UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sptf-2T22C8.52.9999999999999997e-86chrII 8,626,542C. elegans SPTF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C18E9.10C18E9.10n/achrII 8,959,611contains similarity to Pfam domain PF07770 SFT2-like protein contains similarity to Interpro domain IPR011691 (SFT2-like)
4ZK697.8ZK697.8n/achrV 1,748,793contains similarity to Pfam domain PF00576 HIUase/Transthyretin family contains similarity to Interpro domain IPR000895 (Transthyretin)
5ZC116.1ZC116.1n/achrV 12,610,320contains similarity to Interpro domain IPR001419 (HMW glutenin)
6F35C8.1F35C8.1n/achrX 5,378,292contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
7Y63D3A.4Y63D3A.4n/achrI 14,099,306contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR005637 (TAP, C-terminal), IPR009060 (UBA-like), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
8srh-245F31F4.9n/achrV 655,327C. elegans SRH-245 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9Y38H6A.2Y38H6A.2n/achrV 20,325,833contains similarity to Chlamydia pneumoniae Hypothetical protein CPn0168.; TR:Q9Z916
10scl-20ZK384.2n/achrV 18,733,634C. elegans SCL-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
11ZK185.1ZK185.1n/achrIV 4,550,393contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
12R12B2.3R12B2.3n/achrIII 5,806,220
13C05E11.2C05E11.2n/achrX 4,587,427
14nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
15C05E4.7C05E4.7n/achrV 742,319
16D2023.6D2023.6n/achrV 11,828,318D2023.6 is orthologous to a set of uncharacterized putative protein kinases from eukaryotes and from prokaryotes (e.g., UbiB from E. coli), and paralogous to COQ-8 from C. elegans and ABC1 (COQ8) from S. cerevisiae; like COQ-8, D2023.6 may be involved in ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis.
17C50B8.3C50B8.3n/achrV 13,567,762contains similarity to Pfam domain PF08547 Complex I intermediate-associated protein 30 (CIA30) contains similarity to Interpro domain IPR013857 (NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30)
18ZC132.4ZC132.4n/achrV 4,302,829contains similarity to Uukuniemi virus Envelope glycoprotein precursor (GP) (M polyprotein) [Contains:sGlycoprotein G1; Glycoprotein G2].; SW:P09613
19F20E11.7F20E11.7n/achrV 17,465,622contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR005098 (Protein of unknown function DUF281), IPR006662 (Thioredoxin-related)
20R06B9.2R06B9.2n/achrII 13,767,269contains similarity to Pfam domain PF00339 Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
21C34D4.1C34D4.1n/achrIV 7,158,487contains similarity to Interpro domain IPR000956 (Stathmin)
22C24G7.1C24G7.1n/achrI 4,110,897contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
23C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
24F28B1.5F28B1.5n/achrV 17,058,496
25str-61F14F8.1n/achrV 16,670,286C. elegans STR-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26T06C12.14T06C12.14n/achrV 15,900,422contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
27C39E6.2C39E6.2n/achrX 4,754,889
28Y75B8A.32Y75B8A.32n/achrIII 12,356,632contains similarity to Danio rerio PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2s(Trinucleotide repeat-containing gene 15 protein).; SW:Q4KME6
29M4.1M4.1n/achrIV 3,215,716contains similarity to Pfam domain PF00498 FHA domain contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR009053 (Prefoldin), IPR000253 (Forkhead-associated)
30T05A8.3T05A8.3n/achrII 2,716,038
31F34D6.2F34D6.2n/achrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
32W01H2.2W01H2.2n/achrX 4,218,344
33W02A2.5W02A2.5n/achrIV 13,344,491contains similarity to Interpro domains IPR000589 (Ribosomal protein S15), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001508 (NMDA receptor)
34math-17C16C4.9n/achrII 1,880,205C. elegans MATH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
35clec-19F36H5.6n/achrII 1,744,331C. elegans CLEC-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36R07E5.11R07E5.11n/achrIII 4,415,004contains similarity to Salmonella typhimurium Putative surface-exposed virulence protein bigA precursor.; SW:BIGA_SALTY
37nhr-178F16B4.9n/achrV 1,605,896C. elegans NHR-178 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38srx-122F35F10.8n/achrV 3,296,984C. elegans SRX-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
39C30G4.5C30G4.5n/achrX 17,071,948
40srg-59C24B9.7n/achrV 2,724,113C. elegans SRG-59 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
41T06E6.10T06E6.10n/achrV 15,418,719contains similarity to Pfam domain PF01826 Trypsin Inhibitor like cysteine rich domain contains similarity to Interpro domains IPR002919 (Protease inhibitor I8, cysteine-rich trypsin inhibitor-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
42clec-24F49A5.4n/achrV 16,863,042C. elegans CLEC-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43Y40H7A.9Y40H7A.9n/achrIV 15,207,561contains similarity to Pfam domains PF01461 (7TM chemoreceptor) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
44srj-9T20C4.1n/achrV 3,432,956C. elegans SRJ-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45F58E1.7F58E1.7n/achrII 1,678,353contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
46C46H11.3C46H11.3n/achrI 5,041,773contains similarity to Pfam domain PF04699 ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) contains similarity to Interpro domains IPR006789 (ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc)), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
47C01B4.6C01B4.6n/achrV 2,501,738contains similarity to Pfam domain PF01263 Aldose 1-epimerase contains similarity to Interpro domains IPR008183 (Aldose 1-epimerase), IPR015443 (Aldose-1-epimerase), IPR011013 (Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding), IPR014718 (Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding, subgroup)
48fbxa-187F47H4.7n/achrV 17,340,899This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
49srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50C30E1.2C30E1.2n/achrX 16,927,410