UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T22E5.3T22E5.30chrX 6,386,631contains similarity to Pfam domains PF01682 (DB module) , PF00041 (Fibronectin type III domain) contains similarity to Interpro domains IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR002602 (Protein of unknown function DB), IPR007110 (Immunoglobulin-like)
2C08A9.6C08A9.6n/achrX 17,095,336contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
3T10E10.3T10E10.3n/achrX 6,313,109contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
4C07E3.5C07E3.5n/achrII 10,364,567contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
5clec-227F08H9.5n/achrV 14,473,432C. elegans CLEC-227 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6sri-2F36G9.9n/achrV 15,964,503C. elegans SRI-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
7ZC266.2ZC266.2n/achrV 4,696,862
8srg-16F15A4.4n/achrII 12,468,465C. elegans SRG-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
9fut-4K12H6.3n/achrII 2,820,961fut-4 encodes a member of the glycosyltransferase 10 family.
10C31B8.1C31B8.1n/achrV 2,932,269
11ZK688.3ZK688.3n/achrIII 7,894,068contains similarity to Pfam domain PF01557 Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR010916 (TonB box, conserved site), IPR011234 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-related), IPR002529 (Fumarylacetoacetase, C-terminal-like)
12B0564.4B0564.4n/achrIV 13,112,036contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
13pqn-62T03G11.1n/achrX 5,200,980The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
14ugt-15C44H9.1n/achrV 12,828,911C. elegans UGT-15 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
15W03G1.4W03G1.4n/achrIV 509,467contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
16nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
17C54A12.3C54A12.3n/achrII 5,261,141
18ZC266.1ZC266.1n/achrV 4,700,209
19srx-95F41G3.11n/achrII 6,753,887C. elegans SRX-95 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003915 (Polycystic kidney disease type 2 protein)
20srd-33T19H12.4n/achrV 4,873,237C. elegans SRD-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21srh-4K09D9.6n/achrV 4,011,203C. elegans SRH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
22Y32B12A.5Y32B12A.5n/achrV 16,487,248contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
23srd-32T19H12.5n/achrV 4,867,995C. elegans SRD-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
24mec-4T01C8.7n/achrX 16,805,158mec-4 encodes an amiloride-sensitive Na+ channel protein (degenerin) required to sense gentle mechanical stimuli (e.g. touch) along the body wall; MEC-4 is paralogous to, and coexpressed with, MEC-10, in all six touch cell neurons where they form a heteromeric mechanotransduction channel.
25Y73C8C.4Y73C8C.4n/achrV 3,101,079contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
26F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
27T09E11.10T09E11.10n/achrI 12,346,532contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
28B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
29C10G11.6C10G11.6n/achrI 6,291,932
30sra-24T06G6.2n/achrI 12,706,029C. elegans SRA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
31ins-3ZK75.3n/achrII 5,990,388ins-3 encodes one of several insulin-related peptides; INS-3 is classified as a Type-beta insulin based on the predicted arrangement of disulfide bonds; gfp gene fusions with the promoter and enhancer regions indicate that INS-3 is expressed in some amphid sensory neurons.
32T03E6.8T03E6.8n/achrV 16,601,940contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33C02B8.7C02B8.7n/achrX 8,137,743
34K08F9.1K08F9.1n/achrV 15,138,399contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
35W01A11.2W01A11.2n/achrV 6,497,783contains similarity to Pfam domain PF03982 Diacylglycerol acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR007130 (Diacylglycerol acyltransferase)
36H35N09.1H35N09.1n/achrX 8,607,362
37Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
38C53B4.6C53B4.6n/achrIV 8,985,786contains similarity to Pfam domain PF08449 UAA transporter family contains similarity to Interpro domain IPR013657 (UAA transporter)
39F18E9.1F18E9.1n/achrX 8,601,003
40F26D11.6F26D11.6n/achrV 7,955,880
41srh-155F40D4.2n/achrV 17,180,821C. elegans SRH-155 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
42str-44C42D4.4n/achrIV 7,177,788C. elegans STR-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F39F10.5F39F10.5n/achrX 16,913,317
44ubc-21C06E2.3n/achrX 8,870,667C. elegans UBC-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00179 Ubiquitin-conjugating enzyme contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR009060 (UBA-like), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
45ZK757.1ZK757.1n/achrIII 9,869,795contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR000883 (Cytochrome c oxidase, subunit I), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
46B0284.2B0284.2n/achrIII 4,382,911contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Progesterone-induced-blocking factor 1; ENSEMBL:ENSP00000317144
47srz-79C09G12.2n/achrIV 3,494,391C. elegans SRZ-79 protein ;
48clec-12T27F6.2n/achrI 12,477,625C. elegans CLEC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
49srw-19T10H4.8n/achrV 15,280,555C. elegans SRW-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50C44H9.8C44H9.8n/achrV 12,847,707contains similarity to Bacillus anthracis Sensory box histidine kinase PhoR.; TR:Q81L02