UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T16G1.4T16G1.40chrV 12,940,921contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
2hmp-2K05C4.6n/achrI 14,741,100hmp-2 encodes a beta-catenin; HMP-2 activity is required during embryonic development for cell adhesion at adherens junctions, cell migration, and body morphogenesis; as a beta-catenin, HMP-2 likely functions solely as part of a cadherin-catenin complex, as in yeast two-hybrid assays, HMP-2 is the only C. elegans beta-catenin that binds HMP-1/alpha-catenin and HMR-1/cadherin; additionally, in the embryo, HMP-2 co-localizes to sites of epithelial cell contacts with HMP-1 and HMR-1/cadherin; however, despite its normal role in embryonic cell adhesion, HMP-2 can activate transcription and when overexpressed in vivo, can partially rescue vulval defects produced by loss of BAR-1/beta-catenin, suggesting that HMP-2 has retained the ability to interact with the Wnt signaling pathway.
3F39H12.3F39H12.3n/achrX 839,898contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) (3), PF02197 (Regulatory subunit of type II PKA R-subunit) contains similarity to Interpro domains IPR003117 (cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit, type I/II alpha/beta), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
4F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
5nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6F49C12.14F49C12.14n/achrIV 9,323,277contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
7skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
8K02E11.7K02E11.7n/achrV 14,253,882contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
9C50E3.6C50E3.6n/achrV 7,589,517
10T03G11.4T03G11.4n/achrX 5,167,050contains similarity to Pfam domain PF01532 Glycosyl hydrolase family 47 contains similarity to Interpro domain IPR001382 (Glycoside hydrolase, family 47)
11T05C1.3T05C1.3n/achrII 4,488,577
12ZC412.4ZC412.4n/achrV 14,869,132contains similarity to Brugia malayi Major allergen.; TR:Q9BJC9
13clec-35Y102A5B.2n/achrV 16,853,143C. elegans CLEC-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
14C32H11.11C32H11.11n/achrIV 12,938,618contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
15nhl-2F26F4.7n/achrIII 4,896,829C. elegans NHL-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) (2), PF01436 (NHL repeat) (4)contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR000315 (Zinc finger, B-box), IPR001258 (NHL repeat)
16B0281.3B0281.3n/achrII 2,307,697contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR003058 (Cloacin), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
17F21G4.3F21G4.3n/achrX 9,896,105contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
18mtl-2T08G5.10n/achrV 14,018,435mtl-2 encodes one of two C. elegans metallothioneins, small, cysteine-rich, metal-binding proteins; MTL-2 functions in metal detoxification and homeostasis and stress adaptation; in addition, mtl-2 plays a role in regulating growth and fertility; mtl-2 expression is induced in larval and adult intestinal cells following exposure to cadmium or heat shock; MTL-2 intestinal expression is dependent upon ELT-2, an intestine-specific GATA-type transcription factor; mtl-2 is downregulated by DAF-16 in daf-2 mutants.
19K07A12.1K07A12.1n/achrI 8,668,182contains similarity to Pfam domain PF04910 Protein of unknown function, DUF654 contains similarity to Interpro domains IPR006994 (Basic helix-loop-helix, Nulp1-type), IPR000294 (Vitamin K-dependent carboxylation/gamma-carboxyglutamic region)
20bch-1F25H2.13n/achrI 10,574,565C. elegans BCH-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF06733 DEAD_2 contains similarity to Interpro domains IPR014013 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding, DinG/Rad3-type), IPR010614 (DEAD2), IPR002464 (DNA/RNA helicase, ATP-dependent, DEAH-box type, conserved site), IPR006554 (Helicase-like, DEXD box c2 type), IPR006555 (Helicase, ATP-dependent, c2 type), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR013020 (DNA helicase (DNA repair), Rad3 type)
21R186.6R186.6n/achrV 12,958,187contains similarity to Pfam domain PF00581 Rhodanese-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001763 (Rhodanese-like)
22M02F4.2M02F4.2n/achrX 3,033,806
23zig-7F54D7.4n/achrI 4,791,457zig-7 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; loss of zig-7 activity via RNAi has been reported to result in aldicarb resistance; a zig-7::gfp reporter fusion is expressed in body wall muscle.
24F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
25C08B11.8C08B11.8n/achrII 8,040,793contains similarity to Pfam domain PF03155 ALG6, ALG8 glycosyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR004856 (ALG6, ALG8 glycosyltransferase)
26T01D1.5T01D1.5n/achrII 188,286
27F20D6.5F20D6.56e-26chrV 8,163,572contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
28K02E11.5K02E11.5n/achrV 14,252,784contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
29C02F5.3C02F5.3n/achrIII 8,246,494contains similarity to Pfam domains PF01926 (GTPase of unknown function) , PF02824 (TGS domain) contains similarity to Interpro domains IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG), IPR004095 (TGS), IPR006074 (GTP1/OBG, conserved site)
30scl-27ZK6.3n/achrV 400,930C. elegans SCL-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
31B0222.3B0222.3n/achrV 9,140,149contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domains IPR001204 (Phosphate transporter), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
32C09G5.2C09G5.2n/achrII 10,708,359C09G5.2 encodes an ortholog of S. cerevisiae DPH2/YKL191W and human DPH2L2 (OMIM:603456); C09G5.2 is a putative protein component of diphtamide synthesis; C09G5.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
33acl-10F55A11.5n/achrV 11,775,146C. elegans ACL-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01553 Acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
34srx-38C03A7.5n/achrV 5,154,771C. elegans SRX-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013305 (ABC transporter, ABCB2), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35C26B2.7C26B2.7n/achrIV 8,016,527
36prpf-4F22D6.5n/achrI 7,092,922C. elegans PRPF-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
37Y39A1A.20Y39A1A.20n/achrIII 10,699,807
38ZC84.1ZC84.1n/achrIII 9,203,077contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR011052 (Proteinase and amylase inhibitor), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR001762 (Blood coagulation inhibitor, Disintegrin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
39F52C12.1F52C12.1n/achrIV 1,961,538contains similarity to Pfam domain PF06087 Tyrosyl-DNA phosphodiesterase contains similarity to Interpro domains IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase), IPR010347 (Tyrosyl-DNA phosphodiesterase)
40let-70M7.1n/achrIV 11,081,640let-70 encodes a class I E2 ubiquitin conjugating enzyme; let-70 was identified in screens for essential genes and phenotypic analyses indicate that loss of let-70 activity results in embryonic and larval lethality with defects in sarcomere assembly; purified LET-70 can stimulate the self-ubiquitylation activities of CHN-1 and UFD-2, E4 ubiquitin conjugation factors and, in addition, can stimulate the CHN-1- and UFD-2-dependent multiubiquitylation of UNC-45, a myosin-directed chaperone; in this manner, LET-70 may regulate UNC-45 degradation and myosin assembly; RNA blot analyses and a let-70-lacZ reporter fusion reveal that let-70 is abundantly expressed at all stages of development, including the dauer larval stage; strong staining is observed in most somatic tissues until adult stages, when expression generally becomes restricted to the nervous system.
41clec-170F38A1.1n/achrIV 1,270,618C. elegans CLEC-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
42C47A4.1C47A4.1n/achrIV 13,716,255contains similarity to Interpro domain IPR015609 (Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ)
43F19C6.5F19C6.5n/achrX 9,983,681contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Zinc transporter 8; HI:HIT000389038
44F13G3.6F13G3.6n/achrI 7,304,082contains similarity to Pfam domain PF00535 Glycosyl transferase family 2 contains similarity to Interpro domains IPR001173 (Glycosyl transferase, family 2), IPR016040 (NAD(P)-binding)
45dnj-17T03F6.2n/achrIII 13,392,282This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
46C25F9.9C25F9.9n/achrV 19,417,227contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IE25
47emb-30F54C8.3n/achrIII 9,438,172emb-30 encodes an anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) component orthologous to mammalian APC-4 and Schizosaccharomyces pombe Lid1; EMB-30 is required for the metaphase-to-anaphase transition during meiosis and mitosis, for establishing anterior-posterior polarity in the early embryo, and for proper localization of germline granules and the maternally provided PAR-2 and PAR-3 proteins.
48secs-1D1054.13n/achrV 10,803,314C. elegans SECS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05889 Soluble liver antigen/liver pancreas antigen (SLA/LP autoantigen) contains similarity to Interpro domains IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR008829 (Soluble liver antigen/liver pancreas antigen)
49C50H11.1C50H11.1n/achrV 3,090,166contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
50elpc-4C26B2.6n/achrIV 8,017,585C. elegans ELPC-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05625 PAXNEB protein contains similarity to Interpro domain IPR008728 (PAXNEB)