UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1hpd-1T21C12.20chrIII 10,536,487hpd-1 encodes a putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase required for normally short lifespan and for negative regulation of the dauer larval stage, with loss of hpd-1 function prolonging lifespan and promoting dauer formation; hpd-1 is a (perhaps evolutionarily conserved) target of transcriptional activation by DAF-16; HPD-1 is orthologous to human HPD (OMIM:609695, mutated in tyrosinemia type III), and is paralogous to C31H2.4 and human HPDL/GLOXD1; HPD-1 is expressed in hypodermis and intestine, and is required for the tyrosinemic phenotype of K10C2.4(RNAi) animals.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C28H8.3C28H8.3n/achrIII 5,911,573contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF04851 (Type III restriction enzyme, res subunit) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR006935 (Restriction endonuclease, type I, R subunit/Type III, Res subunit), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
4Y17G7B.8Y17G7B.8n/achrII 12,026,748contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
5C30F12.2C30F12.2n/achrI 6,969,030contains similarity to Pfam domain PF03969 AFG1-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005654 (AFG1-like ATPase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
6H34I24.1H34I24.1n/achrIII 2,847,797
7rpl-20E04A4.8n/achrIV 4,749,465rpl-20 encodes a large ribosomal subunit L18a protein.
8C44C8.4C44C8.4n/achrIV 891,926This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
9rpl-30Y106G6H.3n/achrI 10,436,561rpl-30 encodes a large ribosomal subunit L30 protein; by homology, RPL-30 is predicted to function in protein biosynthesis; in C. elegans, loss of rpl-30 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities.
10C44C8.3C44C8.3n/achrIV 896,078This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
11E04F6.6E04F6.6n/achrII 7,198,430contains similarity to Interpro domain IPR000183 (Orn/DAP/Arg decarboxylase 2)
12F58H7.8F58H7.8n/achrIV 908,458
13F16H6.10F16H6.10n/achrV 18,223,587contains similarity to Haemophilus influenzae Putative protease HI0419 (EC 3.4.-.-).; SW:YEGQ_HAEIN
14C44C8.1C44C8.1n/achrIV 904,383This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
15C44C8.2C44C8.2n/achrIV 900,230
16C26E1.2C26E1.2n/achrV 13,306,168contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Eukaryotic thiol (cysteine) protease)
17F56H11.6F56H11.6n/achrIV 9,528,961contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
18fbxa-31ZC47.5n/achrIII 1,270,493This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
19fbxa-59T12B5.8n/achrIII 942,155This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
20W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
21unc-31ZK897.1n/achrIV 12,780,334unc-31 encodes a pleckstrin homology (PH) domain-containing protein that is the C. elegans ortholog of human CADPS/CAPS (calcium-dependent activator protein for secretion OMIM:604667); UNC-31 functions in post-docking calcium-regulated dense-core vesicle fusion that is required for egg laying, locomotion, pharyngeal pumping, and recovery from the dauer larval stage; in addition, UNC-31 functions in the insulin receptor signaling pathway that regulates adult life span where it may control Ca[2+]-regulated secretion of an insulin-like ligand; UNC-31 is not required for synaptic vesicle exocytosis; unc-31::gfp transcriptional reporters are expressed in most, if not all, neurons, vulval muscles, vulval cells, the spermatheca, and secretory cells such as the uterine UV1 cells; UNC-31::GFP translational fusions localize to neuronal cell bodies, axonal projections and to sites of synaptic contact, consistent with other dense-core vesicle proteins.
22T10E10.4T10E10.4n/achrX 6,318,637T10E10.4 encodes a large (966-residue) protein, predicted to be secreted, with two N-terminal chitin-binding peritrophin-A domains followed by 14 cysteine-rich domains and one C-terminal EB module; the general organization of T10E10.4 protein resembles that of K04H4.2; T10E10.4 has no obvious function in mass RNAi assays but, like CEJ-1 and CPG-2, might participate in chitin synthesis.
23skr-3F44G3.6n/achrV 16,122,209The skr-3 gene encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae that has no known function in vivo, since skr-3(RNAi) animals are at least superficially normal.
24bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
25ttr-31F58A3.5n/achrX 11,008,594C. elegans TTR-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domains IPR001534 (Transthyretin-like), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
26col-127F54D1.3n/achrIV 11,265,407C. elegans COL-127 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000681 (Adrenergic receptor, beta 3), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
27ZC373.1ZC373.1n/achrX 10,055,836The ZC373.1 gene encodes an ortholog of the human gene CYSTATHIONINE-BETA-SYNTHASE (CBS), which when mutated leads to homocystinuria (OMIM:236200).
28srv-31T13A10.9n/achrIV 6,270,882C. elegans SRV-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001209 (Ribosomal protein S14), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
29C03B1.7C03B1.7n/achrX 6,343,858contains similarity to Sulfolobus tokodaii DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:Q96YR5
30asg-2C53B7.4n/achrX 6,841,624asg-2 encodes a homolog of subunit G of the membrane-bound F0 proton channel portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); asg-2 activity is required for growth at a normally high rate and for normal osmoregulation; in addition, asg-2 activity is required for response to hermaphrodite contact, the first step in a series of stereotypical male mating behaviors; an ASG-2::GFP fusion localizes to mitochondria and to cilia of the male-specific CEM neurons.
31K05F1.10K05F1.10n/achrII 5,805,057K05F1.10 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; K05F1.10 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; although it has no obvious function in mass RNAi assays, K05F1.10 transcription is reproducibly induced by infection, suggesting that it may participate in innate immunity.
32C02G6.1C02G6.1n/achrV 5,878,092contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
33F46G10.4F46G10.4n/achrX 13,335,352contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
34F53C11.1F53C11.1n/achrV 13,776,738contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
35Y48A6B.7Y48A6B.7n/achrIII 11,025,784contains similarity to Pfam domain PF00383 Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region contains similarity to Interpro domains IPR002125 (CMP/dCMP deaminase, zinc-binding), IPR016193 (Cytidine deaminase-like)
36R05D3.6R05D3.6n/achrIII 8,350,531R05D3.6 encodes the epsilon subunit of the soluble, catalytic F1 portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); RNAi experiments indicate that loss of R05D3.6 activity has minor effects on growth rate.
37W02B12.9W02B12.9n/achrII 11,470,937contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
38F34H10.4F34H10.4n/achrX 9,649,656contains similarity to Interpro domain IPR002253 (Flavin-containing monooxygenase (FMO) 1)
39F21G4.1F21G4.1n/achrX 9,890,917contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF03137 (Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR000539 (Frizzled protein), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
40H25P06.1H25P06.1n/achrI 11,317,448contains similarity to Pfam domains PF00349 (Hexokinase) , PF03727 (Hexokinase) contains similarity to Interpro domain IPR001312 (Hexokinase)
41T21F4.1T21F4.1n/achrX 5,631,021T21F4.1 is orthologous to the human gene ARGINASE TYPE I ERYTHROID VARIANT (ARG1; OMIM:207800), which when mutated leads to argininemia.
42acl-3ZK809.2n/achrIV 11,651,359acl-3 encodes a phosphate acyltransferase that is orthologous to human tafazzin (TAZ; OMIM:300394, mutated in Barth syndrome); by homology, ACL-3 is predicted to be a mitochondrial protein that plays a role in phospholipid metabolism, although loss of acl-3 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious defects.
43F43G9.1F43G9.1n/achrI 8,607,769contains similarity to Pfam domain PF00180 Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR004434 (Isocitrate dehydrogenase NAD-dependent, mitochondrial), IPR001804 (Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase)
44C08B6.2C08B6.2n/achrV 10,106,583contains similarity to Rattus norvegicus Adenomatous polyposis coli protein (APC protein).; SW:APC_RAT
45ZK1251.9ZK1251.9n/achrIV 9,701,830contains similarity to Pfam domain PF08513 LisH contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR006594 (LisH dimerisation motif), IPR013720 (LisH dimerisation motif, subgroup), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR016024 (Armadillo-type fold)
46cyp-35B1K07C6.4n/achrV 3,940,140C. elegans CYP-35B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
47F01D5.2F01D5.2n/achrII 13,998,627contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR001368 (TNFR/CD27/30/40/95 cysteine-rich region), IPR000480 (Glutelin), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
48T19H12.3T19H12.3n/achrV 4,886,241contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
49F09A5.1F09A5.1n/achrX 13,132,007contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
50F42C5.4F42C5.4n/achrIV 7,290,079contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)