UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T25B9.5T25B9.50chrIV 10,753,481contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3Y65A5A.2Y65A5A.2n/achrIV 16,413,511contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for invasion and pseudohyphae formation in response to nitrogen starvation; SGD:YIR019C
4K10D11.4K10D11.4n/achrIV 12,993,278contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
5uvt-7ZK563.1n/achrX 3,395,198uvt-7 encodes a transmembrane permease of the major facilitator superfamily (MFS) that by homology, is predicted to transport metabolites across cellular membranes in response to chemiosmotic gradients; uvt-7 was first identified in molecular analyses of gene products linked to the vitellogenin (vit) loci on the X chromosome; as loss of uvt-7 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of uvt-7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; uvt-7 mRNA is detected in embryos and adults, suggesting that uvt-7 may be a maternally expressed gene.
6ugtp-1ZK370.7n/achrIII 8,747,369C. elegans UGTP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF03151 (Triose-phosphate Transporter family) , PF04142 (Nucleotide-sugar transporter) contains similarity to Interpro domains IPR004853 (Protein of unknown function DUF250), IPR004689 (UDP-galactose transporter), IPR007271 (Nucleotide-sugar transporter)
7sra-32B0304.5n/achrII 4,530,916C. elegans SRA-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
8C05C9.2C05C9.2n/achrX 11,155,280contains similarity to White spot syndrome virus WSSV326.; TR:Q8QTD0
9R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
10wee-1.3Y53C12A.10.0000000000007chrII 9,715,024C. elegans WEE-1.3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
11Y45F10B.9Y45F10B.9n/achrIV 13,597,410contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin)
12C02D5.1C02D5.1n/achrIII 8,561,987contains similarity to Pfam domains PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
13pod-1Y76A2B.1n/achrIII 13,519,397The pod-1 gene encodes a coronin-like protein required for asymmetry along the anterior-posterior axis at the beginning of embryonic development.
14F10C2.3F10C2.3n/achrV 12,022,395contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
15F35E12.4F35E12.4n/achrV 13,732,426contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR003951 (Peptidase C58, Yersinia/Haemophilus virulence surface antigen), IPR003366 (CUB-like region)
16K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
17str-230T16A9.2n/achrV 14,209,976C. elegans STR-230 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18C34F6.6C34F6.6n/achrX 11,207,733contains similarity to Pisum sativum 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase (EC 2.5.1.55) (Phospho-2-sdehydro-3-deoxyoctonate aldolase) (3-deoxy-D-manno-octulosonic acid 8-sphosphate synthetase) (KDO-8-phosphate synthetase) (KDO 8-P synthase)s(KDOPS).; SW:KDSA_PEA
19sre-50C50E10.11n/achrII 12,304,243C. elegans SRE-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
20ZK849.4ZK849.4n/achrI 14,207,136contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domains IPR000615 (Bestrophin), IPR000694 (Proline-rich region)
21W09C3.1W09C3.1n/achrI 4,718,600contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
22rbx-2R10A10.2n/achrI 6,421,299The R10A10.2 gene encodes an ortholog of the mammalian zinc RING finger protein SAG, which protects cells from apoptosis induced by redox agents and is a component of ubiquitin-ligase (E3) complexes; mammalian SAG binds to the yeast Cul1 protein, complements the lethality of a mutation in yeast Sag, and (when bound to yeast Cul1) has ubiquitin ligase activity and promotes poly-ubiquitination of E2/Cdc34.
23F33H2.8F33H2.8n/achrI 15,032,079contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBJ6
24F32H2.8F32H2.8n/achrI 8,992,131contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domains IPR004988 (Protein of unknown function DUF273), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
25F40H6.5F40H6.5n/achrIII 6,052,328contains similarity to Pfam domains PF02795 (Domain of unknown function (DUF225)) , PF00337 (Galactoside-binding lectin) (3)contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR004024 (Protein of unknown function DUF225), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
26snf-8ZK829.10n/achrIV 11,967,123C. elegans SNF-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR004354 (Meiotic recombination protein rec114)
27T01C8.2T01C8.2n/achrX 16,786,949
28T03F7.5T03F7.5n/achrV 11,297,691contains similarity to Staphylococcus aureus YdbT-like protein.; TR:Q8GPI5
29C50C3.2C50C3.2n/achrIII 8,185,577contains similarity to Pfam domains PF00435 (Spectrin repeat) (4), PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR002017 (Spectrin repeat), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
30fbxb-116T26H2.4n/achrV 19,234,735This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
31F14D2.6F14D2.6n/achrII 3,331,956contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
32W09C3.2W09C3.2n/achrI 4,712,438contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Putative uncharacterized protein.; TR:A2E5Y7
33msp-152ZK546.6n/achrII 4,933,207msp-152 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
34Y38H6A.1Y38H6A.1n/achrV 20,322,280contains similarity to Trypanosoma brucei brucei Histone H1.; TR:Q9N6S6
35C49A1.5C49A1.5n/achrI 14,239,274contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
36C40D2.4C40D2.4n/achrII 2,000,282contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
37C02G6.2C02G6.2n/achrV 5,873,482contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
38C27C7.5C27C7.5n/achrI 11,425,014contains similarity to Pfam domains PF00337 (Galactoside-binding lectin) , PF08277 (PAN-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
39F40F9.3F40F9.3n/achrV 9,715,769contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
40srbc-62T19C9.1n/achrV 17,218,465C. elegans SRBC-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41M02B1.4M02B1.4n/achrIV 12,824,564contains similarity to Staphylococcus epidermidis Low temperature requirement B protein.; TR:Q8CMT2
42twk-37C48E7.9n/achrI 6,270,306C. elegans TWK-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2)
43F09E5.2F09E5.2n/achrII 5,376,151contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
44Y44A6D.6Y44A6D.6n/achrV 20,807,147contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
45F36D4.6F36D4.6n/achrV 9,427,160
46F28E10.4F28E10.4n/achrIV 4,566,721contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
47R10D12.1R10D12.1n/achrV 13,933,592contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
48F35E12.8F35E12.8n/achrV 13,750,531contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
49R53.5R53.5n/achrII 9,969,980contains similarity to Interpro domain IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
50F58D2.1F58D2.1n/achrIV 13,184,996contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR016024 (Armadillo-type fold)