.2n/achrV 5,094,981