UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1W01B6.2W01B6.20chrIV 10,074,247contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2F26F2.4F26F2.4n/achrV 20,565,244contains similarity to Homo sapiens Laminin alpha-4 chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000230538
3scrm-5K08D10.8n/achrIV 4,163,488scrm-5 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); scrm-5(RNAi) animals have no obvious phenotype.
4Y32B12A.4Y32B12A.4n/achrV 16,494,950contains similarity to Pfam domain PF06678 Protein of unknown function (DUF1179) contains similarity to Interpro domain IPR009564 (Protein of unknown function DUF1179)
5C38H2.1C38H2.1n/achrIII 10,369,054contains similarity to Pfam domains PF00566 (TBC domain) , PF02759 (RUN domain) contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR004012 (RUN)
6Y116A8A.6Y116A8A.6n/achrIV 16,826,929contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
7W03F8.2W03F8.2n/achrIV 5,191,305contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
8F25B3.2F25B3.2n/achrV 9,578,510contains similarity to Lactococcus lactis Oligopeptide transport system permease protein oppC.; SW:OPPC_LACLA
9F28H7.6F28H7.6n/achrV 10,755,523contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
10C38C3.7C38C3.7n/achrV 1,502,860contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) (2), PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
11Y39E4A.1Y39E4A.1n/achrIII 12,951,765contains similarity to Mus musculus Nuclear protein ZAP3.; SW:ZAP3_MOUSE
12F02H6.6F02H6.6n/achrIV 14,230,085contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
13Y4C6B.3Y4C6B.3n/achrIV 5,335,043contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
14BE10.1BE10.1n/achrIII 12,788,458contains similarity to Homo sapiens PRO2015; TR:Q9P185
15Y45F3A.1Y45F3A.1n/achrIII 10,559,860contains similarity to Homo sapiens Tropomyosin 2; ENSEMBL:ENSP00000367550
16Y7A5A.8Y7A5A.8n/achrX 15,823,201contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IL30
17H32C10.3H32C10.3n/achrIV 5,918,692contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (5), PF01529 (DHHC zinc finger domain) contains similarity to Interpro domains IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type), IPR002110 (Ankyrin)
18Y56A3A.2Y56A3A.2n/achrIII 11,856,255contains similarity to Pfam domain PF02163 Peptidase family M50 contains similarity to Interpro domains IPR008915 (Peptidase M50), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001193 (Peptidase M50, mammalian sterol-regulatory element binding protein)
19T05A8.1T05A8.1n/achrII 2,709,077
20C08G5.2C08G5.2n/achrII 740,228
21C48E7.8C48E7.8n/achrI 6,267,364contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
22H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
23C25A8.5C25A8.5n/achrIV 7,000,530contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
24W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
25F52F10.3F52F10.3n/achrV 1,540,095contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
26lips-2C04B4.3n/achrX 12,286,461C. elegans LIPS-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
27W05B5.1W05B5.1n/achrI 13,043,893contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Homolog of human WASP, proline-rich protein; SGD:YOR181W
28abt-3F55G11.9n/achrIV 12,953,691abt-3 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-3 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-3 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
29K02H11.6K02H11.6n/achrV 1,534,154contains similarity to Pfam domains PF00085 (Thioredoxin) , PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
30rab-14K09A9.2n/achrX 15,605,871rab-14 encodes a member of the Rab GTPase family.
31C33E10.5C33E10.5n/achrX 17,276,148contains similarity to Interpro domain IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
32scl-23B0545.3n/achrIV 88,065C. elegans SCL-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR014044 (SCP-like extracellular)
33W06G6.10W06G6.10n/achrV 16,646,964contains similarity to Escherichia coli O157:H7 C4-type zinc finger protein (TraR family).; TR:Q8X2P7
34F26F4.8F26F4.8n/achrIII 4,904,678contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
35F28A10.4F28A10.4n/achrII 844,685contains similarity to Interpro domain IPR009061 (Putative DNA binding)
36C44F1.2C44F1.2n/achrIII 3,769,375contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
37nas-14F09E8.6n/achrIV 13,172,108nas-14 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-14::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx.
38R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
39C04G2.2C04G2.21.9999999999999998e-122chrIV 10,091,506contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
40F09E8.1F09E8.1n/achrIV 13,141,838contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domains IPR011052 (Proteinase and amylase inhibitor), IPR002593 (Protein of unknown function DX)
41F23C8.8F23C8.80.00006chrI 2,431,177contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
42F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
43B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
44srsx-14C39H7.5n/achrIV 5,625,990C. elegans SRSX-14 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
45T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
46C56E6.6C56E6.6n/achrII 6,542,233contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
47grl-2T16G1.8n/achrV 12,945,836grl-2 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-2 is expressed in neurons, amphid socket cells, and other cells; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
48try-7ZC581.6n/achrI 6,642,054C. elegans TRY-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
49AC7.3AC7.3n/achrIV 5,112,248
50K02A11.2K02A11.2n/achrI 9,745,095contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein that binds nuclear localization sequences, required for pre-rRNA processing and ribosome biogenesis; SGD:YGR159C