UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T26C11.4T26C11.40chrX 1,843,047contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Homo sapiens (Human). Dentin sialophosphoprotein [Contains:sDentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP); Dentinssialoprotein (DSP)].; TR:Q869X8
2Y75B8A.6Y75B8A.6n/achrIII 12,127,086The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
3ZK1055.5ZK1055.5n/achrV 6,582,618contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
4F32B5.2F32B5.2n/achrI 2,698,698
5F58D12.3F58D12.3n/achrV 14,062,015contains similarity to Interpro domain IPR009091 (Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II)
6K04A8.3K04A8.3n/achrV 6,559,849
7nkat-1F28H6.3n/achrX 14,139,007nkat-1 encodes kynurenine aminotransferase III, an ortholog of mammalian KAT3; nkat-1(RNAi) animals have no obvious phenotype.
8math-5C16C4.10n/achrII 1,882,210C. elegans MATH-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
9srx-23F31F4.2n/achrV 683,114C. elegans SRX-23 protein ;
10F58F9.1F58F9.1n/achrIV 6,251,691contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
11nhr-53K06B4.11n/achrV 15,701,459C. elegans NHR-53 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
12sra-17F28C12.1n/achrI 12,689,638C. elegans SRA-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
13F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
14srsx-17F58D7.1n/achrV 5,929,015C. elegans SRSX-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
16sri-54T10D4.8n/achrII 3,136,737C. elegans SRI-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
17Y37E11B.9Y37E11B.9n/achrIV 3,602,566
18R12C12.4R12C12.4n/achrII 6,039,457
19E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
20C23G10.5C23G10.5n/achrIII 6,191,540contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
21F18E3.10F18E3.10n/achrV 7,424,056contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22F55D12.1F55D12.1n/achrI 7,884,957contains similarity to Brachydanio rerio Hypothetical protein.; TR:Q803L4
23tsp-8F33C8.3n/achrX 14,727,975tsp-8 is orthologous to the human gene KANGAI 1 (SUPPRESSION OF TUMORIGENICITY 6, PROSTATE; CD82 ANTIGEN (R2 LEUKOCYTE ANTIGEN, ANTIGEN DETECTED BY MONOCLONAL AND ANTIBODY IA4)) (KAI1; OMIM:600623), which when mutated leads to disease.
24T24C2.3T24C2.3n/achrX 14,544,021contains similarity to Arabidopsis thaliana F25I16.10 protein.; TR:Q9FZ78
25lgc-38F11H8.2n/achrIII 7,014,295F11H8.2 encodes an UNC-49-like GABA receptor subunit.
26Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
27F59B2.11F59B2.11n/achrIII 9,014,893contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000025312
28C31B8.2C31B8.2n/achrV 2,917,112contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
29str-38T23D5.2n/achrV 15,731,518C. elegans STR-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30C33G8.2C33G8.2n/achrV 7,011,095contains similarity to Interpro domains IPR002038 (Osteopontin), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit)
31str-130C09H5.9n/achrV 8,089,962C. elegans STR-130 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C40A11.5C40A11.5n/achrII 2,134,686contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
33F43B10.1F43B10.1n/achrX 16,662,035
34C03E10.1C03E10.1n/achrV 11,291,855contains similarity to Anopheles quadrimaculatus NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_ANOQU
35str-124T22H6.3n/achrX 12,788,379C. elegans STR-124 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36C36B7.2C36B7.2n/achrX 7,106,598contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
37T24A6.16T24A6.16n/achrV 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
38srh-275C03G6.7n/achrV 7,353,665C. elegans SRH-275 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39sprr-1R03A10.6n/achrX 15,467,342C. elegans SPRR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40che-12B0024.8n/achrV 10,303,399che-12 encodes a conserved protein that contains at least seven predicted HEAT repeats; CHE-12 activity is required continuously in sensory neurons for formation of distal ciliary segments and thus, for normal sensory cilium morphology and function and chemotaxis to a subset of attractants, including sodium chloride; a che-12::gfp promoter fusion is expressed in the two phasmid neurons and the subset of amphid neurons that contain relatively simple cilia; a CHE-12::GFP protein localizes to cilia in a manner suggesting that it requires intraflagellar transport for proper localization, but is unlikely to be a core IFT particle component; che-12 expression in ciliated neurons is dependent upon the presence of the DAF-19 RFX transcription factor.
41zig-8Y39E4B.8n/achrIII 13,126,726zig-8 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-8::gfp reporter fusion is expressed in the PVT neuron and in pharyngeal muscle.
42C07E3.8C07E3.8n/achrII 10,352,798contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
43T20H12.1T20H12.1n/achrII 3,950,365
44nhr-149C03G6.12n/achrV 7,349,121C. elegans NHR-149 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
45C04C3.6C04C3.6n/achrIV 3,421,207contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
46cdc-25.2F16B4.8n/achrV 1,581,313cdc-25.2 encodes a putative homolog of Cdc25 phosphatase protein family that affects germline proliferation.
47str-129F58G4.5n/achrV 8,091,709C. elegans STR-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48H25P06.4H25P06.4n/achrI 11,307,702contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR001300 (Peptidase C2, calpain), IPR008906 (HAT dimerisation)
49T24D8.6T24D8.6n/achrX 2,365,815
50sre-38F15A4.1n/achrII 12,458,457C. elegans SRE-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)