UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1dhs-30T25G12.73e-173chrX 17,233,193dhs-30 encodes a member of the short-chain dehydrogenases/reductases family (SDR) homologous to HSD, which when mutated leads to cortisol 11-beta ketoreductase deficiency (OMIM:218030).
2W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
3C01H6.6C01H6.6n/achrI 7,223,298C01H6.6 encodes a predicted transmembrane protein orthologous to human ACDP1-ACDP4 and S. cerevisiae MAM3, and paralogous to C33D12.2, C52D10.12, M02F4.3, R04E5.2, and R13G10.4; by orthology with MAM3, C01H6.6 may participate in metal homoeostasis; C01H6.6, MAM3, and ACDP1-ACDP4 belong to a family of proteins (sharing an ACD domain) from bacteria, yeast, plants, and metazoa; murine Acdp1 is a plasma membrane protein; bacterial proteins containing the ACD domain include CorC from Salmonella typhimurium, which is involved in magnesium and cobalt efflux; C01H6.6 has no obvious function in RNAi assays.
4lite-1C14F11.3n/achrX 6,228,375C. elegans LITE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF08395 7tm Chemosensory receptor contains similarity to Interpro domains IPR009318 (Trehalose receptor), IPR013604 (7TM chemoreceptor)
5F31E9.3F31E9.3n/achrV 17,323,648This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
6K02B2.3K02B2.3n/achrIV 5,938,425contains similarity to Pfam domain PF04678 Protein of unknown function, DUF607 contains similarity to Interpro domain IPR006769 (Protein of unknown function DUF607)
7F59A2.6F59A2.6n/achrIII 3,420,133contains similarity to Pfam domains PF02524 (KID repeat) , PF01465 (GRIP domain) contains similarity to Interpro domains IPR004089 (Chemotaxis methyl-accepting receptor, signalling), IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin), IPR000237 (GRIP)
8K06H6.2K06H6.2n/achrV 586,550contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
9F55A11.7F55A11.7n/achrV 11,785,988contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
10hmit-1.2Y51A2D.5n/achrV 18,526,923hmit-1.2 encodes one of three C. elegans proton (H+)-dependent myo-inositol transporters; loss of hmit-1.2 activity via large-scale RNAi result in no obvious abnormalities but by homology, HMIT-1.2 is predicted to function as a plasma membrane protein required for the regulated uptake of myo-inositol and thus potentially for regulation of cell signaling and intracellular osmolarity.
11srp-5C03G6.18n/achrV 7,382,647srp-5 encodes an ovalbumin-like serpin (ov-serpin) member of the serine protease inhibitor superfamily; by homology, SRP-5 is predicted to function as a suicide substrate that inhibits the proteolytic activity of serine proteases; however, as loss of srp-5 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of SRP-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
12W09H1.5W09H1.5n/achrII 13,186,582contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR016040 (NAD(P)-binding)
13Y49E10.16Y49E10.16n/achrIII 12,432,047contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
14D1022.4D1022.4n/achrII 7,456,724contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
15cyp-35B3K07C6.2n/achrV 3,946,183C. elegans CYP-35B3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
16F42C5.4F42C5.4n/achrIV 7,290,079contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
17B0280.2B0280.2n/achrIII 7,126,452contains similarity to Interpro domain IPR000697 (EVH1)
18lgc-12R13A5.4n/achrIII 7,563,273C. elegans LGC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
19msp-152ZK546.6n/achrII 4,933,207msp-152 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
20R02D3.8R02D3.8n/achrIV 256,589contains similarity to Pfam domain PF00929 Exonuclease contains similarity to Interpro domains IPR013520 (Exonuclease, RNase T and DNA polymerase III), IPR006055 (Exonuclease), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
21T20D4.12T20D4.12n/achrV 3,397,421contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
22C43D7.7C43D7.7n/achrV 19,319,210contains similarity to Dictyostelium discoideum Filament-interacting protein.; TR:Q967Y0
23C30H6.8C30H6.8n/achrIV 17,382,648contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
24ZC376.3ZC376.3n/achrV 14,169,887contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
25wrt-8C29F3.2n/achrV 15,343,304wrt-8 encodes a hedgehog-like protein, with (from N- to C-terminus) a signal sequence, a Wart domain, an short region of low-complexity sequence, and a Hint/Hog domain; WRT-8 is strongly expressed in hypodermal syncytia hyp6-hyp10 throughout life, and in in 12 subventral P cells and their descendants from 3-fold embryo to L2 larva stages; the Hint/Hog domain is predicted to cut WRT-8 into two halves and then covalently link cholesterol to the C-terminus of the Wart domain; the Wart domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; WRT-8 has no obvious function in RNAi assays.
26T22B7.3T22B7.3n/achrX 5,648,750contains similarity to Pfam domain PF02274 Amidinotransferase contains similarity to Interpro domain IPR003198 (Amidinotransferase)
27ZK1037.6ZK1037.6n/achrV 15,326,789contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
28K09F6.7K09F6.7n/achrII 2,291,523contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
29che-11C27A7.4n/achrV 12,147,469che-11 encodes a large, unfamiliar protein with orthologs in vertebrates and arthropods (e.g., KIAA0590 and CG11838-PA) and in Chlamydomonas (IFT140), as well as distant similarity to OSM-1 and ZK520.1; che-11 is required for normal synthesis of sensory cilia (via intraflagellar transport) in sensory neurons, osmotic avoidance, and dauer formation.
30H05C05.3H05C05.3n/achrIII 2,967,980
31str-96T10H4.2n/achrV 15,293,203C. elegans STR-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32Y11D7A.1Y11D7A.1n/achrIV 9,229,724contains similarity to Interpro domains IPR003702 (Acetyl-CoA hydrolase/transferase), IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
33F15D3.6F15D3.6n/achrI 11,574,794contains similarity to Pfam domain PF04707 PRELI-like family contains similarity to Interpro domain IPR006797 (MSF1)
34C02G6.2C02G6.2n/achrV 5,873,482contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
35C34F6.6C34F6.6n/achrX 11,207,733contains similarity to Pisum sativum 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase (EC 2.5.1.55) (Phospho-2-sdehydro-3-deoxyoctonate aldolase) (3-deoxy-D-manno-octulosonic acid 8-sphosphate synthetase) (KDO-8-phosphate synthetase) (KDO 8-P synthase)s(KDOPS).; SW:KDSA_PEA
36srbc-75M01B2.3n/achrV 15,254,293C. elegans SRBC-75 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37T13F3.6T13F3.6n/achrV 16,270,691contains similarity to Paramecium tetraurelia 51B type surface protein.; TR:Q27167
38lec-4C44F1.3n/achrIII 3,772,356lec-4 encodes a predicted galectin that exhibits sugar binding properties in vitro.
39twk-1F21C3.1n/achrI 7,270,700C. elegans TWK-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
40F56B3.6F56B3.6n/achrIV 789,430contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
41C48E7.6C48E7.6n/achrI 6,244,688contains similarity to Drosophila pseudoobscura GA10211-PA (Fragment).; TR:Q29MP8
42R12E2.2R12E2.2n/achrI 4,180,486contains similarity to Pfam domain PF07738 Sad1 / UNC-like C-terminal contains similarity to Interpro domains IPR012919 (Sad1/UNC-like, C-terminal), IPR008979 (Galactose-binding like)
43fbxa-183F44E7.6n/achrV 5,781,921This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
44srv-29T13A10.6n/achrIV 6,265,730C. elegans SRV-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45pat-10F54C1.7n/achrI 5,019,533pat-10 encodes body wall muscle troponin C, the calcium-binding component of the troponin complex of actin thin filaments; PAT-10 is essential for muscle contraction and thus for completion of embryonic morphogenesis and elongation; by homology, PAT-10 likely functions to regulate body wall muscle contraction in response to changes in intracellular calcium; PAT-10 is expressed in body wall muscle but is also detected in vulval and anal muscles; expression in body wall muscle begins during early embryonic morphogenesis, concurrent with expression of other body wall muscle structural components.
46clec-40T20B3.13n/achrV 16,840,047C. elegans CLEC-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
47F10B5.3F10B5.3n/achrII 8,148,546contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
48F57G4.5F57G4.5n/achrV 17,642,359contains similarity to Mus musculus Dentin sialophosphoprotein precursor (Dentin matrix protein-3) (DMP-s3) [Contains: Dentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP);sDentin sialoprotein (DSP)].; SW:DSPP_MOUSE
49srh-195R52.7n/achrII 2,115,763C. elegans SRH-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50srh-105T27A1.7n/achrII 508,784C. elegans SRH-105 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)