UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sri-6T09E8.50chrV 13,186,537C. elegans SRI-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2C34D4.10C34D4.10n/achrIV 7,120,692
3F41G4.1F41G4.1n/achrX 16,841,928contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus 33 kDa inner dynein arm light chain, axonemal (p33).; SW:Q26630
4Y73C8C.10Y73C8C.10n/achrV 3,126,667contains similarity to Pfam domain PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001155 (NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal), IPR002343 (Paraneoplastic encephalomyelitis antigen)
5T22H2.4T22H2.4n/achrI 11,694,849contains similarity to Pfam domain PF03860 Domain of Unknown Function (DUF326) contains similarity to Interpro domain IPR005560 (Protein of unknown function DUF326)
6F52D2.7F52D2.7n/achrX 1,964,366
7K04E7.1K04E7.1n/achrX 6,462,585
8F39H12.2F39H12.2n/achrX 832,122contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
9sre-29F57G9.4n/achrII 12,400,560C. elegans SRE-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
10F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
11btb-3B0047.2n/achrII 2,043,575C. elegans BTB-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ), IPR000210 (BTB/POZ-like)
12nhr-33ZK455.6n/achrX 11,319,573C. elegans NHR-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13T09B4.2T09B4.2n/achrI 6,184,694
14W03H9.3W03H9.3n/achrII 14,143,131contains similarity to Streptomyces avermitilis Putative oxidoreductase.; TR:Q82DU1
15Y54G11A.1Y54G11A.1n/achrII 14,262,654contains similarity to Mesocricetus auratus Nucleolin (Protein C23).; SW:NUCL_MESAU
16W04G5.5W04G5.5n/achrI 11,635,717contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
17B0035.16B0035.16n/achrIV 11,295,988contains similarity to Pfam domain PF03054 tRNA methyl transferase contains similarity to Interpro domains IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004506 (tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase)
18R07E5.15R07E5.15n/achrIII 4,401,952
19F21A3.5F21A3.5n/achrV 15,540,560contains similarity to Pfam domain PF01966 HD domain contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR006674 (Metal-dependent phosphohydrolase, HD region, subdomain)
20C32A9.1C32A9.1n/achrX 10,259,366contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein, conserved.; TR:Q8IEA2
21K09A9.4K09A9.4n/achrX 15,593,283contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
22sru-2C33A12.13n/achrIV 9,486,898C. elegans SRU-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
23B0432.3B0432.3n/achrII 289,662contains similarity to Mus musculus 39S ribosomal protein L41, mitochondrial precursor (L41mt) (MRP-L41).; SW:Q9CQN7
24srd-50F15A2.4n/achrX 13,480,135C. elegans SRD-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25D1053.4D1053.4n/achrX 11,722,796contains similarity to Naja kaouthia Cytotoxin 5 (Cytotoxin II).; SW:CX5_NAJKA
26Y40H7A.3Y40H7A.3n/achrIV 15,162,987contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
27T08A9.6T08A9.6n/achrX 7,312,318This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29nhr-230Y17D7A.1n/achrV 18,849,704C. elegans NHR-230 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30K11B4.2K11B4.2n/achrI 14,798,156contains similarity to Tetraodon nigroviridis UPF0402 protein.; SW:Q4S3C1
31C14E2.1C14E2.1n/achrX 1,826,905
32str-187F26D10.8n/achrIV 17,266,207C. elegans STR-187 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000539 (Frizzled protein)
33fipr-8C12D8.6n/achrV 10,240,388C. elegans FIPR-8 protein ; contains similarity to Homo sapiens Keratin-associated protein 19-8; ENSEMBL:ENSP00000372272
34srh-72ZC204.5n/achrII 1,639,907C. elegans SRH-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35hap-1ZC395.7n/achrIII 5,264,428C. elegans HAP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01725 Ham1 family contains similarity to Interpro domain IPR002637 (Ham1-like protein)
36srh-17C47E8.2n/achrV 14,662,094C. elegans SRH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37T07E3.3T07E3.3n/achrIII 6,904,401contains similarity to Interpro domain IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
38srj-7T28A11.10n/achrV 3,245,861C. elegans SRJ-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39srh-67T21B4.6n/achrII 12,509,457C. elegans SRH-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40F46C3.2F46C3.2n/achrX 11,417,473contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
41M01E5.2M01E5.2n/achrI 13,278,606contains similarity to Pfam domains PF01018 (GTP1/OBG) , PF01926 (GTPase of unknown function) contains similarity to Interpro domains IPR014100 (GTP-binding protein Obg/CgtA), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR006169 (GTP1/OBG subdomain), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG)
42twk-32F53C11.6n/achrV 13,798,574C. elegans TWK-32 protein; contains similarity to Pfam domains PF00041 (Fibronectin type III domain) (2), PF07885 (Ion channel) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR009147 (Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator), IPR013099 (Ion transport 2)
43srh-245F31F4.9n/achrV 655,327C. elegans SRH-245 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44C50F2.2C50F2.2n/achrI 3,885,072contains similarity to Interpro domain IPR002951 (Atrophin)
45srsx-22F38E1.8n/achrV 8,352,357C. elegans SRSX-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46end-3F58E10.5n/achrV 14,015,253end-3 encodes a GATA zinc finger protein, paralogous to end-1, that helps specify mesoendodermal (as opposed to mesectodermal) lineages derived from the E blastomere.
47srd-17Y2H9A.2n/achrV 13,431,663C. elegans SRD-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48unc-40T19B4.7n/achrI 5,685,676The unc-40 gene encodes a netrin receptor that is required to guide dorsal-ventral cell and axon migrations, and is required for correct polarization and migration of the neuroblasts QL and QR.
49F25H8.2F25H8.2n/achrIV 9,933,029contains similarity to Pfam domain PF05492 NAF1 domain contains similarity to Interpro domain IPR008696 (NAF1)
50ces-1F43G9.11n/achrI 8,634,989ces-1 encodes a C2H2-type zinc finger transcription factor that is a member of the Snail family of proteins that includes Drosophila Scratch, Snail, and Slug, and human SNAIL and SLUG; although the normal function of CES-1 is not fully understood, gain-of-function mutations indicate that CES-1 can function as a transcriptional repressor that blocks programmed cell death in specific neurons by inhibiting expression of the cell-death activator EGL-1; in regulating EGL-1 expression, CES-1 appears to antagonize the transcriptional activity of the bHLH proteins, HLH-2 and HLH-3; despite its cell-type specific role in apoptosis, CES-1 expression is reportedly detected in many embryonic nuclei from the 100-cell stage of embryogenesis through the beginning of morphogenesis, with some CES-1 expression remaining at later embryonic stages; genetic studies indicate that CES-1 is negatively regulated by the bZIP transcription factor CES-2, which can bind CES-1 upstream sequences in vitro and thus may directly regulate CES-1 transcription in vivo