UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W03F9.3W03F9.31e-41chrV 132,775
2tag-212T14D7.3n/achrII 8,859,305C. elegans TAG-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domain IPR001388 (Synaptobrevin)
3R07E5.6R07E5.6n/achrIII 4,399,849contains similarity to Interpro domains IPR005432 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha 2 subunit), IPR009149 (BR22)
4K02B12.6K02B12.6n/achrI 8,519,194contains similarity to Schistosoma mansoni Putative eggshell protein (Fragment).; SW:P08016
5K09F6.4K09F6.4n/achrII 2,263,817contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
6Y54E2A.5Y54E2A.5n/achrII 14,756,797
7T02H6.6T02H6.6n/achrII 683,947
8tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
9ZK849.5ZK849.5n/achrI 14,202,318contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
10F28H1.5F28H1.5n/achrI 3,979,010
11M70.2M70.2n/achrIV 2,243,378contains similarity to Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog; ENSEMBL:ENSP00000283003
12F59A3.8F59A3.8n/achrI 5,523,890contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
13C08F8.4C08F8.4n/achrIV 11,158,277contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
14F19C7.5F19C7.5n/achrIV 4,596,309
15H38K22.4H38K22.4n/achrIII 4,323,189contains similarity to Interpro domain IPR010070 ()
16C32D5.4C32D5.4n/achrII 6,322,171
17R11.2R11.2n/achrX 16,184,757contains similarity to Homo sapiens Chromosome-associated kinesin KIF4A; ENSEMBL:ENSP00000262784
18F14E5.3F14E5.3n/achrII 8,436,197contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
19T11G6.7T11G6.7n/achrIV 10,844,729contains similarity to Fundulus heteroclitus Lens major intrinsic protein.; TR:Q9PUE2
20W01B6.4W01B6.4n/achrIV 10,075,527contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
21Y43F8A.3Y43F8A.3n/achrV 19,379,196contains similarity to Pfam domain PF07859 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR017157 (Arylacetamide deacetylase), IPR013094 (Alpha/beta hydrolase fold-3)
22ZC581.2ZC581.2n/achrI 6,656,611contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
23R07C3.13R07C3.13n/achrII 927,201
24wht-9Y49E10.9n/achrIII 12,393,102C. elegans WHT-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF01061 (ABC-2 type transporter) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR013525 (ABC-2 type transporter)
25T22G5.1T22G5.1n/achrV 13,877,372contains similarity to Pfam domain PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family contains similarity to Interpro domain IPR004129 (Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)
26F58G1.9F58G1.9n/achrII 12,924,971contains similarity to Homo sapiens Adapter-related protein complex 4 mu 1 subunit; SW:O00189
27F01D4.3F01D4.3n/achrIV 10,474,640contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR005819 (Histone H5), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
28F49E11.7F49E11.7n/achrIV 13,054,029contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
29ent-3K02E11.1n/achrV 14,234,164C. elegans ENT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domain IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
30C49A1.2C49A1.2n/achrI 14,210,845contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
31C25G4.7C25G4.7n/achrIV 12,457,730contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
32K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
33D2045.5D2045.5n/achrIII 10,468,691contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
34R05D7.2R05D7.2n/achrI 12,166,865contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
35C14B1.3C14B1.3n/achrIII 3,704,316This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
36clec-236Y70C5C.5n/achrV 16,720,176C. elegans CLEC-236 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37srz-1F14F8.3n/achrV 16,676,674srz-1 encodes a predicted seven-pass G protein-coupled receptor; as loss of srz-1 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, the precise role of SRZ-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
38C55B7.10C55B7.10n/achrI 6,502,907contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
39B0457.4B0457.4n/achrII 8,911,392contains similarity to Bacteriophage phi-C31 Gp21.; TR:Q9ZX87
40R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
41F21H7.2F21H7.2n/achrV 16,228,334contains similarity to Homo sapiens Neurofilament heavy polypeptide; ENSEMBL:ENSP00000311997
42F22B5.5F22B5.5n/achrII 8,453,880contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
43twk-6F17C8.5n/achrIII 4,743,772twk-6 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-6 may, however, function redundantly with other TWK channels; TWK-6 is expressed in the hypodermis.
44Y40B1A.3Y40B1A.3n/achrI 13,356,226contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region)
45K08E7.4K08E7.4n/achrIV 12,570,933contains similarity to Plasmodium falciparum Gene 11-1 protein precursor.; TR:Q8I6U6
46ZK930.5ZK930.5n/achrII 11,882,963contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Phosphoserine phosphatase.; TR:O27663
47Y39A1A.18Y39A1A.18n/achrIII 10,692,438contains similarity to Methanosarcina mazei Transcriptional regulator, MerR family.; TR:Q8PSB2
48R11E3.1R11E3.1n/achrIV 4,790,837contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
49T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
50ZK1225.5ZK1225.5n/achrI 13,217,724