UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W02B12.9W02B12.96e-175chrII 11,470,937contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
2F25C8.4F25C8.4n/achrV 20,901,062contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
3W02B12.1W02B12.1n/achrII 11,450,148contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
4ttll-15K07C5.7n/achrV 10,359,962ttll-15 encodes a putative tubulin polyaminoacid ligase orthologous to Drosophila melanogaster CG4089 and Tetrahymena thermophila TTLL15; TTLL-15 has no obvious function in mass RNAi assays.
5R05D3.6R05D3.6n/achrIII 8,350,531R05D3.6 encodes the epsilon subunit of the soluble, catalytic F1 portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); RNAi experiments indicate that loss of R05D3.6 activity has minor effects on growth rate.
6AC8.4AC8.4n/achrX 227,022
7K04F10.1K04F10.1n/achrI 6,365,571The K04F10.1 gene encodes a homolog of SCA1, which when mutated leads to spinocerebellar ataxia 1 (OMIM:164400).
8str-48C34D4.8n/achrIV 7,123,053C. elegans STR-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9T10E10.4T10E10.4n/achrX 6,318,637T10E10.4 encodes a large (966-residue) protein, predicted to be secreted, with two N-terminal chitin-binding peritrophin-A domains followed by 14 cysteine-rich domains and one C-terminal EB module; the general organization of T10E10.4 protein resembles that of K04H4.2; T10E10.4 has no obvious function in mass RNAi assays but, like CEJ-1 and CPG-2, might participate in chitin synthesis.
10clec-51B0218.6n/achrIV 8,162,862C. elegans CLEC-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR001304 (C-type lectin), IPR002352 (Eosinophil major basic protein)
11lin-48F34D10.5n/achrIII 3,746,355lin-48 encodes a C2H2-type zinc-finger transcription factor that is orthologous to Drosophila OVO and mouse OVO1; LIN-48 is required for development of the hindgut, the male tail, and the excretory duct cell; in hindgut and male tail development, LIN-48 activity is essential for proper fate specification of the U, F, and K' blast cells and B blast cell descendants, and in excretory duct cell development, for normal duct cell morphogenesis; a LIN-48 translational reporter is expressed in the nuclei of the U, F, K, and K' blast cells, the excretory duct cell, and up to 10 cells in the head region beginning in late embryogenesis and continuing through adulthood; in addition, expression is detected in the neuronal support cells of the phasmid and labial sensory structures beginning at the late L1 larval stage; in hindgut cell specification, LIN-48 functions with EGL-38/Pax, which appears to be a direct transcriptional regulator of LIN-48 expression, and in excretory duct cell development, LIN-48 is likely under the control of the CES-2 bZip transcription factor
12D1014.7D1014.7n/achrV 8,119,293contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
13ugt-61F39G3.1n/achrV 4,743,888C. elegans UGT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
14B0238.1B0238.1n/achrV 5,241,934contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
15T23D8.3T23D8.3n/achrI 9,974,837T23D8.3 encodes an ortholog of yeast and human LTV1 that inhibits DHC-1 in vivo; in mass RNAi assays, T23D8.3 is required for embryonic and larval development, normally large brood sizes, and normally fast growth.
16H34I24.1H34I24.1n/achrIII 2,847,797
17C49A9.6C49A9.6n/achrIV 6,212,029contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domain IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
18mom-1T07H6.2n/achrX 6,295,619mom-1 encodes a predicted O-acyltransferase that is orthologous to Porcupine proteins conserved across a wide range of species; MOM-1 functions as part of a Wnt/MAPK signaling pathway that is required maternally for endoderm induction in the early embryo; by homology, MOM-1 is predicted to be a membrane-spanning endoplasmic reticulum protein that stimulates post-translational processing of Wnt signaling molecules such as MOM-2; embryonic mosaic analysis indicates that MOM-1 activity is required in the signaling cell, P2, for proper specification of endoderm, consistent with its predicted role in processing MOM-2/Wnt.
19F55A12.8F55A12.8n/achrI 5,351,713contains similarity to Pfam domains PF05127 (Putative ATPase (DUF699)) , PF08351 (Domain of unknown function (DUF1726)) contains similarity to Interpro domains IPR013562 (Region of unknown function DUF1726), IPR007807 (Protein of unknown function DUF699, ATPase putative), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR013324 (RNA polymerase sigma factor, regions 3 and 4)
20orai-1C09F5.2n/achrIII 653,677C. elegans ORAI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF07856 Protein of unknown function (DUF1650) contains similarity to Interpro domain IPR012446 (Protein of unknown function DUF1650)
21F31A3.3F31A3.3n/achrX 17,533,568
22clec-210Y73C8C.2n/achrV 3,119,349C. elegans CLEC-210 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
23F09G2.1F09G2.1n/achrV 7,202,915contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
24mab-10R166.1n/achrII 10,532,058C. elegans MAB-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF04905 (NAB conserved region 2 (NCD2)) , PF04904 (NAB conserved region 1 (NCD1)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR006988 (Nab, N-terminal), IPR006989 (Nab, central region)
25F32D8.10F32D8.10n/achrV 10,907,944contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26F16H6.10F16H6.10n/achrV 18,223,587contains similarity to Haemophilus influenzae Putative protease HI0419 (EC 3.4.-.-).; SW:YEGQ_HAEIN
27R07H5.9R07H5.9n/achrIV 11,208,377contains similarity to Saccharomyces cerevisiae involved in septin organization; SGD:YCL024W
28ZC239.15ZC239.15n/achrII 3,224,089contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
29F37B12.1F37B12.1n/achrII 9,028,078contains similarity to Scyliorhinus canicula Homeodomain protein Otx1 (Fragment).; TR:Q90XZ0
30C52E4.5C52E4.5n/achrV 11,984,169contains similarity to Pfam domain PF01532 Glycosyl hydrolase family 47 contains similarity to Interpro domain IPR001382 (Glycoside hydrolase, family 47)
31C05D11.5C05D11.5n/achrIII 6,410,742contains similarity to Pfam domain PF01261 Xylose isomerase-like TIM barrel contains similarity to Interpro domains IPR013279 (Apoptosis regulator, Bcl-X), IPR012307 (Xylose isomerase-type TIM barrel), IPR013022 (Xylose isomerase-like, TIM barrel)
32sgcb-1K01A2.1n/achrII 327,229K01A2.1 is orthologous to the human gene SARCOGLYCAN, BETA (43KD DYSTROPHIN-ASSOCIATED GLYCOPROTEIN) (SGCB; OMIM:600900), which when mutated leads to disease.
33nhr-226T27B7.3n/achrV 2,295,897C. elegans NHR-226 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR000083 (Fibronectin, type I), IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
34bath-46T07H3.2n/achrII 1,598,755C. elegans BATH-46 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
35F34H10.4F34H10.4n/achrX 9,649,656contains similarity to Interpro domain IPR002253 (Flavin-containing monooxygenase (FMO) 1)
36F18A11.2F18A11.2n/achrII 13,034,546contains similarity to Pfam domain PF00650 CRAL/TRIO domain contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal)
37glb-13F19H6.2n/achrX 12,374,995glb-13 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
38dpy-1M01E10.2n/achrIII 2,041,006dpy-1 encodes a collagen that affects body length and alae formation; site of action localized to the hyp7 syncytium, based on mosaic analysis.
39wrt-8C29F3.2n/achrV 15,343,304wrt-8 encodes a hedgehog-like protein, with (from N- to C-terminus) a signal sequence, a Wart domain, an short region of low-complexity sequence, and a Hint/Hog domain; WRT-8 is strongly expressed in hypodermal syncytia hyp6-hyp10 throughout life, and in in 12 subventral P cells and their descendants from 3-fold embryo to L2 larva stages; the Hint/Hog domain is predicted to cut WRT-8 into two halves and then covalently link cholesterol to the C-terminus of the Wart domain; the Wart domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; WRT-8 has no obvious function in RNAi assays.
40tag-151F10G7.1n/achrII 4,711,891C. elegans TAG-151 protein; contains similarity to Pfam domains PF08142 (AARP2CN (NUC121) domain) , PF04950 (Protein of unknown function (DUF663)) contains similarity to Interpro domains IPR012948 (AARP2CN), IPR007034 (Protein of unknown function DUF663)
41nas-29F58A6.4n/achrII 5,140,235C. elegans NAS-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
42C32E8.11C32E8.11n/achrI 3,812,136contains similarity to Pfam domains PF02617 (ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS) , PF02207 (Putative zinc finger in N-recognin (UBR box)) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013993 (Zinc finger, N-recognin, metazoa), IPR014719 (Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like), IPR003126 (Zinc finger, N-recognin), IPR000315 (Zinc finger, B-box), IPR003769 (Adaptor protein ClpS, core)
43K04C1.4K04C1.4n/achrX 14,246,093contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
44klp-8C15C7.2n/achrX 3,162,174klp-8 encodes an atypical kinesin-like motor protein with the motor domain in the N-terminus; the motor domain of KLP-8 exhibits poor homology to the globular motor domain of the kinesin heavy chain.
45nspc-13F42F12.6n/achrX 12,357,636C. elegans NSPC-13 protein ;
46B0554.2B0554.2n/achrV 435,748contains similarity to Pfam domain PF02795 Domain of unknown function (DUF225) contains similarity to Interpro domain IPR004024 (Protein of unknown function DUF225)
47C06E2.1C06E2.1n/achrX 8,873,724contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
48gop-1C34E10.3n/achrIII 5,256,655C. elegans GOP-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
49C52A10.2C52A10.2n/achrV 5,235,946contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
50F10D11.4F10D11.4n/achrI 8,441,960contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)