UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T10C6.2T10C6.20chrV 16,013,354contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2cpx-2K03A11.2n/achrX 13,067,761C. elegans CPX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF05835 Synaphin protein contains similarity to Interpro domain IPR008849 (Synaphin)
3W05B10.4W05B10.4n/achrV 12,668,893contains similarity to Pfam domain PF00788 Ras association (RalGDS/AF-6) domain contains similarity to Interpro domain IPR000159 (Ras-association)
4F35C5.11F35C5.11n/achrII 12,909,598contains similarity to Mus musculus Lymphocyte antigen Ly-6D precursor (Thymocyte B cell antigen) (ThB).; SW:LY6D_MOUSE
5srh-39C06A8.70.006chrII 7,764,656C. elegans SRH-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6ubc-1C35B1.1n/achrIV 4,104,634ubc-1 encodes an E2 ubiquitin-conjugating enzyme that contains a novel 40 amino acid C-terminal tail, and is homologous to Saccharomyces cerevisiae RAD6/UBC2 which is involved in DNA repair; although loss of UBC-1 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, UBC-1 is able to complement the DNA repair defects of a Saccharomyces cerevisiae rad6 null mutant, suggesting that UBC-1 can function in the DNA repair pathway; ubc-1 mRNA is detectable in embryos.
7F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
8C09G9.5C09G9.5n/achrIV 8,887,547contains similarity to Interpro domain IPR008992 ()
9C06B3.1C06B3.13e-22chrV 13,903,319contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10nhr-148C03G6.10n/achrV 7,342,974C. elegans NHR-148 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11fmo-2K08C7.5n/achrIV 10,683,426fmo-2 encodes a flavin-containing monoxygenase homologous to human FMO1, FMO2, and FMO3 (OMIM:602079, mutated in trimethylaminuria).
12C08F11.2C08F11.2n/achrIV 13,622,516contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Hypothetical protein MTH421.; SW:Y421_METTH
13K04F1.12K04F1.12n/achrV 1,656,168contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
14F45F2.1F45F2.1n/achrV 8,538,519contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
15K04F1.7K04F1.7n/achrV 1,669,148contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
16srg-32T21C9.7n/achrV 10,587,952C. elegans SRG-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
17cfi-1T23D8.8n/achrI 9,997,318cfi-1 encodes a DNA-binding protein containing an AT-rich interaction domain (ARID) that affects differentiation of the URA sensory neurons, AVD, and PVC interneurons; acts downstream of UNC-86 and LIN-32 in controlling URA and IL2 cell fate, and is expressed in some neurons and muscle cells.
18srd-33T19H12.4n/achrV 4,873,237C. elegans SRD-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19T21B6.4T21B6.4n/achrX 10,934,829contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
20lgc-6F17E9.8n/achrIV 8,341,064C. elegans LGC-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
21R02D5.6R02D5.6n/achrV 14,513,495contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
22ZC239.2ZC239.2n/achrII 3,218,443contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
23T17A3.10T17A3.10n/achrIII 155,573contains similarity to Interpro domain IPR007110 (Immunoglobulin-like)
24T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
25F25E5.9F25E5.9n/achrV 7,437,693
26C18A11.2C18A11.2n/achrX 8,067,797
27T05C3.2T05C3.2n/achrV 5,498,362The T05C3.2 gene encodes a protein that may be involved in apoptosis.
28C55A1.4C55A1.4n/achrV 15,642,939contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
29ins-3ZK75.3n/achrII 5,990,388ins-3 encodes one of several insulin-related peptides; INS-3 is classified as a Type-beta insulin based on the predicted arrangement of disulfide bonds; gfp gene fusions with the promoter and enhancer regions indicate that INS-3 is expressed in some amphid sensory neurons.
30C31H5.6C31H5.6n/achrI 9,045,096contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
31F52E1.3F52E1.3n/achrV 8,395,551
32Y62H9A.14Y62H9A.14n/achrX 11,922,107contains similarity to Interpro domain IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
33T04C12.1T04C12.1n/achrV 11,058,930n/a
34W04G5.7W04G5.7n/achrI 11,653,511contains similarity to Pfam domain PF05075 Protein of unknown function (DUF684) contains similarity to Interpro domain IPR007767 (Protein of unknown function DUF684)
35F08H9.4F08H9.4n/achrV 14,463,959F08H9.4 encodes a heat shock protein (HSP) of the HSP16 class; unlike most HSP16s in C. elegans, it is specifically expressed in a particular tissue (the excretory canal and ventral nerve-cord neurons), and its expression is only mildly induced by heat shock; however, F08H9.4 expression is increased by heat shock, is induced in a new tissue type (intestine) by heat shock, and probably aids heat shock resistance, since F08H9.4(RNAi) animals die as embryos in heat shock at a higher rate than normal; in general, HSP16 proteins are thought to act as passive ligands for unfolded proteins that keep them safe from aggregation until the proteins can be refolded by a large (ATP-consuming) HSP.
36F55H2.5F55H2.5n/achrIII 9,512,031contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
37R160.4R160.4n/achrX 4,367,984
38F41H8.2F41H8.2n/achrV 827,588contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
39C01B7.3C01B7.3n/achrV 8,783,769
40ugt-15C44H9.1n/achrV 12,828,911C. elegans UGT-15 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
41C55A1.6C55A1.6n/achrV 15,648,434contains similarity to Lactococcus lactis Protein maturation protein.; TR:Q9CEV9
42srg-41T19C4.3n/achrV 11,161,148C. elegans SRG-41 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
43F40G9.6F40G9.6n/achrIII 179,840
44srd-12C39H7.6n/achrIV 5,629,500C. elegans SRD-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001073 (Complement C1q protein)
45F55A4.3F55A4.3n/achrX 1,023,626
46K06A1.1K06A1.1n/achrII 6,455,658K06A1.1 encodes an AP-2-like transcription factor.
47Y70C5C.3Y70C5C.3n/achrV 16,714,293contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
48ZC196.6ZC196.6n/achrV 8,727,690contains similarity to Mycoplasma genitalium Protein P200.; SW:Q49429
49F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
50srh-203F20E11.10n/achrV 17,455,364C. elegans SRH-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)