UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1W03D8.3W03D8.31e-21chrI 2,821,478contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
2C31H1.2C31H1.2n/achrIV 5,792,361contains similarity to Pfam domain PF02013 Cellulose or protein binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003616 (Post-SET zinc-binding region), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR002883 (Dockerin, cellulose-binding family V)
3Y41C4A.1Y41C4A.1n/achrIII 11,648,712contains similarity to Oryza sativa Putative aspartate kinase.; TR:Q851Z6
4skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
5Y47H9B.2Y47H9B.2n/achrI 11,745,783contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
6T02G6.2T02G6.2n/achrI 11,801,906contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9C9Y9
7Y113G7B.11Y113G7B.11n/achrV 20,209,977contains similarity to Naja atra Cardiotoxin 10 precursor.; TR:Q9W6W6
8F35B3.7F35B3.7n/achrX 17,038,997contains similarity to Homo sapiens Leucine zipper putative tumor suppressor 2; ENSEMBL:ENSP00000359240
9T09B4.3T09B4.3n/achrI 6,177,087
10try-6F48A9.3n/achrI 6,586,594C. elegans TRY-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
11sra-38T21H8.3n/achrX 13,898,963C. elegans SRA-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
12K06B4.3K06B4.3n/achrV 15,672,799contains similarity to Saccharomyces cerevisiae mRNA binding protein; SGD:YPR042C
13C44F1.2C44F1.2n/achrIII 3,769,375contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
14tag-19C09G9.4n/achrIV 8,875,605tag-19 superficially resembles aromatic-L-amino-acid/L-histidine decarboxylases; however, it is distantly related, being no closer to them than to glutamine decarboxylase/sphingosinge lyase (e.g., tag-38, spl-1); tag-19 thus might be termed a Pyridoxal-phosphate (PLP) dependent decarboxylase-like protei, but is missing the absolutely conserved Lys residue of all PLP-DCs (hence the -like would be needed); tag-19 is dispensable in mass RNAi assays.
15F25E5.7F25E5.7n/achrV 7,440,782contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
16F58G1.9F58G1.9n/achrII 12,924,971contains similarity to Homo sapiens Adapter-related protein complex 4 mu 1 subunit; SW:O00189
17nas-5T23H4.3n/achrI 9,887,167nas-5 encodes an astacin-like metalloprotease; loss of nas-5 activity in an RNAi hypersensitive strain results in axon guidance defects, including a failure of DD/VD motoneuron commissures to reach the dorsal cord, defasciculation of the dorsal nerve cord, and midline crossing defects in the ventral nerve cord.
18K02H11.6K02H11.6n/achrV 1,534,154contains similarity to Pfam domains PF00085 (Thioredoxin) , PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
19T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
20K10C9.7K10C9.7n/achrV 1,066,687
21H04J21.1H04J21.1n/achrIII 2,369,757contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR010996 (DNA-directed DNA polymerase, family X, beta-like, N-terminal), IPR000626 (Ubiquitin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
22str-86F59E11.14n/achrV 8,983,013C. elegans STR-86 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
24F28H1.5F28H1.5n/achrI 3,979,010
25F36D1.6F36D1.6n/achrI 11,270,696contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
26Y6B3B.7Y6B3B.7n/achrI 13,748,017contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
27ZK418.6ZK418.6n/achrIII 7,076,490contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28K01D12.15K01D12.15n/achrV 12,386,487contains similarity to Interpro domains IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
29fbxa-96H03G16.4n/achrX 15,059,361This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
30T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
31Y113G7B.15Y113G7B.15n/achrV 20,226,741contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
32try-7ZC581.6n/achrI 6,642,054C. elegans TRY-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
33R03H10.4R03H10.4n/achrII 4,168,021contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
34R01H2.2R01H2.2n/achrIII 7,057,468contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
35tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
36F28C10.4F28C10.4n/achrX 539,044
37T11F1.2T11F1.2n/achrII 2,957,123contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
38W01B11.1W01B11.10.00000000000002chrI 3,300,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
39grl-2T16G1.8n/achrV 12,945,836grl-2 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-2 is expressed in neurons, amphid socket cells, and other cells; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
40twk-6F17C8.5n/achrIII 4,743,772twk-6 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; as loss of TWK-6 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of TWK-6 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; TWK-6 may, however, function redundantly with other TWK channels; TWK-6 is expressed in the hypodermis.
41R09B5.12R09B5.12n/achrV 1,455,855contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core)
42R04B5.1R04B5.1n/achrV 10,078,069contains similarity to Culex nigripalpus baculovirus Putative 33 kDa early protein (CUN014 similar to AcMNPV ORF92).; TR:Q99GP2
43F47B3.4F47B3.4n/achrI 3,961,620contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR003267 (Small proline-rich), IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
44K02F6.1K02F6.1n/achrII 2,555,138contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR013084 (Zinc finger, CCHC retroviral-type), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
45R05D7.2R05D7.2n/achrI 12,166,865contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
46C13C4.4C13C4.4n/achrV 12,110,082contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR005833 (Haloacid dehydrogenase/epoxide hydrolase), IPR006355 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, hypothetical 2), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
47T11A5.1T11A5.1n/achrV 9,859,109contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase)
48fbxa-223ZC513.10n/achrV 8,064,176fbxa-223 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; FBXA-223 also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
49F02H6.6F02H6.6n/achrIV 14,230,085contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
50H04M03.11H04M03.11n/achrIV 5,883,356