UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T21G5.1T21G5.10chrI 6,875,615contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
2C35E7.6C35E7.6n/achrI 10,818,223
3F28B1.2F28B1.2n/achrV 17,047,282contains similarity to Arabidopsis thaliana T12C22.10 protein.; TR:Q9LPE8
4clec-194Y116A8A.8n/achrIV 16,832,361C. elegans CLEC-194 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5exp-1H35N03.1n/achrII 6,159,051exp-1 encodes an excitatory, cation-selective GABA receptor; EXP-1 activity is essential for the enteric muscle contractions that are the third in a series of three independent muscle contractions controlling defecation, and when expressed in Xenopus oocytes, EXP-1 is capable of forming a cation-selective GABA receptor; a rescuing EXP-1::GFP reporter fusion is expressed in the intestinal and anal depressor muscles, where it localizes to regions consistent with the positions of neuromuscular junctions; expression is also observed in neurons, including PDA, RID, ADE, and SABD.
6sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7C14E2.4C14E2.4n/achrX 1,819,435contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
8F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
9Y38H6C.18Y38H6C.18n/achrV 20,542,275contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Chromatin Assembly Complex, subunit 1: largest (p90) subunit of three-subunit protein complex (yeast CAF-I) involved in DNA-replication-linked nucleosome assembly. Homol. to p150 subunit human Chromatin Assembly Factor-I (CAF-I); SGD:YPR018W
10srt-48Y41E3.15n/achrIV 15,067,356C. elegans SRT-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
11clec-146Y48E1B.9n/achrII 13,592,126C. elegans CLEC-146 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12cwp-3C37H5.4n/achrV 4,843,326cwp-3 encodes an unfamiliar protein predicted to be secreted and alleged to be coexpressed with polycystins; CWP-3 is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi screens.
13T21E8.4T21E8.4n/achrX 10,882,602contains similarity to Rattus norvegicus Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase (EC 1.1.1.49) (G6PD).; SW:G6PD_RAT
14H38K22.4H38K22.4n/achrIII 4,323,189contains similarity to Interpro domain IPR010070 ()
15srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;
16C43F9.5C43F9.5n/achrIV 10,590,044contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
17str-143C09H5.4n/achrV 8,068,920C. elegans STR-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18ZC132.2ZC132.2n/achrV 4,311,620
19T06G6.4T06G6.4n/achrI 12,713,797contains similarity to Arabidopsis thaliana Synaptonemal complex protein 1 (Synaptonemal complex central regionsprotein ZYP1a).; SW:Q9LME2
20srbc-10C18B10.2n/achrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
21F57C12.2F57C12.2n/achrX 548,426contains similarity to Pfam domain PF04670 Gtr1/RagA G protein conserved region contains similarity to Interpro domains IPR009053 (Prefoldin), IPR006762 (Gtr1/RagA G protein)
22Y116A8A.6Y116A8A.6n/achrIV 16,826,929contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
23C08G5.3C08G5.3n/achrII 744,119contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
24K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
25C16D6.1C16D6.1n/achrX 12,525,704contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
26T20B6.1T20B6.1n/achrIII 2,898,031contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
27C17H12.6C17H12.6n/achrIV 6,821,899contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
28fbxa-223ZC513.10n/achrV 8,064,176fbxa-223 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; FBXA-223 also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
29C44C10.10C44C10.10n/achrX 11,690,474contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Homolog of the human adrenoleukodystrophy transporter; forms a heterodimer with Pxa1p of two half ATP-binding cassette transporters in the peroxisome membrane; SGD:YKL188C
30F42C5.10F42C5.10n/achrIV 7,323,684contains similarity to Interpro domains IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region)
31F47C12.7F47C12.7n/achrIV 3,994,654contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
32T09E8.4T09E8.4n/achrV 13,182,889contains similarity to Pfam domain PF02460 Patched family contains similarity to Interpro domains IPR003392 (Patched), IPR000731 (Sterol-sensing 5TM box)
33T16H12.9T16H12.9n/achrIII 10,110,649contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RNA polymerase I subunit A34.5; SGD:YJL148W
34C06G3.4C06G3.4n/achrIV 7,029,714contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
35T01C3.5T01C3.5n/achrV 14,997,353contains similarity to Oryza sativa Similar to gene for Pib.; TR:Q9LWW7
36D1037.5D1037.5n/achrI 3,692,099contains similarity to Pfam domains PF01734 (Patatin-like phospholipase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR002110 (Ankyrin)
37C45G9.11C45G9.11n/achrIII 5,066,320
38clec-154F10F2.5n/achrIII 4,639,461C. elegans CLEC-154 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
39T22B7.4T22B7.4n/achrX 5,639,932contains similarity to Pfam domain PF07039 Protein of unknown function (DUF1325) contains similarity to Interpro domain IPR010750 (Protein of unknown function DUF1325)
40clec-193Y116A8A.3n/achrIV 16,805,692C. elegans CLEC-193 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
41F48G7.9F48G7.9n/achrV 628,338contains similarity to Pfam domain PF00130 Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
42T28D6.4T28D6.4n/achrIII 11,363,196contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
43F45C12.1F45C12.1n/achrII 1,740,047contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domains IPR000494 (EGF receptor, L domain), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
44Y56A3A.9Y56A3A.9n/achrIII 11,884,269contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR000694 (Proline-rich region)
45tkr-1C38C10.1n/achrIII 9,386,535tkr-1 encodes a G protein-coupled receptor that is the C. elegans tachykinin-like neuropeptide receptor homolog; by homology, TKR-1 is predicted to function in modulation of excitatory neurotransmission; as loss of tkr-1 activity via RNAi results in moderate reduction of fat content, TKR-1 may play a specific role in regulating lipid metabolism; a tkr-1 reporter gene fusion is reportedly expressed in the socket cells of the deirid and post-deirid sensilla from the L2 larval stage through adulthood.
46F38E9.6F38E9.6n/achrX 16,440,044
47flp-23F22B7.2n/achrIII 8,651,368C. elegans FLP-23 protein ;
48Y113G7B.15Y113G7B.15n/achrV 20,226,741contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
49F35D2.4F35D2.4n/achrII 7,581,981contains similarity to Interpro domain IPR009030 (Growth factor, receptor)
50str-39F37B4.12n/achrV 2,878,851C. elegans STR-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002355 (Multicopper oxidase, copper-binding site)