UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T15D6.12T15D6.120chrI 12,400,253contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
2T08D2.6T08D2.6n/achrX 180,977contains similarity to Homo sapiens Protein YIPF4; ENSEMBL:ENSP00000238831
3srj-16T06A1.2n/achrV 1,955,236C. elegans SRJ-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4fbxa-195R09B5.1n/achrV 1,435,696This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
5ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
6B0207.10B0207.10n/achrI 5,959,278
7T23F4.3T23F4.3n/achrII 1,170,980contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
8W04D12.1W04D12.1n/achrIII 5,837,006
9F59C12.3F59C12.3n/achrX 16,606,372contains similarity to Interpro domain IPR009114 (Angiomotin)
10srsx-2F20E11.2n/achrV 17,437,669C. elegans SRSX-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
11nhr-188F47C10.7n/achrV 3,857,080C. elegans NHR-188 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
12H43I07.1H43I07.1n/achrV 4,206,564contains similarity to Interpro domains IPR010754 (Optic atrophy 3-like), IPR005819 (Histone H5)
13K04F10.2K04F10.2n/achrI 6,362,454contains similarity to Interpro domain IPR008979 (Galactose-binding like)
14D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
15math-6C16C4.11n/achrII 1,884,167C. elegans MATH-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
16T13F3.4T13F3.4n/achrV 16,265,325contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
17F48A9.2F48A9.2n/achrI 6,593,082
18srbc-24C45H4.10n/achrV 2,152,386C. elegans SRBC-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19C23G10.10C23G10.10n/achrIII 6,213,461
20sri-15F15H9.2n/achrI 12,152,667C. elegans SRI-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21lips-8F31F6.7n/achrX 14,899,559C. elegans LIPS-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
22R11D1.4R11D1.4n/achrV 12,713,623contains similarity to Xenopus laevis Similar to kinesin-like 1.; TR:Q8AVK8
23H12D21.3H12D21.3n/achrV 14,886,000contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
24K09C4.9K09C4.9n/achrX 3,271,553
25T28A11.3T28A11.3n/achrV 3,275,745contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
26F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
27nhr-174E03H4.6n/achrI 12,418,082C. elegans NHR-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
28F57B9.1F57B9.1n/achrIII 6,962,648contains similarity to Pfam domain PF01243 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase contains similarity to Interpro domains IPR012349 (FMN-binding split barrel), IPR011576 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding core), IPR009002 (FMN-binding split barrel, related), IPR000659 (Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase)
29T05A7.1T05A7.1n/achrII 4,678,765
30C12D5.4C12D5.4n/achrV 7,672,548
31C44C10.6C44C10.6n/achrX 11,698,664contains similarity to Streptococcus pneumoniae GtrA family protein.; TR:Q97R28
32F07G11.4F07G11.40.00002chrV 7,293,758contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
33his-8F45F2.12n/achrV 8,532,878his-8 encodes an H2B histone; his-8 is contained within the histone gene cluster HIS2.
34C50E3.9C50E3.9n/achrV 7,599,821contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
35srg-55W09D12.2n/achrV 14,927,504C. elegans SRG-55 protein ;
36str-9F57A10.1n/achrV 15,759,569C. elegans STR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37F23B2.10F23B2.10n/achrIV 9,153,550contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
38rlbp-1T23G11.5n/achrI 7,688,763C. elegans RLBP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00620 RhoGAP domain contains similarity to Interpro domains IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR000198 (RhoGAP)
39F58E2.3F58E2.3n/achrIV 3,468,626This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
40rab-8D1037.4n/achrI 3,683,497rab-8 encodes a rab related protein of the Ras GTPase superfamily that affects ovarian morphology and function, thereby affecting fertility; acts downstream of let-60 with respect to vulval development based on genetic analysis.
41C41G6.12C41G6.12n/achrV 15,207,410contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
42Y38H6C.21Y38H6C.21n/achrV 20,550,079contains similarity to Aquifex aeolicus Flagellar biosynthetic protein flhB.; SW:FLHB_AQUAE
43C01G6.4C01G6.4n/achrII 9,272,092contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
44srh-154F20E11.12n/achrV 17,441,133C. elegans SRH-154 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
45F27E5.1F27E5.1n/achrII 10,140,416contains similarity to Pfam domain PF02275 Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family contains similarity to Interpro domains IPR003199 (Choloylglycine hydrolase), IPR016699 (Acid ceramidase-like)
46T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
47W03D2.7W03D2.7n/achrIV 4,062,904
48str-183T13F3.1n/achrV 16,276,778C. elegans STR-183 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49T04C12.1T04C12.1n/achrV 11,058,930n/a
50T23B3.1T23B3.1n/achrI 6,718,630