UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1spp-11T25D10.32e-131chrII 6,406,317C. elegans SPP-11 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
2D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
3T03E6.8T03E6.8n/achrV 16,601,940contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4fbxa-53F07G6.7n/achrX 1,717,501C. elegans FBXA-53 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
5T08E11.1T08E11.1n/achrII 1,838,405This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
6srx-128F55B12.7n/achrV 13,838,056C. elegans SRX-128 protein ;
7T02D1.4T02D1.4n/achrIV 17,401,011contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8fbxa-88F10A3.2n/achrV 16,142,535This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
9math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
10his-8F45F2.12n/achrV 8,532,878his-8 encodes an H2B histone; his-8 is contained within the histone gene cluster HIS2.
11T13F3.4T13F3.4n/achrV 16,265,325contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
12srd-47F17A2.11n/achrX 12,334,389C. elegans SRD-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13lips-8F31F6.7n/achrX 14,899,559C. elegans LIPS-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
14sri-2F36G9.9n/achrV 15,964,503C. elegans SRI-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
15B0393.7B0393.7n/achrIII 4,777,124contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
16F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
17C47A10.5C47A10.5n/achrV 17,775,721C47A10.5 encodes a D-aspartate oxidase (DASPO), paralogous to F18E3.7 and F20H11.5; recombinant C47A10.5 protein has DASPO acvitity on acidic D-amino acid substrates (e.g., D-aspartate, D-glutamate, or N-methyl-D-aspartate/NMDA), with highest catalytic efficiency on D-glutamate; since the C-terminal residues of C47A10.5 match the PTS1 consensus sequence, C47A10.5 is predicted to be peroxisomal.
18T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
19asna-2F47G3.2n/achrX 2,383,478C. elegans ASNA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02374 Anion-transporting ATPase contains similarity to Interpro domain IPR003348 (Anion-transporting ATPase)
20Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
21B0462.1B0462.1n/achrV 18,326,871contains similarity to Pfam domain PF05075 Protein of unknown function (DUF684) contains similarity to Interpro domain IPR007767 (Protein of unknown function DUF684)
22str-44C42D4.4n/achrIV 7,177,788C. elegans STR-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23srg-26C10G8.1n/achrV 5,332,145C. elegans SRG-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
24F58E2.3F58E2.3n/achrIV 3,468,626This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
25F58G4.3F58G4.3n/achrV 8,105,172contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
26F32D8.8F32D8.8n/achrV 10,902,107contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
27F59H6.6F59H6.6n/achrII 2,011,980contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
28T08D2.6T08D2.6n/achrX 180,977contains similarity to Homo sapiens Protein YIPF4; ENSEMBL:ENSP00000238831
29ZK643.6ZK643.6n/achrIII 8,958,109contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
30C07A9.10C07A9.10n/achrIII 9,685,849contains similarity to Pfam domain: PF00442 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolases family 2), Score=28.0, E-value=1e-05, N=1
31ZK795.1ZK795.1n/achrIV 12,551,089contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
32srh-292Y94A7B.1n/achrV 17,803,313C. elegans SRH-292 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33B0284.4B0284.4n/achrIII 4,386,243contains similarity to Homo sapiens similar to forkhead-associated (FHA) phosphopeptide binding domain 1; ENSEMBL:ENSP00000318812
34math-6C16C4.11n/achrII 1,884,167C. elegans MATH-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
35B0507.6B0507.6n/achrV 8,749,589contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
36fbxb-6F07E5.1n/achrII 2,066,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
37srsx-2F20E11.2n/achrV 17,437,669C. elegans SRSX-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
38AH10.2AH10.2n/achrV 14,157,204contains similarity to Plasmodium falciparum RIFIN.; TR:Q8I211
39srh-139F57E7.3n/achrV 16,484,653C. elegans SRH-139 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40C30G4.2C30G4.2n/achrX 17,044,626contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold)
41K01A2.6K01A2.6n/achrII 300,268
42str-23C55A1.5n/achrV 15,645,650C. elegans STR-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43C48C5.1C48C5.1n/achrX 8,982,602contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
44T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
45F09G8.7F09G8.7n/achrIII 8,268,070
46D1079.1D1079.1n/achrX 4,405,551
47C23G10.10C23G10.10n/achrIII 6,213,461
48F55C5.6F55C5.6n/achrV 12,280,460contains similarity to Pfam domain PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
49str-199Y68A4A.3n/achrV 17,189,811C. elegans STR-199 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50scl-27ZK6.3n/achrV 400,930C. elegans SCL-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)