UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1cgr-1T27A10.70chrX 3,598,867C. elegans CGR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR009038 (GOLD), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
2T10B5.2T10B5.2n/achrV 1,849,449
3K06A5.1K06A5.1n/achrI 6,475,395contains similarity to Xenopus laevis MGC52985 protein.; TR:Q7ZWX1
4F25H9.1F25H9.1n/achrV 13,454,521contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
5Y52B11A.7Y52B11A.7n/achrI 11,022,105contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR011050 (Pectin lyase fold/virulence factor), IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
6C32B5.13C32B5.13n/achrII 961,636contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
7srx-58C29F3.6n/achrV 15,353,194C. elegans SRX-58 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8R11G1.1R11G1.1n/achrX 3,663,173contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
9srh-231C03G6.11n/achrV 7,351,540C. elegans SRH-231 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
10ttr-35F22A3.2n/achrX 6,512,558C. elegans TTR-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
11F52H2.6F52H2.6n/achrX 2,561,931F52H2.6 is orthologous to the human gene 3BETA-HYDROXYSTEROL DELTA 24 REDUCTASE (DHCR24; OMIM:606418), which when mutated leads to disease.
12F16D3.4F16D3.4n/achrI 8,366,932F16D3.4 encodes a putative beta-tubulin folding cofactor D, orthologous to human TBCD (OMIM:604649); in early embryos, F16D3.4 is required for normally rapid microtubule elongation; F16D3.4 may be a ligand and effector of the ARL2 ortholog EVL-20; F16D3.4 is expressed in larval and adult pharynx, intestine, and neurons; in mass RNAi assays, F16D3.4 is required for normal mitotic spindle elongation, embryonic and larval viability, fertility, locomotion, body shape, vulval development, and cuticular integrity.
13ZK1320.9ZK1320.9n/achrII 9,685,397contains similarity to Pfam domain PF02550 Acetyl-CoA hydrolase/transferase N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR003702 (Acetyl-CoA hydrolase/transferase), IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
14F17H10.4F17H10.4n/achrX 13,126,169contains similarity to Macaca fascicularis Cytochrome oxidase subunit VIII.; TR:Q8SPI5
15H22K11.3H22K11.3n/achrX 6,783,682contains similarity to Candida albicans Hyphally-regulated protein precursor.; SW:P46591
16C14C11.7C14C11.7n/achrV 5,665,729
17C16B8.2C16B8.2n/achrX 3,963,843
18M01B2.8M01B2.8n/achrV 15,260,488contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
19gro-1ZC395.6n/achrIII 5,266,087C. elegans GRO-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01715 IPP transferase contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR002627 (tRNA isopentenyltransferase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR011593 (Isopentenyl transferase-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
20srg-3C18F10.6n/achrIII 6,269,673C. elegans SRG-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
21nspb-11F35C5.10n/achrII 12,907,461C. elegans NSPB-11 protein ;
22srw-32K03D7.11n/achrV 17,509,470C. elegans SRW-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
23H28O16.2H28O16.2n/achrI 12,649,720contains similarity to Pfam domain PF00498 FHA domain contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR000253 (Forkhead-associated)
24cnb-1F55C10.1n/achrV 11,376,767cnb-1 encodes an ortholog of calcineurin B, the regulatory subunit of the protein phosphatase 2B with four EF-hand motifs for calcium binding, that binds TAX-6 (a calcineurin A ortholog) in a calcium-dependent manner; CNB-1 binds calcium, enhances the phosphatase activity of TAX-6 in vitro, promotes transcription of rcn-1, and is required for normal cuticle formation, sperm morphology, and brood size.
25F48A11.2F48A11.2n/achrII 198,605
26ugt-41F10D2.11n/achrV 7,162,312C. elegans UGT-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
27F22H10.5F22H10.5n/achrX 16,687,280contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
28F58E1.4F58E1.4n/achrII 1,680,715contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
29F43C1.1F43C1.1n/achrIII 4,213,606contains similarity to Pfam domains PF00481 (Protein phosphatase 2C) , PF00560 (Leucine Rich Repeat) (11)contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal)
30T10D4.1T10D4.1n/achrII 3,151,352contains similarity to Pfam domains PF01579 (Domain of unknown function DUF19) , PF02343 (Domain of unknown function DUF130) contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
31C26D10.4C26D10.4n/achrII 8,331,544contains similarity to Pfam domains PF08544 (GHMP kinases C terminal) , PF00288 (GHMP kinases N terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001174 (Galactokinase/homoserine kinase), IPR006204 (GHMP kinase), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold), IPR013750 (GHMP kinase, C-terminal)
32pxn-2K09C8.5n/achrX 10,975,651C. elegans PXN-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF00560 (Leucine Rich Repeat) (3), PF01462 (Leucine rich repeat N-terminal domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (2), PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR010255 (Haem peroxidase), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR000372 (Leucine-rich repeat, cysteine-rich flanking region, N-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
33F31A9.2F31A9.2n/achrX 1,795,240
34R06B9.4R06B9.4n/achrII 13,754,197contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
35tag-143ZK856.9n/achrV 10,211,282C. elegans TAG-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF04438 HIT zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR007529 (Zinc finger, HIT-type)
36fbxa-57C29F9.10n/achrIII 106,751C. elegans FBXA-57 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001986 (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase, core), IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
37str-25F44G3.11n/achrV 16,116,262C. elegans STR-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38pqn-29F10F2.9n/achrIII 4,645,137The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
39C33H5.7C33H5.7n/achrIV 7,775,184contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
40F17A2.3F17A2.3n/achrX 12,308,161contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
41clec-238Y102A5C.17n/achrV 16,952,706C. elegans CLEC-238 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
42bli-5F45G2.5n/achrIII 13,428,598bli-5 encodes a protease inhibitor that affects the integrity of the cuticle and the development of the bursa in the adult male.
43T19B10.9T19B10.9n/achrV 11,249,483contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
44T09B9.5T09B9.5n/achrX 9,778,986contains similarity to Streptococcus pneumoniae Hypothetical protein.; TR:P96479
45K09C4.2K09C4.2n/achrX 3,297,833
46C50H11.13C50H11.13n/achrV 3,070,772contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
47tat-6F02C9.3n/achrV 3,131,186C. elegans TAT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit), IPR006539 (Phospholipid-translocating P-type ATPase, flippase), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
48C33D12.2C33D12.2n/achrX 3,043,877C33D12.2 encodes a predicted transmembrane protein orthologous to human ACDP1-ACDP4 and S. cerevisiae MAM3, and paralogous to C01H6.6, C52D10.12, M02F4.3, R04E5.2, and R13G10.4; by orthology with MAM3, C33D12.2 may participate in metal homoeostasis; C33D12.2 is expressed in intestine, body wall muscle, nervous system (including ventral and dorsal nerve cords and head neurons), and adult vulval muscle and reproductive system; C33D12.2, MAM3, and ACDP1-ACDP4 belong to a family of proteins (sharing an ACD domain) from bacteria, yeast, plants, and metazoa; murine Acdp1 is a plasma membrane protein; bacterial proteins containing the ACD domain include CorC from Salmonella typhimurium, which is involved in magnesium and cobalt efflux; C33D12.2 has no obvious function in RNAi assays.
49B0285.6B0285.6n/achrIII 4,354,080B0285.6 encodes a predicted sodium-coupled carboxylate transporter that is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy and the mammalian NaDC1 and NaDC3 transporters; B0285.6::lacZ reporter fusions are expressed in the excretory cell, from early larval stages through adulthood, with some later expression occasionally seen in two large unidentified structures on the dorsal side of the pharyngeal terminal bulb.
50T15H9.2T15H9.2n/achrII 9,616,485contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein DKFZp686J1372; ENSEMBL:ENSP00000341653