UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T14C1.1T14C1.10chrX 14,408,600T14C1.1 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that T14C1.1 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3W05E10.2W05E10.2n/achrV 11,688,773contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000288462
4C05E7.3C05E7.3n/achrX 12,946,010contains similarity to Triticum aestivum Cold acclimation protein WCOR410b.; TR:P93607
5C38C3.6C38C3.6n/achrV 1,485,347contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
6T02E1.8T02E1.8n/achrI 8,236,518
7srj-15Y40B10B.2n/achrV 1,963,860C. elegans SRJ-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002120 (Thyrotrophin-releasing hormone receptor)
8F23F1.3F23F1.3n/achrII 32,686
9F56C3.9F56C3.9n/achrX 1,392,907contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related)
10Y39A3B.3Y39A3B.3n/achrIII 1,986,275
11F54B11.9F54B11.9n/achrX 13,607,737contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I5W3
12F18A11.5F18A11.5n/achrII 13,010,794contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
13irk-3K04G11.5n/achrX 14,356,108C. elegans IRK-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01007 Inward rectifier potassium channel contains similarity to Interpro domains IPR013521 (Potassium channel, inwardly rectifying, Kir, conserved region 2), IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR013518 (Potassium channel, inwardly rectifying, Kir, cytoplasmic), IPR001838 (Potassium channel, inwardly rectifying, Kir-like)
14F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
15ZC84.3ZC84.3n/achrIII 9,188,742contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
16F21D12.5F21D12.5n/achrII 7,329,535contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
17B0244.4B0244.4n/achrIII 5,749,496contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
18F21C10.9F21C10.9n/achrV 9,097,952contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
19K03B4.4K03B4.4n/achrV 4,684,430contains similarity to Interpro domain IPR002411 (Cereal allergen/alpha-amylase inhibitor, rice-type)
20cyn-9T27D1.1n/achrIII 3,698,740cyn-9 encodes a peptidyl prolyl cis-trans isomerase most similar to human cyclophilin G (OMIM:606093); CYN-9 likely functions as a catalyst in the folding and modification of cuticle collagens; a cyn-9::lacZ reporter is expressed in the syncytial hypodermis from early larval through adult stages; cyn-9 mRNA is expressed most strongly at the mid-L3 and mid-L4 larval stages, the intermoult period when collagens are synthesized.
21B0563.7B0563.7n/achrX 9,153,274contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
22K10C8.2K10C8.20.000000000003chrV 12,691,417K10C8.2 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that K10C8.2 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
23srh-129F14F9.7n/achrV 5,143,034C. elegans SRH-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001036 (Acriflavin resistance protein), IPR010916 (TonB box, conserved site)
24srt-11W01D2.4n/achrII 14,806,938C. elegans SRT-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25cwp-4K11D12.1n/achrV 5,055,031cwp-4 encodes a protein with some similarity to mucins that is predicted to be secreted, and is alleged to be coexpressed with polycystins; CWP-4 is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi screens.
26C55C3.2C55C3.2n/achrIV 5,707,741
27atg-11T08A9.1n/achrX 7,337,446T08A9.1 is orthologous to the human gene LIKELY ORTHOLOG OF MOUSE COILED COIL FORMING PROTEIN 1 (RB1CC1; OMIM:606837), which when mutated leads to disease.
28elt-3K02B9.4n/achrX 13,939,895The elt-3 gene encodes a GATA transcription factor expressed in the embryonic hypodermis; specifically, it is expressed in expressed in all of the major hypodermal cells except the lateral seam cells.
29F11A5.8F11A5.8n/achrV 16,208,396contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
30K01A6.6K01A6.6n/achrIV 11,738,764contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
31ZC15.1ZC15.1n/achrV 20,302,899contains similarity to Interpro domains IPR001878 (Zn-finger, CCHC type), IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
32ZC15.3ZC15.3n/achrV 20,299,636contains similarity to Homo sapiens Myosin heavy chain, smooth muscle isoform; ENSEMBL:ENSP00000300036
33cyp-34A3C41G6.1n/achrV 15,229,059C. elegans CYP-34A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
34F45E1.2F45E1.2n/achrX 8,003,850
35nhr-132R11G11.1n/achrV 535,310C. elegans NHR-132 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
36clec-202C30H6.4n/achrIV 17,362,968C. elegans CLEC-202 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37C44F1.1C44F1.1n/achrIII 3,761,814contains similarity to Interpro domain IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding)
38R09B5.11R09B5.11n/achrV 1,440,531contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
39Y81G3A.3Y81G3A.3n/achrII 13,087,735contains similarity to Pfam domains PF05773 (RWD domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR006575 (RWD), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40frm-3H05G16.1n/achrX 11,578,915frm-3 encodes a protein containing a FERM domain (Band 4.1 family); expressed in a few cells in the head.
41Y54E2A.1Y54E2A.1n/achrII 14,736,737contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42C11G10.2C11G10.2n/achrX 15,142,124contains similarity to Homo sapiens Thyroid hormone receptor-associated protein complex 240 kDa component; ENSEMBL:ENSP00000262436
43eat-4ZK512.6n/achrIII 9,139,280eat-4 encodes an ortholog of the mammalian BNPI vesicular glutamate transporter that affects chemotaxis, feeding, foraging and thermotaxis; eat-4 is expressed in specific neurons, including M3L and M3R which are known to be glutamatergic.
44F35C12.1F35C12.1n/achrI 9,805,249contains similarity to Ralstonia solanacearum PopB.; TR:Q84IE7
45T16A1.4T16A1.4n/achrII 2,081,787
46gly-18F22D6.11n/achrI 7,111,262GLY-18 is similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase.
47Y41C4A.6Y41C4A.6n/achrIII 11,697,361contains similarity to Methanococcus jannaschii Hypothetical protein MJ0951.; SW:Y951_METJA
48clec-89C09D1.2n/achrI 4,072,314C. elegans CLEC-89 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
49tag-224B0496.8n/achrIV 7,450,248tag-224 encodes an ortholog of Drosophila CG6522-PA and of human LMCD1 and TESTIN; TAG-224 is dispensable for Wnt-directed planar cell polarity and the fully asymmetrical division of B.a versus B.p cells.
50R05C11.1R05C11.1n/achrIV 2,070,210contains similarity to Interpro domain IPR014756 (Immunoglobulin E-set)