UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T28A11.20T28A11.200chrV 3,272,236T28A11.20 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T28A11.20 has no clear orthologs in other organisms.
2srg-69F09E5.4n/achrII 5,356,499C. elegans SRG-69 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
3fbxb-68F09C3.3n/achrI 14,286,378This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
4C15A11.4C15A11.4n/achrI 7,399,849contains similarity to Interpro domains IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
5npp-12T23H2.1n/achrI 6,450,639npp-12 encodes Gp210, an evolutionarily conserved membrane protein of the nuclear pore complex (NPC); NPP-12 is required for embryonic viability and normal nuclear membrane structures.
6ugt-6ZC455.4n/achrV 12,796,799C. elegans UGT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
7F26D2.15F26D2.15n/achrV 16,438,363contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
8F29D10.3F29D10.3n/achrI 8,844,238contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
9clec-127W10G11.5n/achrII 3,568,702C. elegans CLEC-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
10nhr-219T19A5.5n/achrV 8,966,534C. elegans NHR-219 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11srw-132T05B4.5n/achrV 4,107,240C. elegans SRW-132 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
12C44H9.2C44H9.2n/achrV 12,832,016contains similarity to Antirrhinum majus ACC synthase 2 (Fragment).; TR:Q9ZT10
13W06A11.2W06A11.2n/achrII 4,060,321
14M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
15T23H2.4T23H2.4n/achrI 6,455,456
16srb-8F37C12.15n/achrIII 7,172,652C. elegans SRB-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
17srg-16F15A4.4n/achrII 12,468,465C. elegans SRG-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
18C13A2.5C13A2.5n/achrV 7,277,113contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
19C47C12.2C47C12.2n/achrX 7,754,107
20clec-227F08H9.5n/achrV 14,473,432C. elegans CLEC-227 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21C13A2.9C13A2.9n/achrV 7,263,287contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
22srsx-11C13D9.4n/achrV 4,978,533C. elegans SRSX-11 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
23F36F12.8F36F12.8n/achrV 2,091,148contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
24B0563.8B0563.8n/achrX 9,174,023
25R10D12.6R10D12.6n/achrV 13,949,458contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
26T14E8.2T14E8.2n/achrX 6,542,867contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
27srw-55T05G11.6n/achrV 15,939,538C. elegans SRW-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
28srsx-36T26E4.15n/achrV 15,808,853C. elegans SRSX-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29F40G12.4F40G12.4n/achrV 14,268,178contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
30srx-95F41G3.11n/achrII 6,753,887C. elegans SRX-95 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003915 (Polycystic kidney disease type 2 protein)
31dod-20B0554.6n/achrV 423,333C. elegans DOD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
32pqn-62T03G11.1n/achrX 5,200,980The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
33R13.2R13.2n/achrIV 10,826,996contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
34srx-7C14C6.1n/achrV 561,828C. elegans SRX-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35C47F8.6C47F8.6n/achrI 12,320,092contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
36F19B10.6F19B10.6n/achrII 3,663,696
37C01F6.1C01F6.1n/achrIV 9,098,665C01F6.1 encodes a putative calcium-dependent phospholipid binding protein of the copine family; C01F6.1 is required for sperm to normally migrate towards a PUFA-based signal exuded by oocytes; C01F6.1(RNAi) hermaphrodites are infertile, both through aberrant loss of their own sperm and through failure of males to effectively inseminate them.
38ver-1T17A3.1n/achrIII 160,182C. elegans VER-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR009134 (Vascular endothelial growth factor receptor, VEGFR, N-terminal), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR013151 (Immunoglobulin)
39sre-6F28H7.9n/achrV 10,761,699C. elegans SRE-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
40T25D1.2T25D1.2n/achrX 16,516,558contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domains IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258), IPR011332 (Ribosomal protein, zinc-binding)
41C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
42srh-21C02E7.2n/achrV 4,927,412C. elegans SRH-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
44fbxb-108F08D12.6n/achrII 2,766,099This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
45srb-3C27D6.8n/achrII 5,166,058C. elegans SRB-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
46T08D2.8T08D2.8n/achrX 196,174contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
47str-18T23D5.6n/achrV 15,741,213C. elegans STR-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48C53C11.2C53C11.2n/achrX 17,337,870
49cids-1C02F5.4n/achrIII 8,245,008C. elegans CIDS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04818 Protein of unknown function, DUF618 contains similarity to Interpro domains IPR006569 (Regulation of nuclear pre-mRNA protein), IPR006903 (Protein of unknown function DUF618), IPR008942 (ENTH/VHS)
50T08G5.1T08G5.1n/achrV 14,019,744contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein that may function as a cochaperone, as suggested by the presence of a DnaJ-like domain; SGD:YNL227C