UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T23F4.2T23F4.27.000000000000001e-120chrII 1,164,528
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3Y54E2A.10Y54E2A.10n/achrII 14,791,729contains similarity to Dictyostelium discoideum Protein-tyrosine phosphatase 3 (EC 3.1.3.48) (Protein-tyrosine-sphosphate phosphohydrolase 3).; SW:PTP3_DICDI
4Y41C4A.6Y41C4A.6n/achrIII 11,697,361contains similarity to Methanococcus jannaschii Hypothetical protein MJ0951.; SW:Y951_METJA
5F21A10.4F21A10.4n/achrX 10,185,057contains similarity to Mus musculus Tumor rejection antigen P815A.; SW:TUR8_MOUSE
6T10D4.3T10D4.3n/achrII 3,130,228contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
7W05E10.2W05E10.2n/achrV 11,688,773contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000288462
8ZK899.1ZK899.1n/achrX 9,447,071
9npr-3C10C6.2n/achrIV 11,461,555C10C6.2 encodes a G-protein-coupled receptor for the FMRFamide-related peptides (FaRPs) encoded by flp-15; C10C6.2 is primarily coupled to Gi/Go proteins, since C10C6.2 signalling is blocked by pertussis toxin; because of its link to Gi/Go proteins, C10C6.2 is expected to be inhibitory
10M05B5.6M05B5.6n/achrI 7,184,379contains similarity to Homo sapiens Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1; ENSEMBL:ENSP00000262209
11K03B4.4K03B4.4n/achrV 4,684,430contains similarity to Interpro domain IPR002411 (Cereal allergen/alpha-amylase inhibitor, rice-type)
12K03A11.5K03A11.5n/achrX 13,066,078contains similarity to Enterobacteria phage RB49 Hypothetical protein.; TR:Q7Y3J5
13F49E12.7F49E12.7n/achrII 8,395,633contains similarity to Mycobacterium tuberculosis Hypothetical protein (HoxN/HupN/NixA family nickel transporter).; TR:O05804
14srx-136F09F3.12n/achrV 13,858,174C. elegans SRX-136 protein ;
15dkf-1W09C5.5n/achrI 13,644,346C. elegans DKF-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00069 (Protein kinase domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
16str-87F59E11.16n/achrV 8,987,304C. elegans STR-87 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17egrh-1C27C12.2n/achrX 14,847,486C27C12.2 is orthologous to the human gene BA436D10.3 (EARLY GROWTH RESPONSE 2 (KROX-20 (DROSOPHILA) HOMOLOG)) (EGR2; OMIM:129010), which when mutated leads to disease.
18F55C12.4F55C12.4n/achrII 5,857,731
19F40G9.8F40G9.8n/achrIII 164,235
20ZK938.6ZK938.6n/achrII 9,844,266contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
21sri-20AC3.1n/achrV 10,369,184C. elegans SRI-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22R04E5.7R04E5.7n/achrX 8,797,318
23F46G10.2F46G10.2n/achrX 13,325,413contains similarity to Interpro domain IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold)
24elt-3K02B9.4n/achrX 13,939,895The elt-3 gene encodes a GATA transcription factor expressed in the embryonic hypodermis; specifically, it is expressed in expressed in all of the major hypodermal cells except the lateral seam cells.
25T02E1.8T02E1.8n/achrI 8,236,518
26F59B10.6F59B10.6n/achrII 10,523,795contains similarity to Prochlorococcus marinus Possible paralytic/GBP/PSP peptide precursor.; TR:Q7TUU1
27Y81G3A.3Y81G3A.3n/achrII 13,087,735contains similarity to Pfam domains PF05773 (RWD domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28nas-39F38E9.2n/achrX 16,464,603C. elegans NAS-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (2), PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF00431 (CUB domain) (4), PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR015446 (Bone morphogenetic protein 1/tolloid-like protein), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006210 (EGF), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013091 (EGF calcium-binding)
29F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
30fbxa-3T08E11.7n/achrII 1,819,483This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
31F42G8.5F42G8.5n/achrIV 8,137,753
32F54D12.8F54D12.8n/achrII 1,396,527contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR003609 (Apple-like)
33srh-174F40D4.1n/achrV 17,179,348C. elegans SRH-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34F35C11.6F35C11.6n/achrII 8,258,607contains similarity to Homo sapiens Oxysterol binding protein-related protein 11; ENSEMBL:ENSP00000296220
35R05C11.1R05C11.1n/achrIV 2,070,210contains similarity to Interpro domain IPR014756 (Immunoglobulin E-set)
36ZK287.4ZK287.4n/achrV 9,682,882contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR000694 (Proline-rich region), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
37snb-1T10H9.4n/achrV 6,656,014The snb-1 gene encodes synaptobrevin, a synaptic vesicle protein orthologous to human vesicle-associated membrane protein 1 (VAMP1 OMIM:185880) and 2 (VAMP2 OMIM:185881), and is required for viability and synaptic transmission; SNB-1 is likely to play a role in vesicle docking and/or fusion and is expressed in neurons where it colocalizes with synaptic vesicle proteins RAB-3 and synaptotagmin.
38T20D4.5T20D4.5n/achrV 3,414,578contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
39ZK896.1ZK896.1n/achrIV 12,874,056contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
40B0546.5B0546.5n/achrIV 3,389,078contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domain IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
41mab-5C08C3.3n/achrIII 7,780,108mab-5 encodes a homeodomain transcription factor related to the Antennapedia, Ultrabithorax, and abdominal-A family of homeodomain proteins; during postembryonic development, mab-5 is required cell autonomously for specification of posterior cell fates, including hypodermal and neuronal fates, programmed cell deaths, cell proliferation and migration, and fate specification of the male-specific copulatory muscles and sensory rays; in addition, ectopic expression of mab-5 is sufficient to alter cell fates, such as direction of migration or sensory ray identity; in regions of the body where mab-5 expression overlaps with that of lin-39, another C. elegans HOM-C gene, the two genes appear to either compensate for one another's activity or act combinatorially to promote cell fates distinct from those where either gene is expressed alone; a mab-5:lacZ reporter fusion is expressed in cells in the posterior body region from the mid-gastrulation stage of embryogenesis through larval and adult stages; further, antibody staining reveals that MAB-5 expression in the V5 lineage is dynamic, switching on and off several times, while expression in V6 is continuous throughout most of the L1-L3 larval stages; early MAB-5 expression is V6 is dependent upon wild-type activity of pal-1, which encodes the C. elegans Caudal ortholog.
42srx-2R03H4.2n/achrV 9,010,093C. elegans SRX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
43clec-37Y102A5B.3n/achrV 16,851,225C. elegans CLEC-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
44adt-1C02B4.1n/achrX 12,683,974The adt-1 gene encodes a metalloproteinase with disintegrin-like and metalloproteinase with thrombospondin type I motifs (ADAMTS) that is required for male tail morphogenesis.
45F40A3.7F40A3.7n/achrV 7,897,725contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46M03F8.4M03F8.4n/achrV 5,932,159contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
47W01B6.3W01B6.3n/achrIV 10,071,407contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
48C39F7.5C39F7.5n/achrV 1,267,440contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold)
49F42G2.5F42G2.5n/achrII 2,417,192contains similarity to Pfam domains PF00635 (MSP (Major sperm protein) domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000535 (Major sperm protein)
50fbxa-115Y113G7B.3n/achrV 20,186,739This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.