UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T28D6.3T28D6.33e-67chrIII 11,367,475contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein LCR14 precursor.; TR:P82729
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F48B9.3F48B9.3n/achrX 2,165,518contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
4sma-1R31.1n/achrV 11,908,070sma-1 encodes a beta-H spectrin; during embryonic morphogenesis, SMA-1 activity is required for a normal rate of elongation and thus, for a wild-type body length upon hatching; in addition, SMA-1 is required for proper morphogenesis of the pharynx and the excretory cell; sma-1 mRNA transcripts are first detected in hypodermal cells at the beginning of embryonic morphogenesis with later expression visible in the developing pharynx, intestine, and excretory cell.
5C50F7.3C50F7.3n/achrIV 7,733,257contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
6M03E7.3M03E7.3n/achrV 5,615,596
7T27A8.4T27A8.4n/achrX 16,067,184contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Involved in protein transport at multiple stages of the secretory pathway; SGD:YDR170C
8srr-3F36D3.3n/achrV 16,507,773C. elegans SRR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domain IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species)
9ZK666.2ZK666.2n/achrII 10,471,714contains similarity to Homo sapiens ASH1; ENSEMBL:ENSP00000265206
10F46F5.1F46F5.1n/achrII 790,983
11H05L14.1H05L14.1n/achrI 7,974,757contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
12R04B5.1R04B5.1n/achrV 10,078,069contains similarity to Culex nigripalpus baculovirus Putative 33 kDa early protein (CUN014 similar to AcMNPV ORF92).; TR:Q99GP2
13C18H2.4C18H2.4n/achrIII 7,697,463C18H2.4 is orthologous to the human gene GLOMULIN (FAP48; OMIM:601749), which when mutated leads to disease.
14F46A9.2F46A9.2n/achrI 9,459,902contains similarity to Saccharomyces cerevisiae part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA); similar to microtubule binding proteins and to X90565_5.cds; SGD:YLR197W
15Y51A2B.4Y51A2B.4n/achrV 18,387,652contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
16F22B3.8F22B3.8n/achrIV 11,423,572contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
17F14E5.3F14E5.3n/achrII 8,436,197contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
18gly-15C54C8.11n/achrI 12,463,985gly-15 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase; gly-15 expressed only in cellular processes that are probably part of the secretory network of the G2 gland cells.
19C14B1.3C14B1.3n/achrIII 3,704,316This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
20srt-44M199.1n/achrIV 15,105,017C. elegans SRT-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
21T02H6.6T02H6.6n/achrII 683,947
22T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
23K02D10.2K02D10.2n/achrIII 8,770,897
24F01D4.3F01D4.3n/achrIV 10,474,640contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR005819 (Histone H5), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
25C10G11.10C10G11.10n/achrI 6,305,695
26fbxa-96H03G16.4n/achrX 15,059,361This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
27B0207.1B0207.1n/achrI 5,966,138contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000005 (Helix-turn-helix, AraC type), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
28twk-1F21C3.1n/achrI 7,270,700C. elegans TWK-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
29ZK1225.5ZK1225.5n/achrI 13,217,724
30F15D3.6F15D3.6n/achrI 11,574,794contains similarity to Pfam domain PF04707 PRELI-like family contains similarity to Interpro domain IPR006797 (MSF1)
31F22B5.5F22B5.5n/achrII 8,453,880contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
32C28F5.1C28F5.1n/achrII 7,506,343
33F46F5.10F46F5.10n/achrII 824,543contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
34Y40B1A.3Y40B1A.3n/achrI 13,356,226contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region)
35srz-45Y6G8.1n/achrV 17,593,282C. elegans SRZ-45 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
36T08B6.5T08B6.5n/achrIV 4,890,263contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
37Y37A1A.2Y37A1A.2n/achrIV 13,909,126contains similarity to Pfam domain PF05978 Eukaryotic protein of unknown function (DUF895) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
38ins-37F08G2.6n/achrII 13,835,294ins-37 encodes an insulin-like peptide.
39C06G4.4C06G4.4n/achrIII 7,977,442
40T11G6.7T11G6.7n/achrIV 10,844,729contains similarity to Fundulus heteroclitus Lens major intrinsic protein.; TR:Q9PUE2
41F56H6.6F56H6.6n/achrI 12,295,311contains similarity to Mus musculus N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferases(EC 2.4.1.149) (Poly-N-acetyllactosamine extension enzyme) (I-beta-s1,3-N-acetylglucosaminyltransferase) (iGnT) (UDP-GlcNAc:betaGal beta-s1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 1).; SW:Q8BWP8
42B0457.4B0457.4n/achrII 8,911,392contains similarity to Bacteriophage phi-C31 Gp21.; TR:Q9ZX87
43C06C6.7C06C6.7n/achrV 15,993,879contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
44K10D6.3K10D6.3n/achrV 11,201,218contains similarity to Homo sapiens HMG-BOX transcription factor BBX; ENSEMBL:ENSP00000319742
45rmd-5T23B3.3n/achrI 6,711,598C. elegans RMD-5 protein ; contains similarity to Xenopus laevis Protein FAM82C.; SW:Q5EAU9
46W03B1.9W03B1.9n/achrIV 4,354,761contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
47Y18D10A.3Y18D10A.3n/achrI 12,812,894contains similarity to Pfam domain PF03853 YjeF-related protein N-terminus contains similarity to Interpro domain IPR004443 (YjeF-related protein, N-terminal)
48F18A12.6F18A12.6n/achrII 3,401,335F18A12.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.6 has no clear orthologs in other organisms.
49Y43F8C.9Y43F8C.9n/achrV 19,646,679contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein.; SW:P34127
50F59A6.3F59A6.3n/achrII 5,009,745contains similarity to Interpro domains IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)