UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srg-9T12A2.103e-179chrIII 6,256,061C. elegans SRG-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
2T14G8.2T14G8.2n/achrX 12,858,701This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
3srh-55T09F5.5n/achrV 15,154,261C. elegans SRH-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4srd-21W06G6.3n/achrV 16,630,499C. elegans SRD-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5ZK177.9ZK177.9n/achrII 5,517,477
6B0348.1B0348.1n/achrV 49,270contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
7sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F21G4.4F21G4.4n/achrX 9,898,328contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
9wrn-1F18C5.2n/achrII 6,557,068wrn-1 encodes an ortholog of human WRN, which when mutated leads to Werner syndrome (OMIM:277700), and one of four C. elegans homologs of the RecQ DNA helicase family that includes E. coli RecQ; by homology, WRN-1 is predicted to function as a helicase, DNA-dependent ATPase, and exonuclease that plays a key role in DNA replication, recombination, and repair; RNA interference studies in C. elegans and the enhancement of many of the resulting phenotypes by ionizing radiation indicate that wrn-1 affects life span and aging and acts at a DNA damage checkpoint; the wrn-1 phenotypes such as premature aging are similar to those of Werner syndrome; immunolocalization studies indicate that WRN-1 expression is nuclear in cells at the embryonic, larval and adult stages.
10F58D12.1F58D12.1n/achrV 14,052,371contains similarity to White spot syndrome virus Wsv359 (WSSV418).; TR:Q8VAP2
11D1053.2D1053.2n/achrX 11,728,445contains similarity to Pfam domain PF08123 Histone methylation protein DOT1 contains similarity to Interpro domain IPR013110 (Histone methylation DOT1)
12srw-111M01G12.4n/achrI 12,124,188C. elegans SRW-111 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13sre-56C50E10.8n/achrII 12,326,444C. elegans SRE-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR002090 (Na+/H+ exchanger, isoform 6 (NHE6)), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
14C01F6.1C01F6.1n/achrIV 9,098,665C01F6.1 encodes a putative calcium-dependent phospholipid binding protein of the copine family; C01F6.1 is required for sperm to normally migrate towards a PUFA-based signal exuded by oocytes; C01F6.1(RNAi) hermaphrodites are infertile, both through aberrant loss of their own sperm and through failure of males to effectively inseminate them.
15C28A5.5C28A5.5n/achrIII 4,451,510contains similarity to Petunia hybrida PGPS/D8.; TR:Q9ZTN1
16srx-135F09F3.11n/achrV 13,860,290C. elegans SRX-135 protein ;
17M163.6M163.6n/achrX 14,463,353contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7SZA3
18lgc-7Y57G11C.2n/achrIV 14,712,127C. elegans LGC-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
19srx-22F31F4.3n/achrV 680,688C. elegans SRX-22 protein ;
20srg-7C18F10.88e-33chrIII 6,267,278C. elegans SRG-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
21ZK1240.4ZK1240.4n/achrII 2,315,354
22Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
23srh-99C46E10.7n/achrII 3,715,771C. elegans SRH-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24nas-21T11F9.5n/achrV 11,473,207nas-21 encodes an astacin-like metalloprotease.
25Y45F10D.10Y45F10D.10n/achrIV 13,786,277contains similarity to Pseudotylosurus angusticeps Recombination-activating protein 2 (Fragment).; TR:Q9DD51
26W01C8.1W01C8.1n/achrX 5,693,921
27Y102A5D.1Y102A5D.1n/achrV 17,143,014
28Y54C5A.1Y54C5A.1n/achrII 4,140,997
29F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
30ceh-14F46C8.5n/achrX 7,530,621ceh-14 encodes a LIM homeodomain protein orthologous to Drosophila Lim3 and the vertebrate Lhx3 and Lhx4 proteins; ceh-14 is required for specification of the AFD thermosensory neurons and for normal thermotactic behavior; a ceh-14::GFP reporter fusion is expressed in head and tail neurons, including the AFD thermosensory neurons, during late embryonic, larval, and adult stages. Animals triply mutant for the LIM homeobox genes ceh-14, lin-11, and ttx-3 which are required for function of the AFD, AIZ, and AIY neurons, respectively, exhibit a basic cryophilic thermotaxis response suggesting that, in C. elegans, there is more than one pathway for integration of thermosensory input.
31acr-9C40C9.2n/achrX 13,644,544acr-9 encodes a predicted member of the alpha subunit family of nicotinic acetylcholine receptors.
32srh-283C47A10.2n/achrV 17,766,031C. elegans SRH-283 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33Y65A5A.1Y65A5A.1n/achrIV 16,399,303contains similarity to Interpro domain IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerization domain bHLH)
34R04B5.7R04B5.7n/achrV 10,089,830contains similarity to Rattus norvegicus Protein tyrosine phosphatase TD14.; TR:O88902
35T25G12.2T25G12.2n/achrX 17,245,951The T25G12.2 gene encodes a homolog of the human gene HSD, which when mutated leads to cortisol 11-beta ketoreductase deficiency (OMIM:218030); T25G12.2 protein is predicted to be mitochondrial with 68% accuracy.
36ugt-6ZC455.4n/achrV 12,796,799C. elegans UGT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
37EGAP2.2EGAP2.2n/achrII 5,230,269
38srab-25ZK697.7n/achrV 1,740,043C. elegans SRAB-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
39sdz-20F53A2.2n/achrIII 13,335,391C. elegans SDZ-20 protein
40B0244.5B0244.5n/achrIII 5,745,987
41W09G12.8W09G12.8n/achrIV 1,226,925contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
42clec-179C42D4.11n/achrIV 7,183,961C. elegans CLEC-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43rap-2C25D7.7n/achrV 15,062,961rap-2 encodes a Ras-related GTPase that is most similar to the RAP2 members of the Ras GTPase superfamily; by homology, RAP-2 is predicted to function as a membrane-localized GTPase that likely plays a role in signal transduction; as animals homozygous for a rap-2 deletion mutation show no obvious abnormalities, the precise role of RAP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
44fbxb-108F08D12.6n/achrII 2,766,099This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
45ZK795.1ZK795.1n/achrIV 12,551,089contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
46T02H6.10T02H6.10n/achrII 680,250
47C46E10.8C46E10.8n/achrII 3,726,646contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
48C10G11.6C10G11.6n/achrI 6,291,932
49F21C10.6F21C10.6n/achrV 9,124,712contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
50F26F2.2F26F2.2n/achrV 20,559,052contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W