UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T14B4.5T14B4.58.000000000000001e-93chrII 6,717,303
2F30H5.3F30H5.3n/achrIII 508,704contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR008197 (Whey acidic protein, 4-disulphide core), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
3clec-170F38A1.1n/achrIV 1,270,618C. elegans CLEC-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
4ZK1225.1ZK1225.1n/achrI 13,206,699contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
5F41E6.12F41E6.12n/achrV 8,627,981
6R05A10.6R05A10.6n/achrIV 14,167,109contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
7H13N06.2H13N06.2n/achrX 15,489,935contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
8R07B1.3R07B1.3n/achrX 9,859,984contains similarity to Pfam domain PF01130 CD36 family contains similarity to Interpro domain IPR002159 (CD36 antigen)
9F12F6.1F12F6.1n/achrIV 11,586,743contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Putative glycosidase of the cell wall, may have a role in cell wall architecture; SGD:YGR189C
10F13A2.6F13A2.6n/achrV 4,403,625contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
11F39H12.3F39H12.3n/achrX 839,898contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) (3), PF02197 (Regulatory subunit of type II PKA R-subunit) contains similarity to Interpro domains IPR003117 (cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit, type I/II alpha/beta), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
12C14F11.6C14F11.6n/achrX 6,238,566contains similarity to Pfam domain PF00908 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase contains similarity to Interpro domains IPR000888 (dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related), IPR011051 (Cupin, RmlC-type), IPR014710 (RmlC-like jelly roll fold)
13F41C3.7F41C3.7n/achrII 4,730,652
14unc-50T07A5.2n/achrIII 10,316,260unc-50 encodes an integral membrane protein orthologous to the Saccharomyces cerevisiae Golgi component Gmh1p; UNC-50 is required for regulating subtype-specific nicotinic receptor trafficking to the cell surface and thus, for normal synaptic transmission at the neuromuscular junction; UNC-50 is ubiquitously expressed from early embryogenesis to adulthood and localizes to the Golgi.
15col-73F11G11.12n/achrII 4,872,607C. elegans COL-73 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR000596 (Cholecystokinin receptor, type A), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
16F26G1.6F26G1.6n/achrII 4,778,310F26G1.6 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; while F26G1.6 has no clear orthologs in other organisms, it falls into a group of proteins that includes the classical neprilysins found in mammals (e.g., PEX [OMIM:307800] and the enkephalin cleaving enzymes).
17T19D7.3T19D7.3n/achrX 657,345contains similarity to Pfam domains PF02822 (Antistasin family) (3), PF00093 (von Willebrand factor type C domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR011061 (Proteinase inhibitor I14/I15, hirudin/antistatin), IPR008037 (Proteinase inhibitor I19, pacifastin), IPR006552 (VWC out), IPR004094 (Proteinase inhibitor I15, antistasin), IPR001007 (von Willebrand factor, type C)
18F53B3.2F53B3.2n/achrX 2,860,247contains similarity to Pfam domain PF01596 O-methyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002935 (O-methyltransferase, family 3)
19F09G8.3F09G8.3n/achrIII 8,266,869contains similarity to Pfam domain PF00380 Ribosomal protein S9/S16 contains similarity to Interpro domains IPR000754 (Ribosomal protein S9), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold)
20ZC449.1ZC449.1n/achrX 5,026,248contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site)
21F54A5.1F54A5.1n/achrI 990,926contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR010982 (Lambda repressor-like, DNA-binding), IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
22F21G4.3F21G4.3n/achrX 9,896,105contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
23C47A4.1C47A4.1n/achrIV 13,716,255contains similarity to Interpro domain IPR015609 (Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ)
24acl-10F55A11.5n/achrV 11,775,146C. elegans ACL-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01553 Acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
25atf-2K08F8.2n/achrII 8,752,891C. elegans ATF-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07716 (Basic region leucine zipper) (2), PF00170 (bZIP transcription factor) contains similarity to Interpro domains IPR011700 (Basic leucine zipper), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor), IPR011616 (bZIP transcription factor, bZIP-1)
26rpn-12ZK20.5n/achrII 11,653,526rpn-12 is predicted to encode a non-ATPase subunit of the 19S regulatory complex of the proteasome that interacts with NHR-6 in yeast two-hybrid assays.
27sru-31C50C10.4n/achrV 9,817,248C. elegans SRU-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
28F47B10.5F47B10.5n/achrX 10,889,736contains similarity to Xenopus laevis D(2) dopamine receptor 1.; SW:D2D1_XENLA
29C32H11.11C32H11.11n/achrIV 12,938,618contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
30R07B1.7R07B1.7n/achrX 9,869,453contains similarity to Candida albicans Chitinase 2 precursor (EC 3.2.1.14).; SW:CHI2_CANAL
31C13C12.2C13C12.2n/achrV 12,524,627contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
32T20D4.8T20D4.8n/achrV 3,406,799T20D4.8 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T20D4.8 has no clear orthologs in other organisms.
33C16C8.2C16C8.2n/achrII 3,433,889contains similarity to Pfam domains PF01549 (ShK domain-like) (2), PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
34K10D3.4K10D3.4n/achrI 7,137,354contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) , PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
35T05C1.3T05C1.3n/achrII 4,488,577
36F57F5.3F57F5.3n/achrV 12,005,558contains similarity to Streptococcus pyogenes Putative histidine kinase.; TR:Q8P2Q1
37Y57G11C.31Y57G11C.31n/achrIV 14,685,186contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
38skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
39ZC84.1ZC84.1n/achrIII 9,203,077contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR011052 (Proteinase and amylase inhibitor), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR001762 (Blood coagulation inhibitor, Disintegrin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
40ZC328.1ZC328.1n/achrI 6,405,136
41F54B11.11F54B11.11n/achrX 13,580,176contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
42C46H11.1C46H11.1n/achrI 5,055,865
43F09C12.6F09C12.6n/achrII 5,117,137contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44T23F6.2T23F6.2n/achrIV 12,722,330
45math-21C40D2.3n/achrII 1,994,852C. elegans MATH-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
46C45E5.1C45E5.1n/achrIV 5,745,740contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
47tag-123F08F1.7n/achrX 8,420,290C. elegans TAG-123 protein; contains similarity to Pfam domain PF02990 Endomembrane protein 70 contains similarity to Interpro domains IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR004240 (Nonaspanin (TM9SF))
48ZK1290.5ZK1290.5n/achrII 7,530,168contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
49hlh-15C43H6.8n/achrX 2,413,123C. elegans HLH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
50C45G9.7C45G9.7n/achrIII 5,046,619contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domains IPR017268 (Tax1-binding protein 3), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)