UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T24C2.3T24C2.32e-155chrX 14,544,021contains similarity to Arabidopsis thaliana F25I16.10 protein.; TR:Q9FZ78
2C36B7.3C36B7.3n/achrX 7,101,897
3C14A6.5C14A6.5n/achrV 18,164,125contains similarity to Arabidopsis thaliana Calreticulin 2 precursor.; SW:CRT2_ARATH
4Y26D4A.5Y26D4A.5n/achrI 13,076,809contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein SAV2385 (Hypothetical protein MW2305).; TR:Q99RP4
5str-130C09H5.9n/achrV 8,089,962C. elegans STR-130 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6sre-38F15A4.1n/achrII 12,458,457C. elegans SRE-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
7srx-23F31F4.2n/achrV 683,114C. elegans SRX-23 protein ;
8srsx-17F58D7.1n/achrV 5,929,015C. elegans SRSX-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9Y75B8A.6Y75B8A.6n/achrIII 12,127,086The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
10F55B12.2F55B12.2n/achrV 13,816,154contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
11C18D11.1C18D11.1n/achrIII 11,818,072contains similarity to Sporobolus stapfianus Hypothetical protein.; TR:O04820
12R12B2.2R12B2.2n/achrIII 5,808,424contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Golgin-45; ENSEMBL:ENSP00000327541
13F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
14str-131C09H5.6n/achrV 8,081,002C. elegans STR-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15Y66A7A.7Y66A7A.7n/achrIII 11,629,581contains similarity to Lactobacillus plantarum Hypothetical protein.; TR:Q88VI8
16F59B2.11F59B2.11n/achrIII 9,014,893contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000025312
17sre-14C42C1.1n/achrIV 12,260,640C. elegans SRE-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
18hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
19F58D12.3F58D12.3n/achrV 14,062,015contains similarity to Interpro domain IPR009091 (Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II)
20R10E8.5R10E8.5n/achrV 18,255,890contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21str-109F10A3.5n/achrV 16,161,427C. elegans STR-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22sra-30Y40H7A.6n/achrIV 15,197,622C. elegans SRA-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
23uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
24str-140C09H5.3n/achrV 8,066,820C. elegans STR-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25Y37D8A.22Y37D8A.22n/achrIII 12,937,773contains similarity to Danio rerio Transmembrane protein 49.; SW:Q6NYY9
26F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
27T26C11.4T26C11.4n/achrX 1,843,047contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Homo sapiens (Human). Dentin sialophosphoprotein [Contains:sDentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP); Dentinssialoprotein (DSP)].; TR:Q869X8
28T24A6.16T24A6.16n/achrV 3,562,186contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
29C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
30F28C6.5F28C6.5n/achrII 8,599,990contains similarity to Mus musculus Activity-dependent neuroprotector (Activity-dependent neuroprotectivesprotein).; SW:ADNP_MOUSE
31ZK1055.5ZK1055.5n/achrV 6,582,618contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
32gcy-37C54E4.3n/achrIV 2,154,905gcy-37 encodes a predicted soluble guanylyl cyclase that is expressed in four candidate sensory neurons connected to the pseudocoelom, URXL, URXR, AQR, and PQR; as loss of gcy-37 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-37 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; GCY-37 expression in neurons connected to the pseudocoelom suggests, however, that GCY-37 may play a role in fluid homeostasis.
33C36B7.2C36B7.2n/achrX 7,106,598contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
34tsp-18F59G1.2n/achrII 5,905,416C. elegans TSP-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
35srh-7K09D9.7n/achrV 4,009,007C. elegans SRH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36H25P06.4H25P06.4n/achrI 11,307,702contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR001300 (Peptidase C2, calpain), IPR008906 (HAT dimerisation)
37C31B8.2C31B8.2n/achrV 2,917,112contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
38Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
39nhr-149C03G6.12n/achrV 7,349,121C. elegans NHR-149 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
40srw-84Y43F8A.4n/achrV 19,382,978C. elegans SRW-84 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
41F56C9.8F56C9.8n/achrIII 7,317,655
42str-264C06B8.4n/achrV 15,491,810C. elegans STR-264 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43sra-17F28C12.1n/achrI 12,689,638C. elegans SRA-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
44srbc-1F35F10.9n/achrV 3,300,439C. elegans SRBC-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45C18H7.1C18H7.1n/achrIV 618,237contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
46srbc-79B0250.6n/achrV 20,487,016C. elegans SRBC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47T02H6.5T02H6.5n/achrII 687,130contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
48str-38T23D5.2n/achrV 15,731,518C. elegans STR-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49W10D9.2W10D9.2n/achrII 451,150This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
50T10B9.9T10B9.9n/achrII 9,775,421contains similarity to Avian adenovirus gal1 Orf2 protein.; TR:Q64786