UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W03D2.9W03D2.95.0000000000000005e-68chrIV 4,074,075contains similarity to Interpro domain IPR009151 (Basigin)
2R02E4.1R02E4.1n/achrX 4,103,960
3E03H4.11E03H4.11n/achrI 12,433,962contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
4C26C6.8C26C6.8n/achrI 7,504,574contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) (3), PF00018 (SH3 domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR011511 (Variant SH3)
5C25G6.3C25G6.3n/achrX 1,235,994contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR011130 (SecA preprotein cross-linking region), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
6T26H2.5T26H2.5n/achrV 19,231,365contains similarity to Pfam domain PF00569 Zinc finger, ZZ type contains similarity to Interpro domain IPR000433 (Zinc finger, ZZ-type)
7str-211C02E7.13n/achrV 4,943,703C. elegans STR-211 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8nhr-189F47C10.8n/achrV 3,859,413C. elegans NHR-189 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
9Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
10fbxb-13C08F1.3n/achrII 1,789,688This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
11R07E5.5R07E5.5n/achrIII 4,398,025contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
12ugt-37F10D2.6n/achrV 7,143,012C. elegans UGT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
13W02D9.9W02D9.9n/achrI 12,557,310contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter).; TR:Q8AAL0
14K02F6.6K02F6.6n/achrII 2,530,385contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
15sri-25C41G6.10n/achrV 15,218,422C. elegans SRI-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16Y69H2.1Y69H2.1n/achrV 18,621,264contains similarity to Myxine glutinosa NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_MYXGL
17sra-23T06G6.1n/achrI 12,704,070C. elegans SRA-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18srh-243F37B4.3n/achrV 2,871,265C. elegans SRH-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19F47G6.3F47G6.3n/achrI 1,467,585contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
20acr-3K11G12.7n/achrX 6,711,143acr-3 encodes a non-alpha subunit of the nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) superfamily; ACR-3 functions as a ligand-gated ion channel that likely mediates fast actions of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; when coexpressed with UNC-38, an nAChR alpha subunit, the resulting hetero-oligomer can form levamisole-gated channels; ACR-3 is a member of the UNC-29-like group of nAChR subunits.
21C47E8.6C47E8.6n/achrV 14,690,485contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
22scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
23ced-3C48D1.2n/achrIV 13,202,258The ced-3 gene encodes a protease required for apoptosis.
24Y76A2B.6Y76A2B.6n/achrIII 13,552,896Y76A2B.6 encodes a ortholog of human CD36 antigen (OMIM:173510, mutated in platelet glycoprotein IV deficiency); Y76A2B.6 is needed for cell corpse engulfment in the germline and in the three-fold embryo, and for migration of the anterior arm of the gonad.
25Y56A3A.16Y56A3A.16n/achrIII 11,912,267contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Pleckstrin homology domain-containing family M member 3; ENSEMBL:ENSP00000373899
26F31F7.3F31F7.3n/achrV 6,269,506
27fbxa-203W05F2.5n/achrI 3,372,801This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
28srw-77W06G6.8n/achrV 16,642,725C. elegans SRW-77 protein ;
29C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
30F10C2.7F10C2.7n/achrV 12,055,113contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
31F28H6.6F28H6.6n/achrX 14,121,403contains similarity to Interpro domain IPR010993 (Sterile alpha motif homology)
32srbc-59R09E12.1n/achrV 779,433C. elegans SRBC-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
33clec-188M199.3n/achrIV 15,117,866C. elegans CLEC-188 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
34npr-1C39E6.6n/achrX 4,768,551npr-1 encodes a predicted G protein-coupled neuropeptide receptor that is homologous to the mammalian neuropeptide Y (NPY) receptor (OMIM:162641) required for regulating anxiety, food consumption, and pain sensation; in C. elegans, NPR-1 is involved in ethological variations of social behavior such as social versus solitary feeding; NPR-1 also affects some aspect of UNC-6/netrin-mediated branching of motor neurons, as strong npr-1 mutations can suppress abnormal migration of ventral nerve cord neurons induced by overexpression of UNC-6 lacking domain C; NPR-1 is expressed predominantly in the nervous system, and particularly in the AQR, PQR, and URX neurons that are exposed to the body fluid.
35C13C4.6C13C4.6n/achrV 12,123,359contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
36C25D7.9C25D7.9n/achrV 15,065,202
37F17C11.6F17C11.6n/achrV 10,955,512contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9ZT77
38bath-33C08E3.3n/achrII 1,605,408C. elegans BATH-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00917 (MATH domain) , PF00651 (BTB/POZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
39T03E6.2T03E6.2n/achrV 16,582,078contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40srbc-65Y32B12B.3n/achrV 16,551,603C. elegans SRBC-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41coq-1C24A11.9n/achrI 5,414,239coq-1 encodes a putative hexaprenyl pyrophosphate synthetase, orthologous to S. cerevisiae COQ1; COQ-1 is required for ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis and for normally short lifespan; coq-1 mutants have slowed pharyngeal pumping, and eventually arrest as paralysed larvae before dying; coq-1(RNAi) animals have reduced levels of coenzyme Q9 and superoxide, and have abnormally long lifespans; coq-1 mutants are not rescued by dietary coenzyme Q.
42gst-30ZK546.11n/achrII 4,934,462C. elegans GST-30 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
43C23H4.4C23H4.4n/achrX 12,231,444contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR000062 (Thymidylate kinase), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
44F25A2.1F25A2.1n/achrV 1,180,578contains similarity to Rattus norvegicus C-X-C chemokine receptor type 7 (CXC-R7) (CXCR-7) (G-protein coupledsreceptor RDC1 homolog) (RDC-1) (Chemokine orphan receptor 1).; SW:O89039
45srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
46srt-62T27C10.2n/achrI 10,900,411C. elegans SRT-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47F21H12.2F21H12.2n/achrII 6,088,063
48F46A8.6F46A8.6n/achrI 11,244,411contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
49C08B6.10C08B6.10n/achrV 10,126,265contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
50srz-15C32H11.2n/achrIV 12,916,637C. elegans SRZ-15 protein ;