UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-219T19A5.50chrV 8,966,534C. elegans NHR-219 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F14F9.6F14F9.6n/achrV 5,148,306
4sre-6F28H7.9n/achrV 10,761,699C. elegans SRE-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
5W03G1.8W03G1.8n/achrIV 527,981
6D2089.3D2089.3n/achrII 10,663,519contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC150383; ENSEMBL:ENSP00000325301
7gap-1T24C12.2n/achrX 2,193,920gap-1 encodes a member of the Ras GTPase-activating protein family; negatively regulates the let-60 pathway with respect to vulval development.
8srg-41T19C4.3n/achrV 11,161,148C. elegans SRG-41 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
9T17A3.10T17A3.10n/achrIII 155,573contains similarity to Interpro domain IPR007110 (Immunoglobulin-like)
10T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
11F59D6.4F59D6.4n/achrV 3,030,897contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
12R10D12.6R10D12.6n/achrV 13,949,458contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
13srg-32T21C9.7n/achrV 10,587,952C. elegans SRG-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
14C44H9.2C44H9.2n/achrV 12,832,016contains similarity to Antirrhinum majus ACC synthase 2 (Fragment).; TR:Q9ZT10
15srbc-11C18B10.1n/achrV 7,494,565C. elegans SRBC-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16pde-1T04D3.3n/achrI 13,314,797C. elegans PDE-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF08499 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase N-terminal) , PF00233 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase) contains similarity to Interpro domains IPR002073 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase), IPR013706 (3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase N-terminal), IPR003607 (Metal-dependent phosphohydrolase, HD region)
17C50F2.7C50F2.7n/achrI 3,900,880
18B0496.1B0496.1n/achrIV 7,446,888contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ), IPR000210 (BTB/POZ-like)
19C40H1.3C40H1.3n/achrIII 9,328,239contains similarity to Homo sapiens Protein; VG:OTTHUMP00000003630
20Y62H9A.14Y62H9A.14n/achrX 11,922,107contains similarity to Interpro domain IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
21T05A6.5T05A6.5n/achrII 7,824,034contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
22dod-20B0554.6n/achrV 423,333C. elegans DOD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
23C08F11.2C08F11.2n/achrIV 13,622,516contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Hypothetical protein MTH421.; SW:Y421_METTH
24nhr-159C17E7.70.005chrV 3,876,286C. elegans NHR-159 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
25F35C5.11F35C5.11n/achrII 12,909,598contains similarity to Mus musculus Lymphocyte antigen Ly-6D precursor (Thymocyte B cell antigen) (ThB).; SW:LY6D_MOUSE
26M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
27F52E1.3F52E1.3n/achrV 8,395,551
28srb-1C27D6.10n/achrII 5,170,361C. elegans SRB-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
29gpa-9F56H9.4n/achrV 12,648,055gpa-9 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ASJ, PHB, PVQ, pharyngeal muscle, and the spermatheca.
30T05C3.2T05C3.2n/achrV 5,498,362The T05C3.2 gene encodes a protein that may be involved in apoptosis.
31C53C11.2C53C11.2n/achrX 17,337,870
32str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
34F28D1.8F28D1.8n/achrIV 12,388,613contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype)
35C54D10.8C54D10.8n/achrV 12,445,902contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ44007 fis, clone TESTI4023762; ENSEMBL:ENSP00000364402
36T05H10.8T05H10.8n/achrII 8,060,196contains similarity to Streptococcus pneumoniae Cell division regulator, negative regulator of FtsZ ringsformation.; TR:Q8DQE5
37ZC196.6ZC196.6n/achrV 8,727,690contains similarity to Mycoplasma genitalium Protein P200.; SW:Q49429
38T10C6.2T10C6.2n/achrV 16,013,354contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39srw-57F36G9.1n/achrV 15,954,286C. elegans SRW-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40T23E1.1T23E1.1n/achrIV 3,153,678contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
41srb-8F37C12.15n/achrIII 7,172,652C. elegans SRB-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
42srw-113ZK1037.9n/achrV 15,333,837C. elegans SRW-113 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
43C14E2.6C14E2.6n/achrX 1,828,107contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
44F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
45C47C12.2C47C12.2n/achrX 7,754,107
46K02E11.6K02E11.6n/achrV 14,251,141contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
47F19B10.5F19B10.5n/achrII 3,656,709
48lgc-20B0491.4n/achrII 11,341,749C. elegans LGC-20 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
49F46F5.5F46F5.5n/achrII 812,930contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
50K06A1.1K06A1.1n/achrII 6,455,658K06A1.1 encodes an AP-2-like transcription factor.