UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxb-1T26H2.10chrV 19,240,953This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
2F57A8.6F57A8.6n/achrV 10,072,890contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
3C28H8.8C28H8.8n/achrIII 5,887,890contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
4C23H4.6C23H4.6n/achrX 12,238,124contains similarity to Pfam domain PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR003395 (RecF/RecN/SMC protein, N-terminal)
5R05G6.1R05G6.1n/achrIV 7,539,920
6C38C3.7C38C3.7n/achrV 1,502,860contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) (2), PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
7T27A1.1T27A1.1n/achrII 504,620
8T04G9.1T04G9.1n/achrX 792,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region)
9F45C12.9F45C12.9n/achrII 1,709,067contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
10Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
11fbxa-129F59A1.8n/achrV 17,656,084C. elegans FBXA-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
12F35F10.12F35F10.12n/achrV 3,314,352contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
13F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
14rab-14K09A9.2n/achrX 15,605,871rab-14 encodes a member of the Rab GTPase family.
15unc-4F26C11.2n/achrII 9,898,980The unc-4 gene encodes a paired-class homeodomain protein with homologs in Drosophila and vertebrates; UNC-4 is required for establishing the identity of the A class motor neurons DA and VA, and is thus required for movement, axon guidance, and synapse formation; UNC-4 is negatively regulated by VAB-7, and UNC-4 activity requires UNC-37; unc-4 is expressed in the A-type motor neurons, DA and VA, the six VC motor neurons that innervate the vulval muscles, and the three SAB motor neurons; unc-4 is also expressed in the pharyngeal I5 motor neuron and the AVF neurons in the retrovesicular ganglion.
16F23B12.1F23B12.1n/achrV 14,429,754contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
17R04A9.1R04A9.1n/achrX 405,128
18str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
20T24H10.5T24H10.5n/achrII 9,103,999contains similarity to Arthrobacter sp C2-2 Putative histidine kinase.; TR:Q8KRF2
21F11D5.5F11D5.5n/achrX 3,302,988contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
22ZK1248.9ZK1248.9n/achrII 5,814,835contains similarity to Pfam domain PF02170 PAZ domain contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
23C17C3.6C17C3.6n/achrII 5,550,261This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
24ZC239.14ZC239.14n/achrII 3,221,697contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
25set-11F34D6.4n/achrII 2,692,391set-11 encodes a putative histone H3 lysine-9 methyltransferase orthologous to human EHMT1 (OMIM:607001, mutated in 9q subtelomeric deletion syndrome) and EHMT2 (OMIM:604599); neither set-11(n4488) nor set-11(RNAi) have any obvious phenotypes.
264R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
27F16B12.4F16B12.4n/achrX 14,097,334contains similarity to Dictyostelium discoideum Myosin II heavy chain, non muscle.; SW:MYS2_DICDI
28C10G11.10C10G11.10n/achrI 6,305,695
29Y62H9A.13Y62H9A.13n/achrX 11,918,504contains similarity to Homo sapiens Hu-Claspin; ENSEMBL:ENSP00000251195
30ttr-6T28B4.3n/achrX 6,596,773C. elegans TTR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
31ugt-55T04H1.7n/achrV 12,257,184C. elegans UGT-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
32W02B8.4W02B8.4n/achrII 13,922,543contains similarity to Pfam domain PF04870 Protein of unknown function, DUF644 contains similarity to Interpro domain IPR006954 (Protein of unknown function DUF644)
33set-19W01C8.3n/achrX 5,677,695set-19 encodes a SET domain-containing protein; SET-19 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-6, SET-13, SET-15, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-19(ok1813) nor set-19(RNAi) have any obvious phenotypes.
34C04E7.1C04E7.1n/achrX 359,435
35srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36T05A10.6T05A10.6n/achrX 10,793,737contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
37mfb-1DY3.6n/achrI 8,782,569This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
38gcy-18ZK896.8n/achrIV 12,863,005gcy-18 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-23, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-18 functions redundantly with gcy-8 and gcy-23, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, microarray experiments indicate that gcy-18 expression is induced in daf-16(RNAi); daf-2(RNAi) double mutants and repressed in daf-2(RNAi) mutants, suggesting that GCY-18 activity may contribute to a shortened lifespan; consistent with this, loss of gcy-18 activity via RNAi does result in lifespan extension; GCY-18 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
39R13A1.1R13A1.1n/achrIV 7,220,097
40T24D5.5T24D5.5n/achrX 12,599,103contains similarity to Plasmodium falciparum PfEMP1-like protein.; TR:Q8IC59
41php-3Y75B8A.1n/achrIII 12,075,804C. elegans PHP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
42srg-51Y40H7A.8n/achrIV 15,139,977C. elegans SRG-51 protein ;
43nas-5T23H4.3n/achrI 9,887,167nas-5 encodes an astacin-like metalloprotease; loss of nas-5 activity in an RNAi hypersensitive strain results in axon guidance defects, including a failure of DD/VD motoneuron commissures to reach the dorsal cord, defasciculation of the dorsal nerve cord, and midline crossing defects in the ventral nerve cord.
44F23C8.1F23C8.1n/achrI 2,447,555
45Y70C5B.1Y70C5B.1n/achrV 16,662,837
46F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
47Y48E1C.3Y48E1C.3n/achrII 13,439,410contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
48T19D7.7T19D7.7n/achrX 678,427contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
49T20B6.1T20B6.1n/achrIII 2,898,031contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
50C06C6.7C06C6.7n/achrV 15,993,879contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)