UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T23F4.3T23F4.32e-154chrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
2T08D2.6T08D2.6n/achrX 180,977contains similarity to Homo sapiens Protein YIPF4; ENSEMBL:ENSP00000238831
3srx-128F55B12.7n/achrV 13,838,056C. elegans SRX-128 protein ;
4spp-11T25D10.3n/achrII 6,406,317C. elegans SPP-11 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
5T15D6.12T15D6.12n/achrI 12,400,253contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
6Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
7T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
8his-8F45F2.12n/achrV 8,532,878his-8 encodes an H2B histone; his-8 is contained within the histone gene cluster HIS2.
9T05A7.1T05A7.1n/achrII 4,678,765
10T02D1.4T02D1.4n/achrIV 17,401,011contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11fbxa-53F07G6.7n/achrX 1,717,501C. elegans FBXA-53 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
12clec-234F26D2.12n/achrV 16,432,515C. elegans CLEC-234 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13T13F3.4T13F3.4n/achrV 16,265,325contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
14B0207.10B0207.10n/achrI 5,959,278
15fbxa-195R09B5.1n/achrV 1,435,696This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
16ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
17lips-8F31F6.7n/achrX 14,899,559C. elegans LIPS-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
18W04D12.1W04D12.1n/achrIII 5,837,006
19C07A9.10C07A9.10n/achrIII 9,685,849contains similarity to Pfam domain: PF00442 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolases family 2), Score=28.0, E-value=1e-05, N=1
20C44C10.6C44C10.6n/achrX 11,698,664contains similarity to Streptococcus pneumoniae GtrA family protein.; TR:Q97R28
21B0393.7B0393.7n/achrIII 4,777,124contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
22R03H4.5R03H4.5n/achrV 9,020,799contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
23srj-16T06A1.2n/achrV 1,955,236C. elegans SRJ-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24H12D21.3H12D21.3n/achrV 14,886,000contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
25C50A2.3C50A2.3n/achrIV 1,148,209
26C23G10.10C23G10.10n/achrIII 6,213,461
27B0507.6B0507.6n/achrV 8,749,589contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domain IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
28W08F4.5W08F4.5n/achrII 567,279
29F35C5.12F35C5.12n/achrII 12,912,321contains similarity to Interpro domain IPR003614 (Knottin)
30T08E11.1T08E11.1n/achrII 1,838,405This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
31math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
32ZK643.6ZK643.6n/achrIII 8,958,109contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
33tag-244C34H4.3n/achrIV 1,551,970C. elegans TAG-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
34K07A1.7K07A1.7n/achrI 9,597,007contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is hdc-PC;; FLYBASE:CG15532
35rlbp-1T23G11.5n/achrI 7,688,763C. elegans RLBP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00620 RhoGAP domain contains similarity to Interpro domains IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
36K04F10.2K04F10.2n/achrI 6,362,454contains similarity to Interpro domain IPR008979 (Galactose-binding like)
37srsx-2F20E11.2n/achrV 17,437,669C. elegans SRSX-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
38F16G10.15F16G10.15n/achrII 2,406,470contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
39C33A12.7C33A12.7n/achrIV 9,507,832contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
40C04G6.5C04G6.5n/achrII 5,085,937contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
41F57B9.1F57B9.1n/achrIII 6,962,648contains similarity to Pfam domain PF01243 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase contains similarity to Interpro domains IPR012349 (FMN-binding split barrel), IPR011576 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding core), IPR009002 (FMN-binding split barrel, related), IPR000659 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase)
42str-9F57A10.1n/achrV 15,759,569C. elegans STR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43K07A9.3K07A9.3n/achrIV 1,835,383contains similarity to Interpro domain IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase)
44snb-2F23H12.1n/achrV 12,345,050C. elegans SNB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domains IPR016444 (Synaptobrevin, metazoa/fungi), IPR001388 (Synaptobrevin)
45asna-2F47G3.2n/achrX 2,383,478C. elegans ASNA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02374 Anion-transporting ATPase contains similarity to Interpro domain IPR003348 (Anion-transporting ATPase)
46W03D2.7W03D2.7n/achrIV 4,062,904
47C47D12.5C47D12.5n/achrII 11,685,843
48D1079.1D1079.1n/achrX 4,405,551
49C08B6.5C08B6.5n/achrV 10,118,697contains similarity to Danio rerio Glutamate receptor delta-2 subunit precursor (GluR delta-2).; SW:Q68Y21
50F17E9.2F17E9.2n/achrIV 8,356,187