UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1msp-79T13F2.103e-73chrIV 9,766,938msp-79 encodes a member of the major sperm protein family.
2ssp-9E03H12.10n/achrIV 4,994,521C. elegans SSP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
3msp-81K07F5.19e-73chrIV 9,836,198msp-81 encodes a member of the major sperm protein family.
4bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
5C10G11.1C10G11.1n/achrI 6,307,930
6nspd-1ZK484.8n/achrI 6,097,668C. elegans NSPD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
7msp-74F09C12.75.999999999999999e-42chrII 5,115,201msp-74 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
8C49H3.3C49H3.3n/achrIV 7,924,622contains similarity to Xenopus tropicalis UPF0446 protein C12orf31 homolog.; SW:Q6NVR5
9mab-9T27A1.6n/achrII 518,813mab-9 encodes a member of the T-box family of transcriptional regulators containing a 200-amino acid T-box DNA-binding domain most similar to mouse Brachyury; mab-9 is involved in hindgut and male tail development, specifically affecting the fate of two posterior blast cells in the hindgut, B and F; in the male this results in a grossly abnormal tail lacking spicules, and renders them incapable of mating; in the hermaphrodite this results in hindgut defects; mab-9 may also be part of a network of T-box genes that includes tbx-8, tbx-9 and vab-7 and is important for the correct patterning of posterior cells in the developing embryo; mab-9 affects movement to some extent though the basis for this defect is unknown; MAB-9 localizes to the nucleus of B and F and their descendents during development.
10nspd-4T23B7.1n/achrII 4,842,734C. elegans NSPD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domain IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
11col-184F15A2.1n/achrX 13,469,888C. elegans COL-184 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005404 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3.3), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
12msp-64ZK1248.69e-73chrII 5,810,101msp-64 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
13msp-49C34F11.64e-72chrII 5,194,543msp-49 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
14msp-142K05F1.29e-73chrII 5,798,084msp-142 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
15C10G11.9C10G11.9n/achrI 6,274,923contains similarity to Urechis caupo Sperm acrosomal protein.; TR:A4GND9
16gst-9R05F9.5n/achrII 4,892,523gst-9 encodes a predicted glutathione S-transferase; by homology, GST-9 is predicted to play a role in the detoxification of environmental toxins and xenobiotics by transferring glutathione to reactive electrophilic compounds; however, as loss of gst-9 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of GST-9 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
17ssp-16T27A3.3n/achrI 6,102,250C. elegans SSP-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
18C35D10.11C35D10.11n/achrIII 4,868,514contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
19nspa-8W06A7.5n/achrV 14,826,947C. elegans NSPA-8 protein ;
20ZK1251.1ZK1251.1n/achrIV 9,683,245contains similarity to Pfam domains PF00808 (Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone) , PF00125 (Core histone H2A/H2B/H3/H4) contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core), IPR002119 (Histone H2A), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
21R10E9.2R10E9.2n/achrIII 3,963,390contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein (At2g34570).; TR:Q8GWS9
22F37A8.1F37A8.1n/achrIII 3,928,769contains similarity to Rattus norvegicus Myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase MRCK-beta.; TR:O54875
23ZK938.1ZK938.1n/achrII 9,830,005contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
24sss-1F32B6.5n/achrIV 9,893,216C. elegans SSS-1 protein ;
25C35D10.2C35D10.2n/achrIII 4,871,376contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
26C48E7.7C48E7.7n/achrI 6,235,033contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:Q6S6W0
27C04F12.7C04F12.7n/achrI 9,696,226contains similarity to Legionella pneumophila CITA.; TR:O54543
28ssp-10K07F5.9n/achrIV 9,850,839C. elegans SSP-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
29ssq-1K07F5.11n/achrIV 9,853,029C. elegans SSQ-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
30ssp-19C55C2.2n/achrI 2,562,838C. elegans SSP-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
31ZK484.5ZK484.5n/achrI 6,087,568
32ssq-4T28H11.1n/achrIV 5,017,101C. elegans SSQ-4 protein; contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR013286 (Annexin, type VII)
33F08H9.2F08H9.2n/achrV 14,460,857contains similarity to Interpro domain IPR004064 (EDG-6 sphingosine 1-phosphate receptor)
34W03D8.10W03D8.10n/achrI 2,786,824contains similarity to Pfam domain PF05884 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF856) contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR008574 (Protein of unknown function DUF856, Caenorhabditis species)
35F27C1.1F27C1.1n/achrI 5,435,299
36nspa-1H12D21.1n/achrV 14,886,813C. elegans NSPA-1 protein ;
37clec-79F47C12.4n/achrIV 3,974,525C. elegans CLEC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000538 (Link), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38srb-13F58A6.11n/achrII 5,156,512C. elegans SRB-13 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
39C04G2.9C04G2.9n/achrIV 10,113,525contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
40msp-32R05F9.31e-67chrII 4,898,889msp-32 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; msp-32 has a C. briggsae homolog as predicted by the Wobble Aware Bulk Aligner (WABA); the msp family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
41R09E10.6R09E10.6n/achrIV 10,293,542contains similarity to Coturnix coturnix Nectinepsin.; TR:Q90351
42F17E9.5F17E9.5n/achrIV 8,346,163
43msp-63K05F1.78e-72chrII 5,797,240msp-63 encodes a protein that belongs to a family of proteins called the Major Sperm Proteins (MSPs) that is conserved in nematodes; this family consists of closely related, small, basic proteins that make up 15% of sperm protein; this multigene family consists of over fifty genes, including many pseudogenes; MSPs are involved in both extracellular signaling and cytoskeletal functions during reproduction-MSP antagonizes Eph/ephrin signaling, in part, by binding VAB-1 Eph receptor tyrosine kinase on oocytes and sheath cells to promote oocyte maturation and MAPK activation; MSPs assemble into fibrous networks that drive movement of the C. elegans sperm; msp genes are expressed only in late primary spermatocytes.
44C02F5.5C02F5.5n/achrIII 8,236,454
45col-143T15B7.3n/achrV 6,836,152C. elegans COL-143 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
46R13D11.4R13D11.4n/achrV 810,558contains similarity to Interpro domain IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel)
47F32D1.2F32D1.2n/achrV 4,346,245contains similarity to Pfam domain PF04627 Mitochondrial ATP synthase epsilon chain contains similarity to Interpro domain IPR006721 (ATPase, F1 complex, epsilon subunit, mitochondrial)
48T25B9.6T25B9.6n/achrIV 10,759,435contains similarity to Interpro domain IPR006162 (Phosphopantetheine attachment site)
49F35H8.1F35H8.1n/achrII 9,552,878contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ILJ6
50ZC168.6ZC168.6n/achrIV 10,738,430contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)