UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1grl-28T24A6.153e-55chrV 3,551,603grl-28 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
2srt-38F47D2.6n/achrV 4,270,408C. elegans SRT-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
3srx-8C14C6.9n/achrV 555,265C. elegans SRX-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
4C17A2.7C17A2.7n/achrII 3,842,652contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domains IPR004101 (Mur ligase, C-terminal), IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
5B0564.7B0564.7n/achrIV 13,102,647contains similarity to Aedes aegypti Cell cycle progression.; TR:Q16U20
6K02B2.6K02B2.6n/achrIV 5,961,963
7str-170T08B6.7n/achrIV 4,878,848C. elegans STR-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F14D2.6F14D2.6n/achrII 3,331,956contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
9R03A10.5R03A10.5n/achrX 15,448,432contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
10K04B12.3K04B12.3n/achrII 14,444,229contains similarity to Anopheles gambiae str PEST AGAP010179-PA (Fragment).; TR:Q7Q0T1
11rbr-2ZK593.4n/achrIV 10,923,428rbr-2 encodes a histone H3 lysine 4 (H3K4) demethylase that is required for normally short lifespan and reliable vulval development, that regulates genome-wide levels of H3K4 trimethylation, and that interacts genetically with CLK-2, GLP-1, LIN-15, and SEM-5; RBR-2 is orthologous to budding yeast Jhd2p, Drosophila LID, and human JARID1A (OMIM:180202), JARID1B (OMIM:605393), JARID1C (OMIM:314690, mutated in mental retardation), and JARID1D (OMIM:426000); rbr-2(tm1231) homozygotes display excess trimethylated H3K4 (H3K4me3) and erratic vulval development (either vulvaless or multivulva); rbr-2(RNAi) animals show extended lifespans, a strong synthetic multivulva and H3K4me3 phenotype in a lin-15(n765ts) mutant background at permissive temperature, and abnormally slow growth with clk-2(mn159), glp-1(or178), or sem-5(n2019) mutant backgrounds.
12nhr-249ZK381.3n/achrIV 6,972,292C. elegans NHR-249 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13F13A2.1F13A2.1n/achrV 4,381,556
14skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
15gnrr-7F13D2.3n/achrX 11,186,568C. elegans GNRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16srw-83ZK262.6n/achrV 18,428,523C. elegans SRW-83 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
17T21H3.5T21H3.5n/achrV 1,159,760
18srh-248H05B21.2n/achrV 2,954,922C. elegans SRH-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
19T07D10.3T07D10.3n/achrI 12,627,858contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
20str-209F26G5.5n/achrV 4,949,965C. elegans STR-209 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21srh-279F11A5.2n/achrV 16,193,941C. elegans SRH-279 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22C47F8.3C47F8.3n/achrI 12,315,930contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
23tbx-32ZK380.1n/achrX 1,656,225C. elegans TBX-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
24srh-236Y68A4A.9n/achrV 17,211,345C. elegans SRH-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
26nhr-214T07C5.3n/achrX 12,701,293C. elegans NHR-214 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
27Y75B12B.8Y75B12B.8n/achrV 15,201,905contains similarity to Homo sapiens Xylosyltransferase I; ENSEMBL:ENSP00000261381
28srg-61C24B9.11n/achrV 2,739,518C. elegans SRG-61 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
29str-108F10A3.13n/achrV 16,166,795C. elegans STR-108 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30F58B3.6F58B3.6n/achrIV 11,637,391contains similarity to Pfam domains PF04836 (Interferon-related protein conserved region) , PF05004 (Interferon-related developmental regulator (IFRD)) contains similarity to Interpro domains IPR007701 (Interferon-related developmental regulator), IPR006921 (Interferon-related protein conserved region), IPR016024 (Armadillo-type fold)
31F09E5.2F09E5.2n/achrII 5,376,151contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
32K08F4.5K08F4.5n/achrIV 10,135,380contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_96, whole genome shotgun sequence.; TR:A0EH68
33srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
34spp-19K04A8.9n/achrV 6,559,648C. elegans SPP-19 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
35kin-34R02C2.2n/achrV 245,158C. elegans KIN-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
36phy-3T20B3.7n/achrV 16,836,164C. elegans PHY-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
37srh-220F47C12.5n/achrIV 3,977,216C. elegans SRH-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38fbxa-203W05F2.5n/achrI 3,372,801This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
39C50C3.7C50C3.7n/achrIII 8,160,210contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
40F28C10.1F28C10.1n/achrX 543,683
41C26C6.8C26C6.8n/achrI 7,504,574contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) (3), PF00018 (SH3 domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR011511 (Variant SH3)
42Y75B8A.28Y75B8A.28n/achrIII 12,320,885contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for START A of cell cycle, and glucose and nitrogen repression of sporulation; SGD:YJL005W
43M151.2M151.2n/achrII 3,632,782contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
44K06H6.5K06H6.5n/achrV 577,400contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
45Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
46F48E8.4F48E8.4n/achrIII 5,456,244contains similarity to Interpro domain IPR009011 (Mannose-6-phosphate receptor, binding)
47srxa-10R10E11.7n/achrIII 9,795,820C. elegans SRXA-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
48pdhk-2ZK370.5n/achrIII 8,739,634C. elegans PDHK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005467 (Signal transduction histidine kinase, core), IPR004358 (Signal transduction histidine kinase-related protein, C-terminal), IPR003594 (ATP-binding region, ATPase-like)
49C13C4.6C13C4.6n/achrV 12,123,359contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
50inx-7K02B2.4n/achrIV 5,945,314C. elegans INX-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00876 Innexin contains similarity to Interpro domain IPR000990 (Innexin)