UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-183T20D3.14e-110chrIV 9,328,354C. elegans CLEC-183 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3C50A2.4C50A2.4n/achrIV 1,160,591contains similarity to Pfam domain PF00178 Ets-domain contains similarity to Interpro domains IPR000418 (Ets), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding)
4W06G6.10W06G6.10n/achrV 16,646,964contains similarity to Escherichia coli O157:H7 C4-type zinc finger protein (TraR family).; TR:Q8X2P7
5E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
6C06C6.6C06C6.6n/achrV 15,990,153contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
7C33E10.5C33E10.5n/achrX 17,276,148contains similarity to Interpro domain IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
8E01B7.1E01B7.1n/achrV 17,926,717contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR000694 (Proline-rich region)
9gcy-35T04D3.4n/achrI 13,329,337C. elegans GCY-35 protein; contains similarity to Pfam domains PF07700 (Heme NO binding) , PF07701 (Heme NO binding associated) , PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR011645 (Haem NO binding associated), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase)
10D2045.7D2045.7n/achrIII 10,480,900contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
11sri-54T10D4.8n/achrII 3,136,737C. elegans SRI-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
12B0336.3B0336.3n/achrIII 5,713,118contains similarity to Pfam domain PF00642 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) contains similarity to Interpro domains IPR000571 (Zinc finger, CCCH-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
13srh-44B0334.7n/achrII 11,516,530C. elegans SRH-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14T25D1.3T25D1.3n/achrX 16,506,246This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
15F28A10.2F28A10.2n/achrII 829,085contains similarity to Pfam domains PF05050 (Protein of unknown function (DUF672)) , PF02995 (Protein of unknown function (DUF229)) contains similarity to Interpro domains IPR007744 (Protein of unknown function DUF672), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
16F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
17Y39E4B.6Y39E4B.6n/achrIII 13,072,610contains similarity to Rattus norvegicus Nucleolar protein NOP5 (Nucleolar protein 5) (Nopp140 associatedsprotein).; SW:NOP5_RAT
18Y48A6B.1Y48A6B.1n/achrIII 10,993,565contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19F13H8.9F13H8.9n/achrII 6,280,371contains similarity to Pfam domain PF00266 Aminotransferase class-V contains similarity to Interpro domains IPR016454 (Cysteine desulphurase, NifS), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
20F44D12.10F44D12.10n/achrIV 10,036,818contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
21cyp-33B1C25E10.2n/achrV 9,042,479C. elegans CYP-33B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
22F46B3.16F46B3.16n/achrV 20,630,275
23C17D12.7C17D12.7n/achrI 11,607,946contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in bud-site selection; diploid mutants display a unipolar budding pattern instead of the wild-type bipolar pattern; SGD:YGL174W
24T11F1.3T11F1.3n/achrII 2,955,703
25bli-3F56C11.1n/achrI 150,659bli-3 encodes a large homolog of dual oxidase ('Ce-Duox1'), with an N-terminal peroxidase domain, two central calmodulin-binding EF hands, and a C-terminal superoxide-generating NADPH-oxidase domain; BLI-3 is required for dityrosine cross-linking of collagen, and thus for cuticular integrity; BLI-3 is thought to use cytosolic NADPH to generate reactive oxygen, which then drives the peroxidase ectodomain to cross-link free tyrosine in collagen; BLI-3 is expressed exclusively in hypodermal cells at low levels, with peaks of expression corresponding to collagen/cuticle biosynthesis.
26ins-24ZC334.3n/achrI 14,031,394ins-24 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-24 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans, but as loss of INS-24 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of INS-24 in C. elegans development is not yet clear.
27T07A5.3T07A5.3n/achrIII 10,301,759contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
28ZK1055.5ZK1055.5n/achrV 6,582,618contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
29pqn-84Y41C4A.5n/achrIII 11,701,451The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
30C44E4.2C44E4.2n/achrI 4,632,370contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
31C01B12.5C01B12.5n/achrII 10,817contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domains IPR000615 (Bestrophin), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein)
32osm-6R31.3n/achrV 11,925,995osm-6 encodes a novel protein that is orthologous to the IFT52 component of the intraflagellar transport particle; osm-6 activity is required cell autonomously for proper sensory cilium structure and thus for normal ciliated sensory neuron function; OSM-6 is a component of the intraflagellar transport particle subcomplex B, and OSM-6::GFP reporter fusions are expressed exclusively in ciliated sensory neurons.
33far-5F15B9.3n/achrV 12,996,198far-5 encodes a member of a class of fatty acid-and retinol-binding proteins that are known to be secreted by parasitic nematodes and plants; far-5 binds lipid in fluorescence-based assays, however, the precise function of far-5 is not known.
34Y81G3A.4Y81G3A.4n/achrII 13,092,774contains similarity to Guillardia theta 60S acidic ribosomal protein P0.; TR:Q98S65
35ZK721.4ZK721.4n/achrX 8,780,140contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36R10F2.6R10F2.6n/achrIII 2,940,362contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
37F22G12.5F22G12.5n/achrI 13,172,567contains similarity to Interpro domain IPR001765 (Carbonic anhydrase)
38C33G8.2C33G8.2n/achrV 7,011,095contains similarity to Interpro domains IPR002038 (Osteopontin), IPR005448 (Voltage-dependent calcium channel, P/Q-type, alpha-1 subunit)
39T23G11.1T23G11.1n/achrI 7,701,721contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I452
40srh-178ZK228.8n/achrV 18,479,364C. elegans SRH-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41srh-275C03G6.7n/achrV 7,353,665C. elegans SRH-275 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42Y53C10A.5Y53C10A.5n/achrI 12,000,702contains similarity to Interpro domain IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)
43T07D3.2T07D3.2n/achrII 902,779contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
44C18D11.1C18D11.1n/achrIII 11,818,072contains similarity to Sporobolus stapfianus Hypothetical protein.; TR:O04820
45T21G5.2T21G5.2n/achrI 6,870,894
46C54H2.4C54H2.4n/achrX 5,768,086
47snt-6C08G5.4n/achrII 747,906C. elegans SNT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
48fbxb-118W06A11.3n/achrII 4,063,201C. elegans FBXB-118 protein ;
49F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
50Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR